More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2798 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
425 aa  816    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  42.61 
 
 
417 aa  298  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  43.64 
 
 
422 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  43.64 
 
 
422 aa  297  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  48.09 
 
 
452 aa  295  8e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1993  putative glycosyltransferase  42.44 
 
 
414 aa  268  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00985671  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  39.02 
 
 
416 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  38.28 
 
 
420 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  38.28 
 
 
420 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0738  glycosyltransferase-like  36.83 
 
 
443 aa  192  9e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  36.12 
 
 
410 aa  190  5e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  37.59 
 
 
454 aa  188  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  35.38 
 
 
409 aa  174  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5975  glycosyl transferase group 1  34.17 
 
 
415 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.696902  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  36.03 
 
 
440 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4597  glycosyl transferase group 1  34.56 
 
 
415 aa  168  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  34.89 
 
 
411 aa  167  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  34.83 
 
 
452 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  34.07 
 
 
430 aa  166  9e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  33.25 
 
 
410 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7128  glycosyl transferase group 1  34.17 
 
 
415 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3689  glycosyl transferase, group 1  33.58 
 
 
414 aa  162  7e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.466266  normal  0.187253 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  34.37 
 
 
410 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  36.41 
 
 
426 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7223  glycosyl transferase group 1  37.8 
 
 
413 aa  157  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 
426 aa  153  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.59 
 
 
409 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  35.51 
 
 
417 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  35.12 
 
 
417 aa  149  8e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  36.55 
 
 
904 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  33.01 
 
 
412 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4012  glycosyl transferase group 1  33.91 
 
 
403 aa  142  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6471  glycosyl transferase group 1  39.02 
 
 
405 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214546  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  39.52 
 
 
395 aa  130  6e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  29.68 
 
 
406 aa  129  9.000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  34.96 
 
 
373 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  37.24 
 
 
401 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 
409 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  36.49 
 
 
410 aa  124  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  32.11 
 
 
417 aa  123  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2078  glycosyl transferase, group 1  39.79 
 
 
377 aa  122  9e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  31.49 
 
 
403 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  31.77 
 
 
408 aa  119  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  27.38 
 
 
407 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  25.18 
 
 
414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  39.75 
 
 
770 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 
400 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4215  glycosyl transferase, group 1  31.14 
 
 
407 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.728114  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  34.19 
 
 
378 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  37.12 
 
 
367 aa  114  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  29.47 
 
 
406 aa  113  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.11 
 
 
400 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.01 
 
 
407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  31.34 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3866  glycosyl transferase group 1  32.61 
 
 
1302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.806044  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  32.42 
 
 
401 aa  111  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  32.19 
 
 
400 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  32.11 
 
 
411 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  31.98 
 
 
406 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 
411 aa  110  5e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  35.97 
 
 
395 aa  108  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  26.77 
 
 
419 aa  109  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  39.66 
 
 
409 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 
378 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  30.58 
 
 
407 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  31.34 
 
 
406 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  36.39 
 
 
404 aa  106  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  31.44 
 
 
406 aa  106  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1643  glycosyl transferase group 1  34.54 
 
 
359 aa  106  9e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  31.44 
 
 
406 aa  106  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  38.25 
 
 
389 aa  105  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  30.29 
 
 
404 aa  104  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  28.41 
 
 
364 aa  104  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0017  glycosyl transferase group 1  45.37 
 
 
366 aa  102  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0190487  normal  0.0199927 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  37.02 
 
 
414 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1392  ABC transporter related  30.36 
 
 
654 aa  101  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.760197  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2963  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 
383 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.160992  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  30.05 
 
 
406 aa  100  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  30.05 
 
 
406 aa  100  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3213  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 
383 aa  100  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 
419 aa  99.8  7e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
394 aa  99  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 
387 aa  99.4  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  30.15 
 
 
405 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  40 
 
 
381 aa  98.6  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 
394 aa  98.6  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2658  glycosyl transferase, group 1  29.46 
 
 
406 aa  98.6  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  30.15 
 
 
405 aa  97.4  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  30.12 
 
 
406 aa  97.4  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  29.78 
 
 
360 aa  97.4  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  27.09 
 
 
364 aa  97.1  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  30.96 
 
 
406 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  30.56 
 
 
406 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2192  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 
437 aa  96.7  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.111626  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 
364 aa  96.7  7e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
396 aa  96.3  8e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  33.83 
 
 
388 aa  96.7  8e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  29.15 
 
 
364 aa  96.7  8e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  30.56 
 
 
406 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>