More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_2042 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_2042  ABC transporter-related protein  100 
 
 
236 aa  484  1e-136  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  64.57 
 
 
236 aa  310  2e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  64.09 
 
 
238 aa  300  1e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3186  ABC transporter related  64.25 
 
 
252 aa  298  4e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1083  ABC transporter related  61.88 
 
 
240 aa  296  2e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1413  ABC transporter ATPase  64.41 
 
 
233 aa  293  1e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3708  ABC transporter-related protein  61.06 
 
 
254 aa  285  4e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00747361 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3917  ABC transporter related  61.84 
 
 
232 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3549  ABC transporter related  62.39 
 
 
255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  61.19 
 
 
233 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  60.73 
 
 
233 aa  280  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3606  ABC transporter-related protein  64.38 
 
 
251 aa  280  1e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0816  ABC-type transport system, ATPase component  61.71 
 
 
235 aa  280  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2150  ABC transporter related  62.16 
 
 
242 aa  278  5e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548805  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2313  ABC transporter related  60.96 
 
 
256 aa  270  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2824  ABC transporter related  60.96 
 
 
256 aa  270  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.715212  normal  0.546422 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3374  ABC efflux transporter, ATPase subunit  63.5 
 
 
211 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1707  ABC transporter related  61.36 
 
 
238 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1893  ABC transporter related  60.91 
 
 
238 aa  262  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.472097  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  56.5 
 
 
235 aa  258  6e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  54.82 
 
 
242 aa  256  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  55.91 
 
 
235 aa  254  8e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  56 
 
 
229 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  56.62 
 
 
247 aa  249  3e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  53.15 
 
 
266 aa  246  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  54.79 
 
 
225 aa  245  4e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  53.88 
 
 
253 aa  245  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  52.97 
 
 
225 aa  244  6e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  53.88 
 
 
253 aa  244  8e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  54.59 
 
 
253 aa  244  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  54.34 
 
 
225 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  52.27 
 
 
230 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  54.95 
 
 
241 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  53.98 
 
 
230 aa  242  3e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  53.85 
 
 
230 aa  242  5e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  52.91 
 
 
248 aa  240  1e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  52.73 
 
 
240 aa  240  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  52.04 
 
 
236 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  52.53 
 
 
242 aa  239  4e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  53.51 
 
 
228 aa  238  4e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  52 
 
 
236 aa  238  5e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  52.86 
 
 
236 aa  237  1e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  50.66 
 
 
246 aa  236  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  56.22 
 
 
236 aa  236  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1451  ABC transporter related  51.07 
 
 
254 aa  236  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.388057  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0229  ABC transporter related  51.82 
 
 
264 aa  235  4e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.772392  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  52.63 
 
 
239 aa  234  6e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  51.98 
 
 
252 aa  234  9e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  51.54 
 
 
248 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  49.09 
 
 
229 aa  233  1.0000000000000001e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  52.84 
 
 
241 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  51.13 
 
 
226 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  52.84 
 
 
241 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  52.04 
 
 
226 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  52.04 
 
 
226 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  52.04 
 
 
226 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  52.04 
 
 
226 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  52.04 
 
 
226 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3270  ABC transporter-like protein  54.79 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.180128 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  52.04 
 
 
226 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0433  ATPase  51.14 
 
 
228 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.526748  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  52.04 
 
 
226 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  52.04 
 
 
226 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  51.58 
 
 
226 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  51.58 
 
 
226 aa  232  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1635  ABC transporter related  51.34 
 
 
229 aa  232  3e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  50.68 
 
 
251 aa  232  3e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  52.49 
 
 
255 aa  232  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  52.73 
 
 
226 aa  233  3e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  53.18 
 
 
244 aa  232  4.0000000000000004e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04581  ABC transporter ATP-binding protein  51.14 
 
 
228 aa  231  6e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  51.8 
 
 
236 aa  231  6e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  47.37 
 
 
230 aa  231  6e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  52.97 
 
 
241 aa  231  6e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  50.45 
 
 
228 aa  231  7.000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  51.58 
 
 
226 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  49.1 
 
 
230 aa  230  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  49.32 
 
 
226 aa  230  1e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2919  ABC transporter related  48.46 
 
 
256 aa  230  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.388484 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04961  ABC transporter ATP-binding protein  52.05 
 
 
228 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  50.45 
 
 
260 aa  229  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0211  ABC transporter related  53.15 
 
 
256 aa  229  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  50.91 
 
 
233 aa  229  4e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  48.64 
 
 
228 aa  229  4e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  50.45 
 
 
228 aa  228  5e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  49.09 
 
 
248 aa  228  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  49.09 
 
 
248 aa  228  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  50.45 
 
 
225 aa  228  6e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  50.68 
 
 
230 aa  228  6e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04891  ABC transporter ATP-binding protein  50.68 
 
 
228 aa  228  7e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04311  ABC transporter ATP-binding protein  48.65 
 
 
232 aa  228  8e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  50.23 
 
 
254 aa  227  1e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  52.16 
 
 
707 aa  227  1e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  50.23 
 
 
234 aa  227  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0329  putative ABC transport system, ATP-binding protein  51.14 
 
 
226 aa  227  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  51.18 
 
 
244 aa  227  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1167  ABC transporter related  51.13 
 
 
235 aa  226  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3234  ABC transporter related  52.97 
 
 
227 aa  226  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0162255  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  51.82 
 
 
291 aa  225  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  49.12 
 
 
249 aa  225  5.0000000000000005e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>