More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0175 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  100 
 
 		 226 aa  459  9.999999999999999e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  76.68 
 
 		 228 aa  365  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  75.89 
 
 		 230 aa  357  9.999999999999999e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  70.09 
 
 		 236 aa  345  4e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  69.78 
 
 		 240 aa  342  2.9999999999999997e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  70.27 
 
 		 260 aa  338  4e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  68.61 
 
 		 244 aa  336  1.9999999999999998e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  66.22 
 
 		 238 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  64.25 
 
 		 248 aa  309  2e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1635  ABC transporter related  61.88 
 
 		 229 aa  300  8.000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  65.14 
 
 		 255 aa  298  3e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  60.09 
 
 		 242 aa  297  7e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  61.99 
 
 		 228 aa  295  3e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  59.56 
 
 		 247 aa  292  2e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  60.09 
 
 		 236 aa  293  2e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  60.18 
 
 		 228 aa  291  5e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  59.64 
 
 		 227 aa  290  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  60.18 
 
 		 233 aa  286  1e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  61.54 
 
 		 246 aa  287  1e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  58.82 
 
 		 239 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  60.55 
 
 		 230 aa  285  4e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  59.46 
 
 		 230 aa  285  5e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  59.19 
 
 		 248 aa  285  5e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  58.82 
 
 		 229 aa  282  3.0000000000000004e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  59.28 
 
 		 225 aa  282  3.0000000000000004e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  58.82 
 
 		 225 aa  281  5.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  58.45 
 
 		 224 aa  281  7.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0211  ABC transporter related  58.37 
 
 		 256 aa  280  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  57.47 
 
 		 237 aa  278  7e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  56.56 
 
 		 228 aa  277  8e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  54.71 
 
 		 291 aa  276  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  57.01 
 
 		 233 aa  275  5e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  58.37 
 
 		 244 aa  275  5e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  55.36 
 
 		 230 aa  274  7e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  60.36 
 
 		 236 aa  274  9e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  55.16 
 
 		 229 aa  273  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  57.33 
 
 		 230 aa  273  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  56.11 
 
 		 224 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  56.11 
 
 		 242 aa  273  1.0000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  59.46 
 
 		 241 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  60.2 
 
 		 244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  56.11 
 
 		 224 aa  272  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  55.41 
 
 		 253 aa  272  3e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  56.11 
 
 		 224 aa  272  3e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  56.11 
 
 		 224 aa  272  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  55.66 
 
 		 224 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  55.41 
 
 		 253 aa  271  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  55.66 
 
 		 224 aa  271  6e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  55.66 
 
 		 224 aa  271  6e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  55.66 
 
 		 224 aa  271  6e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4286  ABC transporter-related protein  58.11 
 
 		 241 aa  271  8.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  58.3 
 
 		 233 aa  270  1e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  55.66 
 
 		 224 aa  270  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  57.01 
 
 		 232 aa  270  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  56.56 
 
 		 239 aa  270  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4155  ABC transporter, ATPase subunit  57.66 
 
 		 241 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4308  ABC transporter related  57.66 
 
 		 241 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  55.16 
 
 		 237 aa  269  2.9999999999999997e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  54.75 
 
 		 224 aa  268  4e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4296  ABC transporter related  58.74 
 
 		 242 aa  268  5e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0438871  normal  0.557698 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  55 
 
 		 288 aa  268  5e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  56.48 
 
 		 259 aa  268  7e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  55.2 
 
 		 224 aa  267  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  55.86 
 
 		 238 aa  267  1e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3128  ABC transporter related  55.61 
 
 		 248 aa  266  2e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  58.1 
 
 		 236 aa  266  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  58.18 
 
 		 250 aa  266  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  55.71 
 
 		 248 aa  265  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  55.71 
 
 		 248 aa  265  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  55.96 
 
 		 228 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  57.85 
 
 		 236 aa  265  4e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1167  ABC transporter related  56.31 
 
 		 235 aa  265  4e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  55.86 
 
 		 247 aa  265  5.999999999999999e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0595  ATPase  56.07 
 
 		 228 aa  264  7e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0833962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  57.47 
 
 		 240 aa  264  7e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  58.18 
 
 		 222 aa  264  8.999999999999999e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0222  ABC transporter related  53.85 
 
 		 247 aa  264  8.999999999999999e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256244  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  54.46 
 
 		 640 aa  264  1e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  54.05 
 
 		 241 aa  263  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  55.05 
 
 		 228 aa  264  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  57.27 
 
 		 235 aa  263  1e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  56.36 
 
 		 266 aa  263  1e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  55.36 
 
 		 238 aa  263  2e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04311  ABC transporter ATP-binding protein  54.13 
 
 		 232 aa  263  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  54.3 
 
 		 226 aa  263  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  56.48 
 
 		 235 aa  262  3e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  54.13 
 
 		 228 aa  262  4e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0229  ABC transporter related  53.6 
 
 		 264 aa  261  4.999999999999999e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.772392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  54.02 
 
 		 249 aa  261  4.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  53.15 
 
 		 241 aa  261  6.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3270  ABC transporter-like protein  52.49 
 
 		 248 aa  260  8.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.180128 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04881  ABC transporter ATP-binding protein  56.68 
 
 		 235 aa  260  1e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  52.7 
 
 		 225 aa  260  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1766  ATPase  56.68 
 
 		 228 aa  260  2e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.104306  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4849  ABC transporter related  53.12 
 
 		 239 aa  260  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0199  ABC transporter related  54.71 
 
 		 291 aa  259  2e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.500002  normal  0.26855 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  53.39 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  53.39 
 
 		 226 aa  259  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  54.46 
 
 		 253 aa  259  3e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  53.39 
 
 		 226 aa  259  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>