More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2192 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_2192  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
437 aa  863    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.111626  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  28.78 
 
 
406 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  28.01 
 
 
411 aa  145  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  30.75 
 
 
401 aa  140  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  31.08 
 
 
400 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  27.08 
 
 
414 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 
409 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 
406 aa  138  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.58 
 
 
400 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  34.83 
 
 
440 aa  136  9e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  30.75 
 
 
411 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 
404 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.82 
 
 
407 aa  130  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  30.67 
 
 
408 aa  129  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 
415 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.26 
 
 
409 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  30.15 
 
 
405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  30.15 
 
 
405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  30.95 
 
 
407 aa  120  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 
400 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  28.67 
 
 
416 aa  117  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  29.83 
 
 
420 aa  113  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  29.83 
 
 
420 aa  113  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 
430 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  31.19 
 
 
410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  29.53 
 
 
426 aa  111  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  33.13 
 
 
401 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 
417 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 
426 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
417 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  32.27 
 
 
426 aa  106  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  31.97 
 
 
417 aa  103  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  37.99 
 
 
350 aa  98.2  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 
396 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  27.25 
 
 
406 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  27.25 
 
 
406 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  28.84 
 
 
406 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  28.84 
 
 
406 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  30.67 
 
 
454 aa  95.1  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  25.87 
 
 
407 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  28.57 
 
 
406 aa  94.4  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  29.08 
 
 
410 aa  94  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3184  glycosyl transferase, group 1  30.58 
 
 
400 aa  94  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.845721  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3090  glycosyl transferase, group 1  29.6 
 
 
440 aa  93.6  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
406 aa  93.2  8e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  27.64 
 
 
412 aa  93.2  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  26.12 
 
 
406 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  27.01 
 
 
406 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2658  glycosyl transferase, group 1  27.91 
 
 
406 aa  92.8  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  27.29 
 
 
406 aa  92.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  27.5 
 
 
346 aa  90.9  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  27.05 
 
 
406 aa  90.9  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  26.76 
 
 
406 aa  90.5  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  27.05 
 
 
406 aa  90.5  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  28.46 
 
 
406 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0738  glycosyltransferase-like  27.08 
 
 
443 aa  90.1  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  35.22 
 
 
385 aa  90.1  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  27.47 
 
 
364 aa  89.4  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  29.45 
 
 
360 aa  89.7  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  33.54 
 
 
364 aa  89  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 
364 aa  87.4  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18890  glycosyltransferase  30.03 
 
 
486 aa  87  7e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4597  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 
415 aa  86.7  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 
360 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8172  glycosyl transferase group 1  39.63 
 
 
356 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  24.93 
 
 
386 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 
410 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  35.47 
 
 
415 aa  84.3  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 
425 aa  84.7  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  24.4 
 
 
384 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  31.77 
 
 
346 aa  84.3  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  29.69 
 
 
433 aa  84  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  33.71 
 
 
381 aa  83.2  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  22.91 
 
 
422 aa  83.2  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  24.53 
 
 
411 aa  83.2  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2417  glycosyl transferase group 1  34.8 
 
 
373 aa  82.8  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.267444 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  34.27 
 
 
379 aa  82.4  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  22.87 
 
 
422 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  31.6 
 
 
392 aa  81.3  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 
364 aa  81.3  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  34.27 
 
 
374 aa  80.5  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 
452 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4215  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 
407 aa  80.5  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.728114  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 
394 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0295  hypothetical protein  31.25 
 
 
413 aa  80.1  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0144  glycosyltransferase-like protein  30.49 
 
 
368 aa  80.1  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  31.41 
 
 
374 aa  80.1  0.00000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  28.77 
 
 
452 aa  79.7  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1838  glycosyl transferase group 1  34.08 
 
 
500 aa  79.7  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1432  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.65 
 
 
427 aa  79.3  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.285066  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  36.71 
 
 
368 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  29.88 
 
 
421 aa  79  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.25 
 
 
382 aa  78.6  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  36.41 
 
 
411 aa  78.2  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1807  glycosyl transferase, group 1  36.45 
 
 
456 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  22.65 
 
 
417 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 
404 aa  78.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  33.48 
 
 
467 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  26.13 
 
 
371 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  35.62 
 
 
399 aa  78.2  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>