More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0386 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  100 
 
 		 248 aa  505  9.999999999999999e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3128  ABC transporter related  63.16 
 
 		 248 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  61.29 
 
 		 249 aa  320  9.999999999999999e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  57.96 
 
 		 253 aa  296  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  58.33 
 
 		 246 aa  288  8e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  59.19 
 
 		 226 aa  285  5.999999999999999e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  55.6 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  58.15 
 
 		 242 aa  276  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  53.63 
 
 		 260 aa  276  3e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  56.71 
 
 		 240 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  57.39 
 
 		 235 aa  273  2.0000000000000002e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  57.66 
 
 		 253 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  57.21 
 
 		 253 aa  271  9e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  56.76 
 
 		 236 aa  270  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  56.71 
 
 		 230 aa  270  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  55.04 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  55.23 
 
 		 242 aa  270  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  52.92 
 
 		 239 aa  269  4e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  56.64 
 
 		 230 aa  268  4e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  56.76 
 
 		 229 aa  268  5e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  57.66 
 
 		 241 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  57.66 
 
 		 241 aa  268  8e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  55.02 
 
 		 230 aa  266  2e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  57.66 
 
 		 241 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  60.48 
 
 		 236 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  53.12 
 
 		 225 aa  264  8.999999999999999e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  54.5 
 
 		 224 aa  263  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  56.19 
 
 		 225 aa  264  1e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3037  ABC transporter-related protein  58.74 
 
 		 241 aa  262  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000724399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  54.5 
 
 		 224 aa  261  6e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  55.41 
 
 		 228 aa  261  6.999999999999999e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  55.07 
 
 		 228 aa  261  8e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  52.1 
 
 		 237 aa  260  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  54.5 
 
 		 224 aa  260  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  54.5 
 
 		 224 aa  260  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  55.65 
 
 		 255 aa  260  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  54.5 
 
 		 224 aa  260  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  54.05 
 
 		 224 aa  260  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  54.05 
 
 		 224 aa  260  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  54.05 
 
 		 224 aa  259  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0366  ABC-type transport system, ATPase component PhnL  53.68 
 
 		 245 aa  259  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  53.51 
 
 		 227 aa  260  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  53.81 
 
 		 226 aa  259  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  53.6 
 
 		 224 aa  259  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  54.05 
 
 		 224 aa  259  4e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  54.5 
 
 		 224 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  54.42 
 
 		 236 aa  258  6e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  53.36 
 
 		 226 aa  257  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  54.42 
 
 		 225 aa  257  1e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  54.39 
 
 		 228 aa  257  1e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  53.81 
 
 		 226 aa  256  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  53.81 
 
 		 226 aa  256  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  53.81 
 
 		 226 aa  256  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  53.81 
 
 		 226 aa  256  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  53.81 
 
 		 226 aa  256  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  53.81 
 
 		 226 aa  256  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  52.72 
 
 		 244 aa  257  2e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1635  ABC transporter related  54.02 
 
 		 229 aa  256  2e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2919  ABC transporter related  52.89 
 
 		 256 aa  256  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.388484 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  53.81 
 
 		 252 aa  256  3e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1667  ABC transporter related  58.22 
 
 		 233 aa  256  3e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  54.42 
 
 		 228 aa  255  4e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  52.91 
 
 		 226 aa  255  5e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  56.11 
 
 		 224 aa  255  5e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  52.91 
 
 		 226 aa  255  5e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  54.95 
 
 		 233 aa  255  5e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  51.88 
 
 		 248 aa  255  5e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  52.91 
 
 		 233 aa  255  6e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  55.41 
 
 		 244 aa  255  6e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  52.91 
 
 		 226 aa  254  8e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  53.98 
 
 		 239 aa  254  9e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  52.91 
 
 		 226 aa  254  9e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  54.46 
 
 		 247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  53.04 
 
 		 254 aa  254  1.0000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0211  ABC transporter related  55.75 
 
 		 256 aa  252  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  52.82 
 
 		 247 aa  253  3e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  53.51 
 
 		 233 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  52.79 
 
 		 238 aa  252  4.0000000000000004e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  53.04 
 
 		 707 aa  251  6e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  53.33 
 
 		 232 aa  251  7e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  55.66 
 
 		 244 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  53.95 
 
 		 229 aa  250  1e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  53.25 
 
 		 237 aa  250  1e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  51.04 
 
 		 251 aa  250  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  52.17 
 
 		 230 aa  250  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  53.98 
 
 		 236 aa  250  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3234  ABC transporter related  57.21 
 
 		 227 aa  249  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0162255  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  52.99 
 
 		 266 aa  247  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  50.67 
 
 		 653 aa  246  2e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  51.56 
 
 		 236 aa  246  3e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  52.68 
 
 		 226 aa  246  3e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3374  ABC efflux transporter, ATPase subunit  55.92 
 
 		 211 aa  245  4e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0229  ABC transporter related  51.11 
 
 		 264 aa  245  4.9999999999999997e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.772392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  52.23 
 
 		 230 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  51.53 
 
 		 240 aa  243  3e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1083  ABC transporter related  51.33 
 
 		 240 aa  242  3.9999999999999997e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3270  ABC transporter-like protein  54.05 
 
 		 248 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.180128 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4849  ABC transporter related  54.02 
 
 		 239 aa  242  5e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  52.63 
 
 		 233 aa  241  6e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  54.19 
 
 		 234 aa  241  7.999999999999999e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>