More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1173 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
233 aa  474  1e-133  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  78.32 
 
 
239 aa  373  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  78.76 
 
 
232 aa  373  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  61.99 
 
 
246 aa  286  2e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  57.47 
 
 
228 aa  281  5.000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  58.67 
 
 
225 aa  277  1e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  58.22 
 
 
225 aa  276  2e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  56.76 
 
 
230 aa  275  3e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  57.01 
 
 
226 aa  275  5e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  59.19 
 
 
244 aa  273  1.0000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  56.44 
 
 
237 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  57.52 
 
 
248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  57.66 
 
 
239 aa  272  3e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  59.17 
 
 
248 aa  270  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  59.17 
 
 
248 aa  270  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1767  ATPase  55.07 
 
 
248 aa  270  1e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.132988  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  58.11 
 
 
242 aa  270  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  57.66 
 
 
242 aa  270  1e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  55.66 
 
 
224 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  55.66 
 
 
224 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  55.66 
 
 
224 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  56.56 
 
 
224 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  55.66 
 
 
224 aa  268  4e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  55.2 
 
 
224 aa  268  4e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  55.2 
 
 
224 aa  268  5e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  55.2 
 
 
224 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  55.36 
 
 
230 aa  268  5.9999999999999995e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  55.2 
 
 
224 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  59.91 
 
 
230 aa  268  7e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  58.56 
 
 
228 aa  267  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1414  ATPase  57.66 
 
 
241 aa  267  1e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  54.87 
 
 
253 aa  266  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  54.75 
 
 
224 aa  266  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0595  ATPase  56.25 
 
 
228 aa  266  2e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0833962  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  54.87 
 
 
253 aa  266  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  54.75 
 
 
224 aa  265  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  56.47 
 
 
252 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  55.2 
 
 
236 aa  265  2.9999999999999995e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  53.88 
 
 
247 aa  265  4e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  54.3 
 
 
227 aa  265  4e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  53.04 
 
 
233 aa  265  5e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  58.74 
 
 
238 aa  265  5.999999999999999e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  56.96 
 
 
252 aa  265  5.999999999999999e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  57.85 
 
 
240 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  58.11 
 
 
228 aa  264  7e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  54.75 
 
 
236 aa  264  7e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  54.55 
 
 
254 aa  263  1e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  55.66 
 
 
260 aa  264  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  60.09 
 
 
228 aa  264  1e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04961  ABC transporter ATP-binding protein  55.56 
 
 
228 aa  264  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  59.19 
 
 
233 aa  262  3e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  55.41 
 
 
647 aa  263  3e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  58.11 
 
 
228 aa  262  4e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0433  ATPase  55.56 
 
 
228 aa  262  4e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.526748  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  54.42 
 
 
652 aa  262  4e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  55.66 
 
 
236 aa  261  4.999999999999999e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  53.78 
 
 
653 aa  261  4.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  52.7 
 
 
228 aa  261  4.999999999999999e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  56 
 
 
241 aa  261  4.999999999999999e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  56.62 
 
 
259 aa  261  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  54.67 
 
 
226 aa  261  6e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04581  ABC transporter ATP-binding protein  55.56 
 
 
228 aa  261  6e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  52.94 
 
 
240 aa  261  6e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  54.5 
 
 
230 aa  261  6.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  55.11 
 
 
226 aa  261  8e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  55.11 
 
 
226 aa  261  8e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04891  ABC transporter ATP-binding protein  55.56 
 
 
228 aa  261  8e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  55.11 
 
 
226 aa  260  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06281  ABC transporter ATP-binding protein  54.22 
 
 
246 aa  260  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0807317 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  57.78 
 
 
241 aa  259  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  54.22 
 
 
226 aa  259  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  54.22 
 
 
226 aa  259  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  54.22 
 
 
226 aa  259  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  54.22 
 
 
226 aa  259  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  54.67 
 
 
226 aa  259  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  54.22 
 
 
226 aa  259  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0211  ABC transporter related  57.4 
 
 
256 aa  259  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4286  ABC transporter-related protein  58.41 
 
 
241 aa  259  3e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0097  macrolide-specific ABC-type efflux carrier MacB  53.15 
 
 
668 aa  259  3e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4308  ABC transporter related  58.41 
 
 
241 aa  258  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4155  ABC transporter, ATPase subunit  58.41 
 
 
241 aa  258  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2219  ABC transporter related  53.36 
 
 
652 aa  258  4e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  52.91 
 
 
228 aa  259  4e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  57.33 
 
 
241 aa  258  6e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  54.22 
 
 
226 aa  258  6e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  55.86 
 
 
291 aa  258  6e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  51.3 
 
 
238 aa  258  7e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  55.11 
 
 
244 aa  258  7e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  52.65 
 
 
247 aa  258  8e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04311  ABC transporter ATP-binding protein  52.73 
 
 
232 aa  258  8e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  54.67 
 
 
663 aa  257  9e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  53.78 
 
 
226 aa  257  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2453  ABC transporter related  54.91 
 
 
676 aa  257  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  57.14 
 
 
230 aa  257  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  54.02 
 
 
654 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  56.31 
 
 
235 aa  257  1e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  56.42 
 
 
234 aa  256  2e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4296  ABC transporter related  58.22 
 
 
242 aa  256  2e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0438871  normal  0.557698 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  56.42 
 
 
234 aa  256  2e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  56.56 
 
 
255 aa  256  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>