More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0229 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0229  ABC transporter related  100 
 
 		 264 aa  543  1e-153  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.772392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1024  ABC transporter related  77.03 
 
 		 234 aa  354  5.999999999999999e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.306992 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  57.21 
 
 		 246 aa  268  5.9999999999999995e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  55.36 
 
 		 239 aa  265  7e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  53.6 
 
 		 226 aa  261  6e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  54.91 
 
 		 237 aa  258  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  55.36 
 
 		 233 aa  258  7e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  54.46 
 
 		 260 aa  257  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  55.61 
 
 		 242 aa  256  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  53.91 
 
 		 229 aa  256  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  51.9 
 
 		 266 aa  256  3e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  53.78 
 
 		 230 aa  256  3e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  56.82 
 
 		 230 aa  256  4e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  54.91 
 
 		 244 aa  255  5e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  54.5 
 
 		 236 aa  255  5e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1635  ABC transporter related  54.5 
 
 		 229 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  53.57 
 
 		 227 aa  253  3e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  55.61 
 
 		 248 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  52.44 
 
 		 228 aa  252  4.0000000000000004e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  54.95 
 
 		 244 aa  251  7e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  51.53 
 
 		 228 aa  251  8.000000000000001e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  52.42 
 
 		 228 aa  251  1e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  53.12 
 
 		 225 aa  249  2e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  54.46 
 
 		 247 aa  250  2e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  52.02 
 
 		 236 aa  250  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  53.36 
 
 		 242 aa  249  4e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  52.89 
 
 		 241 aa  246  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  51.08 
 
 		 230 aa  246  3e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  50.88 
 
 		 225 aa  245  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  52.89 
 
 		 241 aa  245  4.9999999999999997e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  51.8 
 
 		 228 aa  245  4.9999999999999997e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  51.11 
 
 		 248 aa  245  6e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  52.23 
 
 		 225 aa  245  6e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  50.9 
 
 		 230 aa  244  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  54.87 
 
 		 255 aa  244  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  52.42 
 
 		 253 aa  244  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  53.6 
 
 		 232 aa  242  3.9999999999999997e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3128  ABC transporter related  51.79 
 
 		 248 aa  242  5e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  48.43 
 
 		 240 aa  241  6e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4286  ABC transporter-related protein  54.05 
 
 		 241 aa  241  9e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  54.26 
 
 		 235 aa  241  9e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  53.6 
 
 		 234 aa  241  9e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  53.6 
 
 		 234 aa  241  9e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  51.56 
 
 		 241 aa  241  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  50.45 
 
 		 233 aa  240  1e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4308  ABC transporter related  54.05 
 
 		 241 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  50.65 
 
 		 238 aa  241  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4155  ABC transporter, ATPase subunit  54.05 
 
 		 241 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  52.86 
 
 		 239 aa  240  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0211  ABC transporter related  56 
 
 		 256 aa  239  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  49.12 
 
 		 228 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  58.94 
 
 		 236 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  51.54 
 
 		 236 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  51.34 
 
 		 240 aa  238  5e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  54.67 
 
 		 253 aa  238  9e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  52 
 
 		 241 aa  237  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  54.67 
 
 		 253 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  50.21 
 
 		 235 aa  237  2e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  51.6 
 
 		 248 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  51.57 
 
 		 233 aa  236  3e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  51.6 
 
 		 248 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2042  ABC transporter-related protein  51.82 
 
 		 236 aa  235  5.0000000000000005e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  52.38 
 
 		 228 aa  235  6e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0318  ABC transporter related  52.97 
 
 		 229 aa  234  9e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  50.22 
 
 		 228 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  50.46 
 
 		 240 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  50.67 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1167  ABC transporter related  54.5 
 
 		 235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  51.54 
 
 		 236 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  50.88 
 
 		 228 aa  233  3e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  54.5 
 
 		 291 aa  232  5e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04581  ABC transporter ATP-binding protein  51.13 
 
 		 228 aa  232  5e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  50 
 
 		 224 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  52.02 
 
 		 238 aa  231  9e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  50.66 
 
 		 657 aa  231  1e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3037  ABC transporter-related protein  52.44 
 
 		 241 aa  231  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000724399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1083  ABC transporter related  52.23 
 
 		 240 aa  231  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1451  ABC transporter related  53.6 
 
 		 254 aa  231  1e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.388057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3234  ABC transporter related  52.44 
 
 		 227 aa  231  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0162255  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06281  ABC transporter ATP-binding protein  52.34 
 
 		 246 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0807317 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  49.09 
 
 		 252 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4296  ABC transporter related  54.05 
 
 		 242 aa  229  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0438871  normal  0.557698 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3270  ABC transporter-like protein  52.68 
 
 		 248 aa  230  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.180128 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  50.45 
 
 		 252 aa  230  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0366  ABC-type transport system, ATPase component PhnL  53.78 
 
 		 245 aa  230  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  51.1 
 
 		 250 aa  230  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  49.55 
 
 		 224 aa  229  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  51.95 
 
 		 707 aa  229  3e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04311  ABC transporter ATP-binding protein  51.36 
 
 		 232 aa  229  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  49.55 
 
 		 224 aa  229  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  49.55 
 
 		 224 aa  229  4e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  49.11 
 
 		 244 aa  229  4e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04891  ABC transporter ATP-binding protein  50.68 
 
 		 228 aa  229  4e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0222  ABC transporter related  52.7 
 
 		 247 aa  229  5e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256244  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  49.55 
 
 		 224 aa  229  5e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  48.89 
 
 		 232 aa  228  6e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  50.22 
 
 		 236 aa  228  6e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  46.77 
 
 		 657 aa  228  6e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  48.21 
 
 		 224 aa  228  7e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0433  ATPase  50.68 
 
 		 228 aa  228  9e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.526748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>