More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0816 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0816  ABC-type transport system, ATPase component  100 
 
 		 235 aa  484  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1413  ABC transporter ATPase  80.97 
 
 		 233 aa  359  2e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3186  ABC transporter related  75.66 
 
 		 252 aa  354  6.999999999999999e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3917  ABC transporter related  75.88 
 
 		 232 aa  340  8e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  70.67 
 
 		 238 aa  338  5e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3549  ABC transporter related  75 
 
 		 255 aa  333  2e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1083  ABC transporter related  68.56 
 
 		 240 aa  327  9e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  69.78 
 
 		 236 aa  325  3e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3708  ABC transporter-related protein  73.68 
 
 		 254 aa  318  6e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00747361 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2313  ABC transporter related  73.68 
 
 		 256 aa  317  1e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2824  ABC transporter related  73.68 
 
 		 256 aa  317  1e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.715212  normal  0.546422 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3606  ABC transporter-related protein  67.39 
 
 		 251 aa  307  8e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2150  ABC transporter related  71.36 
 
 		 242 aa  305  6e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2042  ABC transporter-related protein  61.71 
 
 		 236 aa  289  3e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  64.44 
 
 		 233 aa  288  6e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  64.57 
 
 		 233 aa  287  8e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1707  ABC transporter related  64.44 
 
 		 238 aa  287  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1893  ABC transporter related  64.44 
 
 		 238 aa  285  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.472097  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3374  ABC efflux transporter, ATPase subunit  65.37 
 
 		 211 aa  268  5e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  60.27 
 
 		 253 aa  265  4e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  60.27 
 
 		 253 aa  264  7e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  57.33 
 
 		 229 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  57.46 
 
 		 241 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  55.8 
 
 		 242 aa  258  5.0000000000000005e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  56.76 
 
 		 235 aa  256  2e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  57.4 
 
 		 241 aa  256  3e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1167  ABC transporter related  55.31 
 
 		 235 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  55.22 
 
 		 707 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  56.44 
 
 		 225 aa  251  5.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  53.12 
 
 		 236 aa  251  6e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  55.61 
 
 		 241 aa  250  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  60.48 
 
 		 236 aa  249  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3037  ABC transporter-related protein  57.78 
 
 		 241 aa  244  8e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000724399  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  53.78 
 
 		 236 aa  244  9e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  53.15 
 
 		 246 aa  243  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0211  ABC transporter related  56.77 
 
 		 256 aa  243  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  52.65 
 
 		 247 aa  244  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04311  ABC transporter ATP-binding protein  52.68 
 
 		 232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  50.88 
 
 		 266 aa  242  3e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  54.02 
 
 		 253 aa  242  3.9999999999999997e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3234  ABC transporter related  56.95 
 
 		 227 aa  241  5e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0162255  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  55.16 
 
 		 248 aa  241  6e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  53.42 
 
 		 230 aa  241  7e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  52.68 
 
 		 226 aa  241  7.999999999999999e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  53.74 
 
 		 241 aa  241  9e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  52.19 
 
 		 230 aa  241  9e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  53.98 
 
 		 238 aa  241  1e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  53.6 
 
 		 237 aa  240  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  54.46 
 
 		 244 aa  240  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  52.59 
 
 		 240 aa  239  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  52.25 
 
 		 242 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  53.6 
 
 		 225 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  52.47 
 
 		 661 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2919  ABC transporter related  50.9 
 
 		 256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.388484 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  52.4 
 
 		 234 aa  239  4e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0222  ABC transporter related  54.67 
 
 		 247 aa  238  4e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256244  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  52.91 
 
 		 225 aa  238  9e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  52.7 
 
 		 230 aa  238  9e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  53.48 
 
 		 240 aa  237  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  53.33 
 
 		 236 aa  236  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  51.11 
 
 		 228 aa  236  3e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1635  ABC transporter related  52.02 
 
 		 229 aa  235  4e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  54.67 
 
 		 252 aa  235  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  54.26 
 
 		 230 aa  235  5.0000000000000005e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3128  ABC transporter related  51.3 
 
 		 248 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  52.97 
 
 		 259 aa  235  6e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4838  ABC transporter related  50.67 
 
 		 225 aa  234  6e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  50.85 
 
 		 260 aa  234  9e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3270  ABC transporter-like protein  53.48 
 
 		 248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.180128 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  52.7 
 
 		 239 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  53.15 
 
 		 226 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  47.3 
 
 		 229 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  51.5 
 
 		 249 aa  233  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  51.98 
 
 		 233 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  53.1 
 
 		 277 aa  233  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  53.78 
 
 		 228 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  52.84 
 
 		 254 aa  232  4.0000000000000004e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  54.46 
 
 		 238 aa  232  4.0000000000000004e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  53.15 
 
 		 226 aa  232  5e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  50.93 
 
 		 235 aa  231  5e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  50 
 
 		 228 aa  232  5e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  52.7 
 
 		 224 aa  231  5e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  50.45 
 
 		 244 aa  232  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  52.25 
 
 		 224 aa  231  6e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  51.8 
 
 		 224 aa  231  6e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  52.25 
 
 		 224 aa  231  6e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  48.47 
 
 		 230 aa  231  6e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04961  ABC transporter ATP-binding protein  53.24 
 
 		 228 aa  231  6e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  52.7 
 
 		 226 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  52.7 
 
 		 226 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  52.7 
 
 		 226 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  52.7 
 
 		 226 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  52.7 
 
 		 226 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  52.7 
 
 		 226 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  52.25 
 
 		 224 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04881  ABC transporter ATP-binding protein  50.89 
 
 		 235 aa  231  7.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  51.8 
 
 		 228 aa  231  7.000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4849  ABC transporter related  49.57 
 
 		 239 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06281  ABC transporter ATP-binding protein  52.44 
 
 		 246 aa  231  9e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0807317 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  52.7 
 
 		 226 aa  231  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>