More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3708 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3708  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 254 aa  511  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00747361 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  72.17 
 
 		 238 aa  345  5e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3549  ABC transporter related  77.88 
 
 		 255 aa  344  7e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3186  ABC transporter related  73.89 
 
 		 252 aa  342  2e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3917  ABC transporter related  79.37 
 
 		 232 aa  333  2e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2313  ABC transporter related  75.1 
 
 		 256 aa  332  4e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2824  ABC transporter related  75.1 
 
 		 256 aa  332  4e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.715212  normal  0.546422 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  67.8 
 
 		 236 aa  319  3e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1083  ABC transporter related  69.78 
 
 		 240 aa  319  3e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0816  ABC-type transport system, ATPase component  73.68 
 
 		 235 aa  318  3.9999999999999996e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2150  ABC transporter related  73.01 
 
 		 242 aa  317  7.999999999999999e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1413  ABC transporter ATPase  75 
 
 		 233 aa  317  2e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3606  ABC transporter-related protein  71.68 
 
 		 251 aa  309  2e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2042  ABC transporter-related protein  61.06 
 
 		 236 aa  293  2e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  65.22 
 
 		 233 aa  290  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1893  ABC transporter related  63.09 
 
 		 238 aa  288  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.472097  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1707  ABC transporter related  62.66 
 
 		 238 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  65.62 
 
 		 233 aa  288  9e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3374  ABC efflux transporter, ATPase subunit  66.67 
 
 		 211 aa  271  9e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  56.95 
 
 		 242 aa  263  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  58.33 
 
 		 241 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  59.29 
 
 		 253 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  59.29 
 
 		 253 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  55.95 
 
 		 226 aa  257  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  58.22 
 
 		 225 aa  257  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  55.07 
 
 		 226 aa  256  3e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  55.95 
 
 		 226 aa  254  6e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  55.51 
 
 		 226 aa  255  6e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  55.51 
 
 		 226 aa  254  7e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  55.51 
 
 		 226 aa  254  7e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  55.51 
 
 		 226 aa  254  7e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  55.51 
 
 		 226 aa  254  7e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  55.51 
 
 		 226 aa  254  7e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  55.51 
 
 		 226 aa  254  7e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  55.95 
 
 		 226 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  55.51 
 
 		 226 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  56.7 
 
 		 248 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  53.54 
 
 		 247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  57.64 
 
 		 241 aa  252  5.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  56.76 
 
 		 229 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  55.75 
 
 		 244 aa  250  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  55.41 
 
 		 241 aa  249  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  51.3 
 
 		 230 aa  247  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  52.02 
 
 		 242 aa  247  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  54.79 
 
 		 230 aa  246  3e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  51.48 
 
 		 240 aa  245  4e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  52.61 
 
 		 661 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  55.7 
 
 		 707 aa  245  4.9999999999999997e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  54.71 
 
 		 225 aa  244  6.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  52.21 
 
 		 225 aa  244  6.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  54.15 
 
 		 241 aa  244  8e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  49.57 
 
 		 235 aa  244  8e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  55.11 
 
 		 238 aa  244  9e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  52 
 
 		 228 aa  244  9.999999999999999e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  55.02 
 
 		 253 aa  244  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1167  ABC transporter related  54.67 
 
 		 235 aa  244  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2919  ABC transporter related  50.23 
 
 		 256 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.388484 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  54.5 
 
 		 230 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3234  ABC transporter related  59.38 
 
 		 227 aa  243  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0162255  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  54.34 
 
 		 266 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  50.22 
 
 		 251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3270  ABC transporter-like protein  53.78 
 
 		 248 aa  243  3e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.180128 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3037  ABC transporter-related protein  54.39 
 
 		 241 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000724399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  53.98 
 
 		 237 aa  242  5e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  58.48 
 
 		 238 aa  242  5e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  52.02 
 
 		 240 aa  242  5e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  58.96 
 
 		 236 aa  241  6e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  48.51 
 
 		 236 aa  241  6e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  51.11 
 
 		 235 aa  241  7e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  54.87 
 
 		 228 aa  241  7e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  52.7 
 
 		 236 aa  241  7.999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  51.32 
 
 		 228 aa  240  1e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  52.07 
 
 		 715 aa  241  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  52.59 
 
 		 238 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  51.09 
 
 		 233 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0595  ATPase  55.45 
 
 		 228 aa  239  2.9999999999999997e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0833962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  52.63 
 
 		 255 aa  239  4e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1635  ABC transporter related  50.22 
 
 		 229 aa  239  4e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  54.3 
 
 		 230 aa  238  5e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  50.45 
 
 		 226 aa  238  5.999999999999999e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  51.35 
 
 		 246 aa  238  6.999999999999999e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  53.51 
 
 		 644 aa  238  8e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  50.44 
 
 		 260 aa  238  9e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  51.79 
 
 		 236 aa  238  9e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1767  ATPase  53.85 
 
 		 248 aa  237  1e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.132988  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  47.09 
 
 		 229 aa  237  1e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0211  ABC transporter related  55.02 
 
 		 256 aa  236  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  55.71 
 
 		 252 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  50.22 
 
 		 244 aa  235  6e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3128  ABC transporter related  52.02 
 
 		 248 aa  234  9e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  50.83 
 
 		 277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  50.44 
 
 		 248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  54.55 
 
 		 233 aa  234  1.0000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  52.7 
 
 		 237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  54.05 
 
 		 671 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  48.47 
 
 		 247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  52.84 
 
 		 233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  51.79 
 
 		 239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  50.88 
 
 		 249 aa  233  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8875  ABC transporter-related protein  51.04 
 
 		 243 aa  231  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0534003  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>