More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2313 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2313  ABC transporter related  100 
 
 
256 aa  520  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2824  ABC transporter related  100 
 
 
256 aa  520  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.715212  normal  0.546422 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3186  ABC transporter related  82.97 
 
 
252 aa  394  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3549  ABC transporter related  86.03 
 
 
255 aa  385  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3708  ABC transporter-related protein  75.1 
 
 
254 aa  348  4e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00747361 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3917  ABC transporter related  77.13 
 
 
232 aa  336  1.9999999999999998e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1083  ABC transporter related  69.96 
 
 
240 aa  335  3.9999999999999995e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0816  ABC-type transport system, ATPase component  73.68 
 
 
235 aa  331  9e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1413  ABC transporter ATPase  75.23 
 
 
233 aa  330  1e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  68.56 
 
 
238 aa  322  5e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  68.86 
 
 
236 aa  318  6e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2150  ABC transporter related  74.12 
 
 
242 aa  318  7e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548805  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3606  ABC transporter-related protein  69.62 
 
 
251 aa  315  4e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1893  ABC transporter related  66.37 
 
 
238 aa  298  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.472097  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1707  ABC transporter related  66.37 
 
 
238 aa  297  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  67.41 
 
 
233 aa  295  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  66.52 
 
 
233 aa  292  4e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2042  ABC transporter-related protein  60.96 
 
 
236 aa  289  3e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3374  ABC efflux transporter, ATPase subunit  68.45 
 
 
211 aa  278  7e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  57.85 
 
 
242 aa  269  4e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  59.46 
 
 
229 aa  263  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  54.27 
 
 
235 aa  260  2e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  59.11 
 
 
253 aa  254  7e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  56.78 
 
 
248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  58.85 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  56.89 
 
 
225 aa  253  3e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  54.11 
 
 
247 aa  252  4.0000000000000004e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  54.15 
 
 
238 aa  252  4.0000000000000004e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  55.32 
 
 
241 aa  251  7e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  57.85 
 
 
241 aa  251  9.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  55.74 
 
 
241 aa  250  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  55.23 
 
 
241 aa  250  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  53.53 
 
 
644 aa  249  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  57.14 
 
 
253 aa  248  5e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  50.88 
 
 
242 aa  248  6e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  52.7 
 
 
246 aa  248  6e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  57.71 
 
 
707 aa  248  7e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  51.8 
 
 
236 aa  248  9e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  53.68 
 
 
249 aa  246  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  53.07 
 
 
236 aa  247  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  55.86 
 
 
230 aa  246  3e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  53.42 
 
 
266 aa  246  3e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  53.7 
 
 
235 aa  246  3e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  53.12 
 
 
225 aa  245  4e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  48.88 
 
 
229 aa  245  6e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  60.19 
 
 
236 aa  244  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  51.27 
 
 
260 aa  244  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3037  ABC transporter-related protein  54.2 
 
 
241 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000724399  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3128  ABC transporter related  53.95 
 
 
248 aa  244  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3234  ABC transporter related  58.48 
 
 
227 aa  244  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0162255  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3270  ABC transporter-like protein  52.61 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.180128 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  53.91 
 
 
240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1167  ABC transporter related  56.76 
 
 
235 aa  243  3e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  52.47 
 
 
230 aa  242  3e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  54.05 
 
 
230 aa  242  3e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  53.3 
 
 
237 aa  243  3e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  51.98 
 
 
240 aa  242  5e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1767  ATPase  54.19 
 
 
248 aa  242  5e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.132988  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  52.65 
 
 
248 aa  241  7e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0211  ABC transporter related  55.51 
 
 
256 aa  241  7.999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  56.31 
 
 
244 aa  240  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  51.25 
 
 
244 aa  239  2.9999999999999997e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  50.88 
 
 
244 aa  239  4e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  54.02 
 
 
237 aa  238  5.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  52.49 
 
 
234 aa  238  8e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  51.93 
 
 
233 aa  238  8e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04311  ABC transporter ATP-binding protein  50.91 
 
 
232 aa  238  8e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  53.98 
 
 
228 aa  237  1e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  54.42 
 
 
252 aa  237  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  50.9 
 
 
226 aa  236  2e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  49.78 
 
 
228 aa  237  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0595  ATPase  55 
 
 
228 aa  236  3e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0833962  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  50.22 
 
 
251 aa  236  4e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  51.34 
 
 
228 aa  235  5.0000000000000005e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  52.02 
 
 
225 aa  235  5.0000000000000005e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  51.11 
 
 
228 aa  235  6e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  50.64 
 
 
236 aa  235  6e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0222  ABC transporter related  55.02 
 
 
247 aa  234  7e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256244  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  51.34 
 
 
226 aa  234  8e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  51.79 
 
 
226 aa  234  9e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  50.83 
 
 
715 aa  234  9e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  52.23 
 
 
226 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  52.23 
 
 
226 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  52.23 
 
 
226 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  52.23 
 
 
226 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  52.23 
 
 
226 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  52.23 
 
 
226 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1635  ABC transporter related  50.88 
 
 
229 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  51.56 
 
 
230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8342  ABC transporter related  57.94 
 
 
234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  52.16 
 
 
252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2919  ABC transporter related  48.92 
 
 
256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.388484 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  51.79 
 
 
226 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  51.79 
 
 
226 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  51.79 
 
 
226 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  51.79 
 
 
226 aa  233  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  51.34 
 
 
224 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  49.55 
 
 
239 aa  231  7.000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  50.67 
 
 
228 aa  231  7.000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4849  ABC transporter related  51.56 
 
 
239 aa  231  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>