More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1392 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1392  ABC transporter related  100 
 
 
654 aa  1337    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.760197  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2233  ABC transporter related  52 
 
 
250 aa  229  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  44.24 
 
 
238 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  48 
 
 
277 aa  193  7e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  45.66 
 
 
230 aa  193  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4838  ABC transporter related  46.41 
 
 
225 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4589  ABC transporter related protein  45.16 
 
 
225 aa  191  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00504379  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  43.83 
 
 
247 aa  190  5.999999999999999e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0956  ABC transporter related  48.5 
 
 
229 aa  189  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  44.39 
 
 
235 aa  189  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  44.55 
 
 
241 aa  187  5e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  45.13 
 
 
253 aa  186  8e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  45.13 
 
 
253 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  45.16 
 
 
228 aa  185  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  41.94 
 
 
241 aa  185  3e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0229  ABC transporter related  43.23 
 
 
264 aa  185  3e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.772392  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  42.55 
 
 
237 aa  185  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2576  ABC transporter related  41.01 
 
 
222 aa  184  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2478  ABC transporter ATP-binding protein  41.01 
 
 
222 aa  184  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.866087  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3004  ABC transporter ATP-binding protein  41.01 
 
 
222 aa  184  4.0000000000000006e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000190264  hitchhiker  0.00000432285 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0254  ABC transporter related  41.47 
 
 
241 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  37.8 
 
 
657 aa  184  5.0000000000000004e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  42.4 
 
 
241 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1563  ABC transporter related  40.71 
 
 
249 aa  183  8.000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  42.08 
 
 
228 aa  183  8.000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  43.48 
 
 
652 aa  183  8.000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  46.7 
 
 
234 aa  182  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  46.7 
 
 
234 aa  182  1e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  45 
 
 
255 aa  183  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0238  ABC transporter related  46.73 
 
 
223 aa  182  2e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.145385 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  46.83 
 
 
236 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  44.75 
 
 
236 aa  182  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1024  ABC transporter related  45.09 
 
 
234 aa  182  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.306992 
 
 
-
 
NC_002950  PG0685  ABC transporter, ATP-binding protein  48.73 
 
 
219 aa  181  4e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246956 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1330  ABC transporter related  38.79 
 
 
235 aa  181  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.514657  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  46.58 
 
 
239 aa  181  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  45.7 
 
 
222 aa  181  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  45.81 
 
 
228 aa  181  4.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  44.06 
 
 
226 aa  181  4.999999999999999e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2919  ABC transporter related  43.06 
 
 
256 aa  181  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.388484 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  43.5 
 
 
240 aa  181  4.999999999999999e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1667  ABC transporter related  42.47 
 
 
233 aa  180  5.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  45 
 
 
228 aa  180  7e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  42.47 
 
 
233 aa  180  7e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  43.95 
 
 
236 aa  180  8e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  45.75 
 
 
244 aa  180  8e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  45.87 
 
 
230 aa  180  8e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  42.79 
 
 
657 aa  180  8e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  45.05 
 
 
226 aa  180  8e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1061  ABC transporter related  45.62 
 
 
239 aa  179  1e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.691054  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  43.89 
 
 
242 aa  179  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  44.59 
 
 
253 aa  179  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  41.1 
 
 
644 aa  179  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  44.8 
 
 
246 aa  179  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  43.95 
 
 
238 aa  179  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0268  ABC transporter related  52.28 
 
 
277 aa  178  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000875319 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  42.47 
 
 
248 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0747  ABC transporter related  41.36 
 
 
221 aa  179  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  41.1 
 
 
239 aa  179  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  42.47 
 
 
248 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5546  ABC transporter related  39.55 
 
 
224 aa  179  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.361355  hitchhiker  0.00000572537 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  46.4 
 
 
241 aa  179  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1998  ABC transporter related  42.66 
 
 
240 aa  179  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  43.11 
 
 
225 aa  178  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 
221 aa  179  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  45.25 
 
 
222 aa  179  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2044  ABC transporter related  42.66 
 
 
240 aa  179  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  44.55 
 
 
230 aa  178  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  41.28 
 
 
232 aa  178  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  46.4 
 
 
241 aa  178  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04961  ABC transporter ATP-binding protein  45.69 
 
 
228 aa  178  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  43.12 
 
 
232 aa  178  4e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.45 
 
 
647 aa  178  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  41.28 
 
 
228 aa  177  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  42.47 
 
 
241 aa  177  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  43.32 
 
 
230 aa  177  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  45.7 
 
 
252 aa  177  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  46.7 
 
 
242 aa  177  8e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  42.45 
 
 
237 aa  177  8e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2318  ABC transporter related  45.15 
 
 
565 aa  177  8e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  45.25 
 
 
233 aa  176  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2973  ABC transporter related  43.26 
 
 
222 aa  176  9e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  44.64 
 
 
225 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  42.57 
 
 
234 aa  176  9.999999999999999e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  42.04 
 
 
233 aa  176  9.999999999999999e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  42.53 
 
 
240 aa  176  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2042  ABC transporter-related protein  45.41 
 
 
236 aa  176  9.999999999999999e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  43.86 
 
 
656 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  43.33 
 
 
236 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0411  ABC transporter related  46.15 
 
 
287 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  43.41 
 
 
228 aa  175  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1979  ABC transporter related  42.2 
 
 
240 aa  176  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  47.72 
 
 
229 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0433  ATPase  44.16 
 
 
228 aa  175  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.526748  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4849  ABC transporter related  42.99 
 
 
239 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0218  ABC transporter related  46.04 
 
 
231 aa  175  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.489811  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  41.48 
 
 
228 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  41.18 
 
 
229 aa  176  1.9999999999999998e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  40.08 
 
 
260 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  42.01 
 
 
233 aa  175  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>