More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3374 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3374  ABC efflux transporter, ATPase subunit  100 
 
 		 211 aa  425  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  99.53 
 
 		 233 aa  423  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  92.42 
 
 		 233 aa  391  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3186  ABC transporter related  70.24 
 
 		 252 aa  287  7e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  68.29 
 
 		 236 aa  284  7e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  69.27 
 
 		 238 aa  283  2.0000000000000002e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  67.16 
 
 		 253 aa  275  4e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  67.16 
 
 		 253 aa  274  8e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  67.16 
 
 		 236 aa  274  8e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  65.69 
 
 		 241 aa  271  8.000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1893  ABC transporter related  68.87 
 
 		 238 aa  270  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.472097  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1707  ABC transporter related  68.87 
 
 		 238 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1413  ABC transporter ATPase  68.29 
 
 		 233 aa  269  2e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  62.09 
 
 		 241 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1083  ABC transporter related  65.7 
 
 		 240 aa  268  2.9999999999999997e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2042  ABC transporter-related protein  63.5 
 
 		 236 aa  268  5e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  62.56 
 
 		 241 aa  268  5e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3549  ABC transporter related  68.97 
 
 		 255 aa  268  5e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3917  ABC transporter related  67.14 
 
 		 232 aa  266  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  64.22 
 
 		 229 aa  266  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  61.06 
 
 		 246 aa  263  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3606  ABC transporter-related protein  66.34 
 
 		 251 aa  259  3e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0816  ABC-type transport system, ATPase component  65.37 
 
 		 235 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2150  ABC transporter related  65.2 
 
 		 242 aa  257  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  60.98 
 
 		 235 aa  257  1e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  61.95 
 
 		 255 aa  256  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3708  ABC transporter-related protein  66.67 
 
 		 254 aa  255  4e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00747361 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3037  ABC transporter-related protein  64.56 
 
 		 241 aa  255  4e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000724399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  63.21 
 
 		 253 aa  254  5e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  61.69 
 
 		 235 aa  254  7e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2824  ABC transporter related  68.45 
 
 		 256 aa  253  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.715212  normal  0.546422 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2313  ABC transporter related  68.45 
 
 		 256 aa  253  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  58.71 
 
 		 226 aa  253  1.0000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  60.1 
 
 		 242 aa  253  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3234  ABC transporter related  63.73 
 
 		 227 aa  252  3e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0162255  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  58.71 
 
 		 226 aa  251  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  58.71 
 
 		 226 aa  251  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  58.71 
 
 		 226 aa  251  4.0000000000000004e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  58.71 
 
 		 226 aa  251  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  58.71 
 
 		 226 aa  251  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  61.65 
 
 		 247 aa  251  4.0000000000000004e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  58.71 
 
 		 226 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  58.71 
 
 		 226 aa  251  6e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  58.71 
 
 		 226 aa  251  7e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  58.21 
 
 		 226 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  58.14 
 
 		 242 aa  250  8.000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  58.71 
 
 		 226 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  59.13 
 
 		 238 aa  250  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  58.71 
 
 		 226 aa  249  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  57.14 
 
 		 230 aa  248  3e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  61.54 
 
 		 228 aa  249  3e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  55.81 
 
 		 236 aa  247  8e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0366  ABC-type transport system, ATPase component PhnL  59.43 
 
 		 245 aa  247  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  58.45 
 
 		 230 aa  246  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  58.1 
 
 		 237 aa  246  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  55.92 
 
 		 248 aa  245  3e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  60.29 
 
 		 225 aa  245  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  55.88 
 
 		 240 aa  244  6e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  57.56 
 
 		 236 aa  244  8e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  57.82 
 
 		 653 aa  244  8e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  53.33 
 
 		 229 aa  244  9e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3128  ABC transporter related  59.51 
 
 		 248 aa  243  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  54.81 
 
 		 266 aa  243  9.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  58.17 
 
 		 239 aa  243  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  58.94 
 
 		 248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1167  ABC transporter related  59.9 
 
 		 235 aa  242  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  59.02 
 
 		 225 aa  242  1.9999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  59.43 
 
 		 241 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  59.8 
 
 		 244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  56.59 
 
 		 228 aa  242  3e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0595  ATPase  59.3 
 
 		 228 aa  242  3e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0833962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  58.29 
 
 		 252 aa  241  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2919  ABC transporter related  54.55 
 
 		 256 aa  241  5e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.388484 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  57.92 
 
 		 230 aa  241  6e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  57.07 
 
 		 225 aa  241  6e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  55.39 
 
 		 226 aa  241  7e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  57.42 
 
 		 251 aa  240  9e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  57.07 
 
 		 247 aa  238  2.9999999999999997e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  58.67 
 
 		 224 aa  238  5e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  56.72 
 
 		 248 aa  238  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  56.72 
 
 		 248 aa  238  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  55.88 
 
 		 228 aa  238  5.999999999999999e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  59.31 
 
 		 657 aa  237  1e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  57.84 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  55.88 
 
 		 260 aa  235  3e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  51.43 
 
 		 228 aa  235  4e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  60.29 
 
 		 707 aa  235  4e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  55.56 
 
 		 233 aa  235  4e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  57.35 
 
 		 227 aa  235  4e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  55.66 
 
 		 244 aa  234  5.0000000000000005e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  57.35 
 
 		 237 aa  234  6e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06281  ABC transporter ATP-binding protein  55.39 
 
 		 246 aa  234  7e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0807317 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  58.13 
 
 		 671 aa  233  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  56.31 
 
 		 228 aa  233  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  57.77 
 
 		 249 aa  232  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  54.98 
 
 		 236 aa  232  3e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  55.39 
 
 		 226 aa  232  3e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  53.43 
 
 		 224 aa  232  3e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  57.14 
 
 		 240 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  54.73 
 
 		 259 aa  231  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>