More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3020 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  100 
 
 
233 aa  467  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3374  ABC efflux transporter, ATPase subunit  99.53 
 
 
211 aa  423  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  90.13 
 
 
233 aa  417  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3186  ABC transporter related  68.28 
 
 
252 aa  310  2e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  66.82 
 
 
238 aa  298  3e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  66.22 
 
 
236 aa  298  6e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  64.6 
 
 
253 aa  293  1e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  64.6 
 
 
253 aa  292  3e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3917  ABC transporter related  66.23 
 
 
232 aa  286  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1707  ABC transporter related  65.81 
 
 
238 aa  286  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1893  ABC transporter related  66.24 
 
 
238 aa  286  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.472097  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1083  ABC transporter related  64 
 
 
240 aa  286  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3549  ABC transporter related  67.26 
 
 
255 aa  286  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1413  ABC transporter ATPase  66.67 
 
 
233 aa  283  1.0000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2042  ABC transporter-related protein  60.73 
 
 
236 aa  280  1e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3606  ABC transporter-related protein  65.33 
 
 
251 aa  279  3e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0816  ABC-type transport system, ATPase component  64.57 
 
 
235 aa  277  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  66.83 
 
 
236 aa  276  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  61.99 
 
 
241 aa  276  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  62.44 
 
 
229 aa  276  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  58.67 
 
 
246 aa  275  3e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  59.21 
 
 
241 aa  275  4e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3708  ABC transporter-related protein  65.22 
 
 
254 aa  275  6e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00747361 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  59.65 
 
 
241 aa  274  8e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2824  ABC transporter related  67.41 
 
 
256 aa  271  8.000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.715212  normal  0.546422 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2313  ABC transporter related  67.41 
 
 
256 aa  271  8.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  61.57 
 
 
253 aa  269  2e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2150  ABC transporter related  62.33 
 
 
242 aa  269  4e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548805  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  58.56 
 
 
235 aa  267  8e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  58.67 
 
 
242 aa  267  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  59.29 
 
 
247 aa  267  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  56.47 
 
 
242 aa  265  5e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  57.02 
 
 
238 aa  264  8e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  58.74 
 
 
255 aa  263  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  56.11 
 
 
226 aa  263  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3037  ABC transporter-related protein  60.89 
 
 
241 aa  261  4.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000724399  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  56.11 
 
 
226 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  56.11 
 
 
226 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  56.11 
 
 
226 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  56.11 
 
 
226 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  56.11 
 
 
226 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  56.11 
 
 
226 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  56.11 
 
 
226 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  56.11 
 
 
226 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  55.51 
 
 
230 aa  261  8e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  57.73 
 
 
235 aa  260  1e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  55.66 
 
 
226 aa  260  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0595  ATPase  58.53 
 
 
228 aa  260  1e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0833962  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  56.11 
 
 
226 aa  260  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  58.33 
 
 
252 aa  259  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  56.11 
 
 
226 aa  260  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  59.56 
 
 
228 aa  259  2e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  56.77 
 
 
653 aa  259  3e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  58.7 
 
 
241 aa  258  5.0000000000000005e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3234  ABC transporter related  61.09 
 
 
227 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0162255  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  56.7 
 
 
230 aa  258  6e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  55.95 
 
 
237 aa  257  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  56 
 
 
239 aa  256  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  57.33 
 
 
248 aa  256  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0366  ABC-type transport system, ATPase component PhnL  57.46 
 
 
245 aa  256  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  52.89 
 
 
266 aa  255  5e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  57.47 
 
 
244 aa  254  7e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  53.45 
 
 
236 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  57.14 
 
 
225 aa  253  1.0000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2919  ABC transporter related  51.5 
 
 
256 aa  253  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.388484 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  57.85 
 
 
225 aa  254  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  54.3 
 
 
240 aa  254  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  55.41 
 
 
236 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  55.86 
 
 
230 aa  252  3e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1167  ABC transporter related  57.08 
 
 
235 aa  252  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  53.51 
 
 
248 aa  252  3e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3128  ABC transporter related  56.25 
 
 
248 aa  252  3e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  55.96 
 
 
248 aa  252  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  55.96 
 
 
248 aa  252  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  54.91 
 
 
225 aa  251  5.000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  59.21 
 
 
707 aa  251  5.000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  53.95 
 
 
233 aa  251  8.000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  50.66 
 
 
229 aa  251  9.000000000000001e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  54.63 
 
 
247 aa  251  9.000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  54.22 
 
 
228 aa  251  1e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  54.08 
 
 
251 aa  249  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  57.85 
 
 
657 aa  249  2e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06281  ABC transporter ATP-binding protein  54.05 
 
 
246 aa  248  4e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0807317 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  54.75 
 
 
260 aa  248  4e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  55.86 
 
 
233 aa  248  5e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  52.94 
 
 
226 aa  248  5e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  55.56 
 
 
224 aa  248  6e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  57.47 
 
 
671 aa  248  8e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  52.94 
 
 
224 aa  247  9e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  56.64 
 
 
644 aa  248  9e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  54.13 
 
 
259 aa  247  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  55.16 
 
 
237 aa  247  1e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  53.85 
 
 
228 aa  246  3e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  55.75 
 
 
227 aa  245  4e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  54.91 
 
 
661 aa  245  4e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  52.94 
 
 
224 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  52.94 
 
 
224 aa  245  6e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  52.94 
 
 
224 aa  245  6e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  52.94 
 
 
224 aa  244  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04311  ABC transporter ATP-binding protein  51.58 
 
 
232 aa  244  8e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>