More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2776 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  100 
 
 		 240 aa  494  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  61.95 
 
 		 237 aa  287  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  58.44 
 
 		 241 aa  285  4e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  57.2 
 
 		 249 aa  277  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  55.51 
 
 		 241 aa  276  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  57.47 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  54.47 
 
 		 260 aa  275  3e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  55.74 
 
 		 242 aa  275  5e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  56.71 
 
 		 248 aa  273  1.0000000000000001e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  55.11 
 
 		 230 aa  274  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  58.37 
 
 		 226 aa  273  1.0000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  58.82 
 
 		 246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3037  ABC transporter-related protein  58.41 
 
 		 241 aa  272  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000724399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  58.04 
 
 		 253 aa  272  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3128  ABC transporter related  55.74 
 
 		 248 aa  271  5.000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  58.04 
 
 		 253 aa  271  7e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  54.91 
 
 		 228 aa  271  9e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  57.92 
 
 		 229 aa  270  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  55.8 
 
 		 232 aa  268  7e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  56.76 
 
 		 239 aa  268  7e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  56.95 
 
 		 239 aa  266  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  52.52 
 
 		 247 aa  266  2.9999999999999995e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  60.19 
 
 		 236 aa  265  4e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  57.85 
 
 		 233 aa  265  5.999999999999999e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  55.41 
 
 		 241 aa  263  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  58.11 
 
 		 230 aa  263  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  54.46 
 
 		 252 aa  262  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  51.74 
 
 		 240 aa  262  4e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  55.66 
 
 		 244 aa  261  6e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  54.46 
 
 		 248 aa  260  1e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  55.66 
 
 		 236 aa  260  1e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  57.52 
 
 		 235 aa  261  1e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  56.05 
 
 		 228 aa  259  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  53.39 
 
 		 226 aa  259  2e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  57.55 
 
 		 224 aa  259  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  54.26 
 
 		 253 aa  258  4e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  53.3 
 
 		 227 aa  258  6e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  52.21 
 
 		 230 aa  258  8e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  52.65 
 
 		 236 aa  258  9e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  55.41 
 
 		 242 aa  257  1e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  56.95 
 
 		 244 aa  257  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  50.84 
 
 		 251 aa  255  5e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2919  ABC transporter related  49.78 
 
 		 256 aa  254  6e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.388484 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  54.26 
 
 		 277 aa  254  8e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0366  ABC-type transport system, ATPase component PhnL  54.91 
 
 		 245 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  55.07 
 
 		 657 aa  252  3e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  53.49 
 
 		 225 aa  252  4.0000000000000004e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  55.61 
 
 		 228 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  55.61 
 
 		 230 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  54.22 
 
 		 225 aa  251  6e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0211  ABC transporter related  55.31 
 
 		 256 aa  251  8.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  54.22 
 
 		 228 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  51.12 
 
 		 225 aa  250  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  50.21 
 
 		 238 aa  251  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  57.67 
 
 		 255 aa  251  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3234  ABC transporter related  53.81 
 
 		 227 aa  249  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0162255  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  51.72 
 
 		 238 aa  249  3e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  56.31 
 
 		 244 aa  249  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  52.49 
 
 		 230 aa  249  3e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  51.79 
 
 		 233 aa  249  4e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  53.67 
 
 		 248 aa  248  4e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  53.67 
 
 		 248 aa  248  4e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  52.49 
 
 		 224 aa  248  6e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  52 
 
 		 236 aa  248  8e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  52.94 
 
 		 224 aa  247  9e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  52 
 
 		 657 aa  247  9e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  52.49 
 
 		 224 aa  247  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  52.49 
 
 		 224 aa  247  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  52.49 
 
 		 224 aa  247  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  54.67 
 
 		 233 aa  247  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  50.88 
 
 		 234 aa  247  1e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  52.04 
 
 		 224 aa  246  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  50.89 
 
 		 234 aa  247  2e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  50 
 
 		 687 aa  246  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  52.04 
 
 		 224 aa  246  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  52.04 
 
 		 224 aa  246  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  52.04 
 
 		 224 aa  246  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3270  ABC transporter-like protein  51.75 
 
 		 248 aa  246  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.180128 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  55.86 
 
 		 236 aa  245  3e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  52.04 
 
 		 224 aa  245  4e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  50.88 
 
 		 234 aa  245  4e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  48.68 
 
 		 228 aa  245  4e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  53.54 
 
 		 663 aa  245  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  51.56 
 
 		 228 aa  245  4e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  53.51 
 
 		 663 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2215  hypothetical protein  51.75 
 
 		 651 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  52.47 
 
 		 238 aa  245  6e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  51.79 
 
 		 228 aa  245  6e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  51.35 
 
 		 228 aa  244  6.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0222  ABC transporter related  52.38 
 
 		 247 aa  244  8e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256244  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  51.3 
 
 		 237 aa  244  9.999999999999999e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  50.44 
 
 		 266 aa  244  9.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3414  ABC transporter related  49.37 
 
 		 306 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  49.17 
 
 		 681 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  49.17 
 
 		 681 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0305255 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  55.17 
 
 		 707 aa  243  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  51.3 
 
 		 656 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  53.95 
 
 		 235 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  53.02 
 
 		 228 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1635  ABC transporter related  50.89 
 
 		 229 aa  243  3e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>