More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0103 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  100 
 
 
234 aa  481  1e-135  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  61.09 
 
 
715 aa  287  1e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  60.36 
 
 
224 aa  278  5e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  54.22 
 
 
253 aa  261  6e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  58.11 
 
 
241 aa  259  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  57.01 
 
 
241 aa  257  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  57.01 
 
 
226 aa  255  3e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  57.47 
 
 
242 aa  255  3e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  55.61 
 
 
230 aa  254  7e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  53.02 
 
 
229 aa  254  8e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  58.37 
 
 
230 aa  254  9e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  54.71 
 
 
230 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  56.16 
 
 
253 aa  251  7e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  53.6 
 
 
236 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  54.26 
 
 
235 aa  250  1e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  55.51 
 
 
241 aa  250  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  56.16 
 
 
253 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  52.02 
 
 
247 aa  250  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  56.56 
 
 
228 aa  250  2e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  54.34 
 
 
246 aa  249  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  54.5 
 
 
252 aa  248  5e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0366  ABC-type transport system, ATPase component PhnL  54.09 
 
 
245 aa  248  5e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  51.13 
 
 
242 aa  248  6e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  55.86 
 
 
244 aa  248  8e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  53.81 
 
 
241 aa  247  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  52.47 
 
 
230 aa  247  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  54.3 
 
 
238 aa  246  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3037  ABC transporter-related protein  56.11 
 
 
241 aa  246  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000724399  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  52.94 
 
 
229 aa  246  2e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  53.85 
 
 
238 aa  244  8e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2919  ABC transporter related  53.18 
 
 
256 aa  243  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.388484 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  53.81 
 
 
225 aa  243  9.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  54.71 
 
 
226 aa  243  9.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  50.22 
 
 
251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  52.47 
 
 
707 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0269  ABC-type transport system, ATP-binding component  52.91 
 
 
227 aa  242  3e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  54.19 
 
 
248 aa  241  7e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  53.39 
 
 
252 aa  241  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  52.42 
 
 
232 aa  239  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  53.6 
 
 
240 aa  240  2e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  50.22 
 
 
277 aa  239  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  52.02 
 
 
224 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  52.02 
 
 
224 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  52.42 
 
 
240 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  52.94 
 
 
228 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  52.49 
 
 
237 aa  239  2.9999999999999997e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  51.52 
 
 
239 aa  239  4e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0747  ABC transporter related  53.39 
 
 
221 aa  239  4e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  52.02 
 
 
224 aa  238  5e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  56.52 
 
 
236 aa  238  5e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  51.57 
 
 
224 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  53.42 
 
 
254 aa  238  6.999999999999999e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  51.57 
 
 
224 aa  238  8e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  51.57 
 
 
224 aa  237  9e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  51.57 
 
 
224 aa  237  9e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  51.57 
 
 
224 aa  237  9e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  53.39 
 
 
248 aa  237  1e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  51.12 
 
 
224 aa  237  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  54.3 
 
 
652 aa  237  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1083  ABC transporter related  50.9 
 
 
240 aa  237  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  51.57 
 
 
224 aa  236  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  52.94 
 
 
260 aa  236  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  48.66 
 
 
250 aa  236  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  51.13 
 
 
236 aa  236  3e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  51.8 
 
 
653 aa  236  3e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  50.23 
 
 
225 aa  235  4e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  48.73 
 
 
244 aa  235  4e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  47.53 
 
 
249 aa  235  5.0000000000000005e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3234  ABC transporter related  54.3 
 
 
227 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0162255  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  51.12 
 
 
224 aa  234  6e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2150  ABC transporter related  52.94 
 
 
242 aa  234  7e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548805  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  49.77 
 
 
228 aa  234  9e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  54.5 
 
 
648 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  53.39 
 
 
222 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  54.5 
 
 
648 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  54.5 
 
 
648 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  54.5 
 
 
648 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  54.5 
 
 
648 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  54.5 
 
 
648 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  51.57 
 
 
642 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  51.13 
 
 
648 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1413  ABC transporter ATPase  53.81 
 
 
233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0816  ABC-type transport system, ATPase component  52.4 
 
 
235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  51.13 
 
 
648 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  51.63 
 
 
241 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  52.04 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  52.04 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  54.05 
 
 
648 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  54.05 
 
 
648 aa  233  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3128  ABC transporter related  48.87 
 
 
248 aa  233  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  51.57 
 
 
228 aa  233  3e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0097  macrolide-specific ABC-type efflux carrier MacB  51.33 
 
 
668 aa  232  3e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  52.47 
 
 
225 aa  232  4.0000000000000004e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  48.18 
 
 
235 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0038  ABC transporter ATP-binding protein  52.94 
 
 
221 aa  231  5e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  48.46 
 
 
237 aa  232  5e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  51.57 
 
 
228 aa  231  5e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  49.33 
 
 
239 aa  231  6e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  49.77 
 
 
291 aa  231  6e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  50 
 
 
234 aa  231  6e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>