More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0970 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  100 
 
 
241 aa  486  1e-136  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0254  ABC transporter related  97.07 
 
 
241 aa  470  1e-132  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  91.63 
 
 
241 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1563  ABC transporter related  82.5 
 
 
249 aa  410  1e-114  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  72.4 
 
 
238 aa  310  1e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  49.17 
 
 
682 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  52.91 
 
 
225 aa  248  7e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  51.98 
 
 
682 aa  248  8e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  51.1 
 
 
667 aa  244  9e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  51.1 
 
 
667 aa  244  9e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  53.18 
 
 
656 aa  241  6e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  53.18 
 
 
656 aa  240  1e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  52.89 
 
 
319 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  50.89 
 
 
231 aa  238  6.999999999999999e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  52.27 
 
 
230 aa  237  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  47.52 
 
 
246 aa  237  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  50.22 
 
 
226 aa  236  2e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.91 
 
 
647 aa  236  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  50.68 
 
 
648 aa  235  4e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  50.68 
 
 
648 aa  235  4e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  50.46 
 
 
253 aa  235  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  48.07 
 
 
653 aa  235  5.0000000000000005e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  51.8 
 
 
230 aa  234  7e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  50.46 
 
 
253 aa  234  9e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  50 
 
 
225 aa  233  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  49.15 
 
 
266 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  50.23 
 
 
652 aa  232  3e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  50.64 
 
 
642 aa  232  5e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  49.32 
 
 
228 aa  232  5e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  48.43 
 
 
234 aa  231  7.000000000000001e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  48.43 
 
 
234 aa  231  7.000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  50 
 
 
650 aa  231  8.000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  50 
 
 
649 aa  231  8.000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  51.36 
 
 
240 aa  231  9e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  48.65 
 
 
228 aa  230  1e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  52.63 
 
 
647 aa  230  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  51.83 
 
 
236 aa  230  2e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  48.46 
 
 
232 aa  228  5e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  50.45 
 
 
646 aa  228  5e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  49.1 
 
 
230 aa  228  6e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  52.68 
 
 
225 aa  228  7e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2453  ABC transporter related  50 
 
 
676 aa  228  8e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  51.12 
 
 
657 aa  228  8e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  50.44 
 
 
678 aa  227  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  50.44 
 
 
678 aa  227  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  46.06 
 
 
657 aa  227  1e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  49.78 
 
 
238 aa  227  1e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  50.44 
 
 
678 aa  227  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  51.11 
 
 
656 aa  227  1e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  48.42 
 
 
235 aa  226  2e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  49.58 
 
 
650 aa  226  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  48.9 
 
 
252 aa  226  2e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  50.45 
 
 
286 aa  226  2e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  48.62 
 
 
235 aa  227  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  51.85 
 
 
220 aa  226  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  47.62 
 
 
234 aa  226  3e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  48.02 
 
 
240 aa  226  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  48.42 
 
 
234 aa  225  4e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  49.77 
 
 
252 aa  225  4e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  48.66 
 
 
239 aa  226  4e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  46.02 
 
 
237 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  50 
 
 
644 aa  225  5.0000000000000005e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  50.45 
 
 
254 aa  225  6e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  47.7 
 
 
640 aa  224  6e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0194  hypothetical protein  49.55 
 
 
226 aa  224  7e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000219285  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  49.12 
 
 
653 aa  224  7e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0097  macrolide-specific ABC-type efflux carrier MacB  49.55 
 
 
668 aa  224  7e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  47.86 
 
 
645 aa  224  1e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  47.73 
 
 
658 aa  224  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  47.53 
 
 
657 aa  224  1e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  51.12 
 
 
234 aa  224  1e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1792  ABC transporter, ATP-binding protein  52.25 
 
 
233 aa  223  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1297  ABC transporter related  54 
 
 
652 aa  223  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  49.08 
 
 
229 aa  223  2e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1647  ABC transporter related  51.12 
 
 
226 aa  223  3e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.204823  hitchhiker  0.000330012 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  49.12 
 
 
230 aa  222  3e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2042  ABC transporter-related protein  48.64 
 
 
236 aa  223  3e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  48.46 
 
 
654 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1083  ABC transporter related  50.69 
 
 
240 aa  222  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  47.71 
 
 
255 aa  222  4.9999999999999996e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  49.77 
 
 
646 aa  221  6e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  49.32 
 
 
260 aa  221  6e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  50.68 
 
 
648 aa  221  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  50.68 
 
 
648 aa  221  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  48.66 
 
 
226 aa  221  8e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  50.68 
 
 
648 aa  221  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  47.27 
 
 
643 aa  221  9e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0572  macrolide ABC transporter ATPase/inner membrane protein  50.23 
 
 
665 aa  220  9.999999999999999e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.412698  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  47.16 
 
 
242 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  46.75 
 
 
234 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  50.23 
 
 
236 aa  221  9.999999999999999e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0756  ABC transporter related  51.12 
 
 
226 aa  220  1.9999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.688421  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  48.86 
 
 
228 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  48.26 
 
 
642 aa  220  1.9999999999999999e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4589  ABC transporter related protein  48.86 
 
 
225 aa  219  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00504379  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  47.53 
 
 
228 aa  220  1.9999999999999999e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  48.66 
 
 
226 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  48.42 
 
 
234 aa  219  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  49.77 
 
 
661 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  50.46 
 
 
222 aa  219  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>