More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1763 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  100 
 
 
246 aa  501  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  71.78 
 
 
242 aa  373  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  66.53 
 
 
239 aa  335  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  62.4 
 
 
244 aa  323  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  63.4 
 
 
242 aa  309  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  63.72 
 
 
229 aa  308  5e-83  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  63.91 
 
 
248 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  63.56 
 
 
230 aa  305  5.0000000000000004e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  62.9 
 
 
237 aa  301  9e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  64.84 
 
 
230 aa  299  3e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  59.24 
 
 
244 aa  296  2e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  62.9 
 
 
225 aa  295  4e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  63.01 
 
 
230 aa  294  9e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  57.56 
 
 
266 aa  291  9e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  60.55 
 
 
252 aa  289  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  60 
 
 
236 aa  289  3e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  57.78 
 
 
229 aa  288  7e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  58.33 
 
 
248 aa  288  8e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  61.47 
 
 
241 aa  287  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  62.44 
 
 
241 aa  287  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  61.54 
 
 
226 aa  287  1e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  61.99 
 
 
233 aa  286  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  59.07 
 
 
260 aa  286  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  58.99 
 
 
252 aa  286  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  60.81 
 
 
227 aa  285  2.9999999999999996e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  61.54 
 
 
232 aa  285  4e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  57.27 
 
 
248 aa  285  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  61.54 
 
 
239 aa  285  4e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  57.27 
 
 
248 aa  285  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  61.71 
 
 
241 aa  284  8e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  60.35 
 
 
241 aa  283  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  62.44 
 
 
225 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  61.71 
 
 
244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  56.5 
 
 
253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  56.12 
 
 
240 aa  281  7.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  59.19 
 
 
277 aa  281  7.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  59.45 
 
 
259 aa  281  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  59.03 
 
 
236 aa  281  8.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  59.28 
 
 
247 aa  281  8.000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  58.74 
 
 
228 aa  281  8.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  57.33 
 
 
228 aa  281  1e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  58.64 
 
 
233 aa  279  3e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  58.72 
 
 
254 aa  279  3e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  60.36 
 
 
233 aa  278  5e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  56.11 
 
 
224 aa  278  5e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  57.01 
 
 
224 aa  277  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  58.37 
 
 
238 aa  277  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  57.01 
 
 
224 aa  277  1e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  58.56 
 
 
253 aa  277  1e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  58.11 
 
 
228 aa  276  2e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  58.56 
 
 
253 aa  276  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  58.67 
 
 
233 aa  275  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  56.76 
 
 
225 aa  275  6e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  56.56 
 
 
224 aa  275  7e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  56.56 
 
 
224 aa  274  8e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  57.78 
 
 
228 aa  274  9e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  60.79 
 
 
255 aa  274  9e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  58.3 
 
 
230 aa  274  9e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  59.11 
 
 
233 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1635  ABC transporter related  59.01 
 
 
229 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0211  ABC transporter related  61.54 
 
 
256 aa  273  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  59.55 
 
 
234 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  59.55 
 
 
234 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  56.11 
 
 
224 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  56.11 
 
 
224 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  59.65 
 
 
235 aa  273  2.0000000000000002e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  58.82 
 
 
240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  56.11 
 
 
224 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  60.28 
 
 
235 aa  272  3e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0366  ABC-type transport system, ATPase component PhnL  56.44 
 
 
245 aa  272  3e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  59.01 
 
 
228 aa  273  3e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  55.66 
 
 
224 aa  271  5.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  55.66 
 
 
226 aa  270  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  55.2 
 
 
226 aa  271  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  58.72 
 
 
250 aa  270  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  56.56 
 
 
237 aa  270  1e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  55.2 
 
 
224 aa  270  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  55.66 
 
 
226 aa  269  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  55.2 
 
 
226 aa  270  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0222  ABC transporter related  59.01 
 
 
247 aa  269  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256244  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  55.2 
 
 
226 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  55.2 
 
 
226 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  55.2 
 
 
226 aa  270  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  55.2 
 
 
226 aa  270  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  55.2 
 
 
226 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3270  ABC transporter-like protein  58.56 
 
 
248 aa  270  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.180128 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  54.63 
 
 
291 aa  270  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  56 
 
 
240 aa  270  2e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  55.66 
 
 
226 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  55.2 
 
 
224 aa  268  4e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  57.73 
 
 
238 aa  269  4e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3234  ABC transporter related  59.73 
 
 
227 aa  269  4e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0162255  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1024  ABC transporter related  57.53 
 
 
234 aa  268  5e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.306992 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0229  ABC transporter related  57.21 
 
 
264 aa  268  5e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.772392  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  55.2 
 
 
226 aa  268  5e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  57.4 
 
 
236 aa  268  5.9999999999999995e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3037  ABC transporter-related protein  60.35 
 
 
241 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000724399  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  60.29 
 
 
236 aa  267  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  55.91 
 
 
224 aa  266  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  54.75 
 
 
226 aa  266  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>