More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6888 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  100 
 
 
238 aa  487  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  70.14 
 
 
230 aa  326  2.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  66.67 
 
 
240 aa  322  4e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  65.79 
 
 
260 aa  317  9e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  65.49 
 
 
228 aa  316  2e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  66.22 
 
 
226 aa  313  1.9999999999999998e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  64.29 
 
 
236 aa  311  6.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  64.25 
 
 
244 aa  302  3.0000000000000004e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1635  ABC transporter related  62.83 
 
 
229 aa  299  3e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  60.62 
 
 
228 aa  295  4e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  60.18 
 
 
247 aa  295  6e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  60.96 
 
 
248 aa  290  1e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  59.46 
 
 
236 aa  290  1e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  59.46 
 
 
227 aa  288  6e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  60.09 
 
 
233 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  60.18 
 
 
228 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  58.59 
 
 
255 aa  282  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  61.54 
 
 
230 aa  282  3.0000000000000004e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  59.46 
 
 
230 aa  279  2e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  58.41 
 
 
229 aa  277  9e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  58.37 
 
 
246 aa  277  1e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  59.46 
 
 
225 aa  275  4e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  59.62 
 
 
244 aa  271  5.000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  58.37 
 
 
242 aa  271  6e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  57.47 
 
 
228 aa  271  8.000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  55.86 
 
 
224 aa  270  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  57.08 
 
 
253 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  58.56 
 
 
225 aa  270  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  57.08 
 
 
253 aa  269  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  57.01 
 
 
237 aa  268  4e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  57.8 
 
 
228 aa  268  4e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  56.76 
 
 
226 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  56.76 
 
 
226 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  56.76 
 
 
226 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  56.76 
 
 
226 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  54.71 
 
 
242 aa  268  5.9999999999999995e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  56.76 
 
 
226 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  56.88 
 
 
228 aa  268  7e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  57.01 
 
 
291 aa  268  7e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  56 
 
 
237 aa  268  7e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  58.3 
 
 
241 aa  268  8e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4849  ABC transporter related  56.89 
 
 
239 aa  267  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  56.31 
 
 
226 aa  267  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  55.86 
 
 
226 aa  267  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  57.73 
 
 
230 aa  267  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1167  ABC transporter related  58.22 
 
 
235 aa  266  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  55.46 
 
 
238 aa  266  2e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  58.15 
 
 
247 aa  265  2.9999999999999995e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  55.96 
 
 
228 aa  265  4e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  56.11 
 
 
224 aa  265  4e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  55.41 
 
 
226 aa  265  5e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  55.41 
 
 
226 aa  265  5e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  55.8 
 
 
252 aa  265  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  56.31 
 
 
226 aa  265  7e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  55.2 
 
 
224 aa  264  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  55.2 
 
 
224 aa  264  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  55.41 
 
 
226 aa  263  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  53.98 
 
 
288 aa  262  3e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  54.95 
 
 
226 aa  262  3e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  56.95 
 
 
248 aa  262  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  56.95 
 
 
248 aa  262  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  55.2 
 
 
224 aa  261  4.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  55.2 
 
 
224 aa  261  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  55.2 
 
 
224 aa  261  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  55.2 
 
 
224 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  54.75 
 
 
224 aa  261  8e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  56.16 
 
 
235 aa  260  1e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0211  ABC transporter related  57.33 
 
 
256 aa  260  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0199  ABC transporter related  56.95 
 
 
291 aa  260  1e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.500002  normal  0.26855 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  54.3 
 
 
224 aa  260  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  54.95 
 
 
234 aa  260  2e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  54.95 
 
 
234 aa  260  2e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  56.11 
 
 
229 aa  259  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  53.81 
 
 
259 aa  259  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  55.66 
 
 
244 aa  258  4e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  59.33 
 
 
236 aa  258  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  52.19 
 
 
239 aa  258  5.0000000000000005e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  54.75 
 
 
224 aa  258  6e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  51.3 
 
 
233 aa  258  7e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  53.39 
 
 
224 aa  257  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  52.14 
 
 
642 aa  257  1e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  52.19 
 
 
232 aa  257  1e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  56 
 
 
225 aa  257  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  55.16 
 
 
226 aa  257  1e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  54.75 
 
 
239 aa  257  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  55.7 
 
 
230 aa  256  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  54.34 
 
 
266 aa  256  3e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1767  ATPase  53.85 
 
 
248 aa  256  3e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.132988  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  55.16 
 
 
233 aa  255  5e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  55.75 
 
 
236 aa  255  5e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  56 
 
 
236 aa  254  7e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  53.33 
 
 
252 aa  254  8e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8875  ABC transporter-related protein  53.28 
 
 
243 aa  254  8e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0534003  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  55.75 
 
 
240 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04961  ABC transporter ATP-binding protein  54.55 
 
 
228 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0595  ATPase  54.63 
 
 
228 aa  253  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0833962  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  51.58 
 
 
228 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  54.95 
 
 
238 aa  252  5.000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  54.22 
 
 
277 aa  251  7e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3214  ABC transporter related  54.34 
 
 
233 aa  251  8.000000000000001e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.418962  normal  0.11192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>