More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2202 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  100 
 
 
241 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  95.83 
 
 
241 aa  475  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  77.59 
 
 
241 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3037  ABC transporter-related protein  75.52 
 
 
241 aa  367  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000724399  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  68.72 
 
 
229 aa  328  6e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3234  ABC transporter related  68 
 
 
227 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0162255  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  64.86 
 
 
253 aa  301  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  64.86 
 
 
253 aa  300  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  62.5 
 
 
253 aa  296  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  63.8 
 
 
242 aa  291  5e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  66.19 
 
 
236 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  62.44 
 
 
246 aa  287  9e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  58.74 
 
 
230 aa  280  1e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  60.26 
 
 
236 aa  280  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  56.78 
 
 
238 aa  278  6e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  55.51 
 
 
240 aa  276  1e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  58.82 
 
 
242 aa  277  1e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3128  ABC transporter related  59.82 
 
 
248 aa  276  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  59.21 
 
 
233 aa  275  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  59.56 
 
 
249 aa  275  4e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  59.28 
 
 
237 aa  275  7e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  57.59 
 
 
247 aa  273  3e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  59.82 
 
 
252 aa  271  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  58.56 
 
 
235 aa  271  5.000000000000001e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  59.65 
 
 
233 aa  271  9e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  56 
 
 
228 aa  270  2e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  53.48 
 
 
236 aa  269  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3374  ABC efflux transporter, ATPase subunit  62.09 
 
 
211 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  56.11 
 
 
240 aa  268  5e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  57.01 
 
 
244 aa  268  5e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  55.56 
 
 
230 aa  268  7e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0366  ABC-type transport system, ATPase component PhnL  56.72 
 
 
245 aa  268  8e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  54.75 
 
 
260 aa  267  1e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  60.27 
 
 
241 aa  267  1e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  56.5 
 
 
224 aa  266  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  57.66 
 
 
248 aa  266  2.9999999999999995e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  57.99 
 
 
252 aa  265  5.999999999999999e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  60.56 
 
 
239 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  58.06 
 
 
255 aa  265  5.999999999999999e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  57.85 
 
 
238 aa  265  5.999999999999999e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0222  ABC transporter related  61.99 
 
 
247 aa  263  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256244  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  54.26 
 
 
251 aa  263  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2919  ABC transporter related  54.26 
 
 
256 aa  262  4e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.388484 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  58.67 
 
 
248 aa  262  4e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  56.7 
 
 
226 aa  262  4e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  58.37 
 
 
239 aa  261  4.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  55.04 
 
 
244 aa  262  4.999999999999999e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  61.54 
 
 
230 aa  261  6e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  53.15 
 
 
226 aa  261  8e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  56.62 
 
 
259 aa  260  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  57.47 
 
 
244 aa  260  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  55.86 
 
 
225 aa  259  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  58.72 
 
 
248 aa  259  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  58.72 
 
 
248 aa  259  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  55.36 
 
 
237 aa  259  3e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  53.39 
 
 
230 aa  258  4e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04311  ABC transporter ATP-binding protein  54.75 
 
 
232 aa  258  4e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06281  ABC transporter ATP-binding protein  55.66 
 
 
246 aa  258  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0807317 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  57.33 
 
 
233 aa  258  6e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  56.11 
 
 
225 aa  258  6e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  55.66 
 
 
225 aa  258  8e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  57.01 
 
 
234 aa  257  1e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  54.26 
 
 
236 aa  256  2e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  57.47 
 
 
232 aa  256  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  55.91 
 
 
254 aa  255  5e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1167  ABC transporter related  56.05 
 
 
235 aa  255  6e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  54.75 
 
 
224 aa  254  8e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1766  ATPase  54.05 
 
 
228 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.104306  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  55.61 
 
 
247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  53.85 
 
 
224 aa  252  3e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0595  ATPase  54.91 
 
 
228 aa  252  3e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0833962  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  53.85 
 
 
224 aa  252  3e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  54.02 
 
 
228 aa  253  3e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  53.85 
 
 
224 aa  253  3e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04881  ABC transporter ATP-binding protein  53.6 
 
 
235 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.134366  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  53.39 
 
 
224 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0211  ABC transporter related  58.15 
 
 
256 aa  252  5.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  54.22 
 
 
236 aa  251  7e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  55.2 
 
 
234 aa  251  7e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  55.2 
 
 
234 aa  251  7e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  53.39 
 
 
224 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  53.39 
 
 
224 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  53.39 
 
 
224 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  52.94 
 
 
224 aa  251  9.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  54.05 
 
 
227 aa  250  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  53.85 
 
 
226 aa  250  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1083  ABC transporter related  54.15 
 
 
240 aa  251  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  52.16 
 
 
236 aa  249  2e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  54.75 
 
 
226 aa  249  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  54.75 
 
 
226 aa  249  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  54.75 
 
 
226 aa  249  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  54.75 
 
 
226 aa  249  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  55.2 
 
 
229 aa  249  2e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  54.75 
 
 
226 aa  249  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  54.75 
 
 
226 aa  249  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  54.75 
 
 
228 aa  249  2e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  54.75 
 
 
226 aa  250  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  53.85 
 
 
226 aa  249  3e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  53.62 
 
 
657 aa  249  3e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  57.01 
 
 
230 aa  249  3e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>