More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1893 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1893  ABC transporter related  100 
 
 		 238 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.472097  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1707  ABC transporter related  97.9 
 
 		 238 aa  450  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  67.95 
 
 		 233 aa  308  5e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  67.12 
 
 		 236 aa  307  8e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  64.76 
 
 		 238 aa  307  1.0000000000000001e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3186  ABC transporter related  64.91 
 
 		 252 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  66.24 
 
 		 233 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1083  ABC transporter related  66.37 
 
 		 240 aa  298  5e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3549  ABC transporter related  65.24 
 
 		 255 aa  298  7e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3917  ABC transporter related  67.11 
 
 		 232 aa  290  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1413  ABC transporter ATPase  66.67 
 
 		 233 aa  289  3e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2313  ABC transporter related  66.37 
 
 		 256 aa  289  3e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2824  ABC transporter related  66.37 
 
 		 256 aa  289  3e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.715212  normal  0.546422 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3708  ABC transporter-related protein  63.36 
 
 		 254 aa  287  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00747361 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0816  ABC-type transport system, ATPase component  64.44 
 
 		 235 aa  284  8e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3374  ABC efflux transporter, ATPase subunit  68.87 
 
 		 211 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3606  ABC transporter-related protein  65.02 
 
 		 251 aa  278  4e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2042  ABC transporter-related protein  60.91 
 
 		 236 aa  275  5e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  56.47 
 
 		 242 aa  267  8.999999999999999e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2150  ABC transporter related  62.27 
 
 		 242 aa  264  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  57.02 
 
 		 229 aa  264  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  57.08 
 
 		 235 aa  260  1e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  56.25 
 
 		 230 aa  258  6e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  58.33 
 
 		 253 aa  258  8e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  58.33 
 
 		 253 aa  257  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  56.16 
 
 		 225 aa  257  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  54.26 
 
 		 246 aa  256  2e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  57.6 
 
 		 241 aa  256  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  55.56 
 
 		 241 aa  255  3e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  55.02 
 
 		 225 aa  255  4e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  54.5 
 
 		 242 aa  255  4e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  53.45 
 
 		 241 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1414  ATPase  54.31 
 
 		 241 aa  252  4.0000000000000004e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  55.17 
 
 		 253 aa  251  5.000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  58.11 
 
 		 228 aa  249  4e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  54.09 
 
 		 241 aa  248  5e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  55 
 
 		 236 aa  248  5e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  54.47 
 
 		 239 aa  248  7e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  55.25 
 
 		 225 aa  247  1e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  54.02 
 
 		 230 aa  246  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  53.36 
 
 		 235 aa  246  2e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  53.42 
 
 		 266 aa  246  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  55.02 
 
 		 226 aa  246  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  57.6 
 
 		 224 aa  246  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  55.41 
 
 		 236 aa  245  4e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  56.83 
 
 		 244 aa  245  4.9999999999999997e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  54.09 
 
 		 247 aa  245  6e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  51.95 
 
 		 230 aa  244  6.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2919  ABC transporter related  50.42 
 
 		 256 aa  244  6.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.388484 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  53.39 
 
 		 248 aa  244  6.999999999999999e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  55.02 
 
 		 226 aa  244  8e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  55.02 
 
 		 226 aa  244  8e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  55.02 
 
 		 226 aa  244  8e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  55.02 
 
 		 226 aa  244  8e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3037  ABC transporter-related protein  56.16 
 
 		 241 aa  244  8e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000724399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  55.02 
 
 		 226 aa  244  8e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  55.02 
 
 		 226 aa  244  8e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  52.44 
 
 		 228 aa  244  8e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  55.02 
 
 		 226 aa  244  9e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  55.02 
 
 		 226 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  53.6 
 
 		 248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  55.02 
 
 		 226 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  53.6 
 
 		 248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  54.59 
 
 		 226 aa  242  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  54.59 
 
 		 226 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0595  ATPase  55.25 
 
 		 228 aa  242  5e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0833962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  53.64 
 
 		 228 aa  241  5e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  55.17 
 
 		 707 aa  241  6e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3270  ABC transporter-like protein  54.27 
 
 		 248 aa  241  6e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.180128 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  52.25 
 
 		 226 aa  241  7e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0222  ABC transporter related  54.46 
 
 		 247 aa  241  7e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256244  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  53.6 
 
 		 240 aa  241  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  51.27 
 
 		 251 aa  240  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  54.02 
 
 		 277 aa  240  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8875  ABC transporter-related protein  54.78 
 
 		 243 aa  240  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0534003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  53.74 
 
 		 233 aa  240  2e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  59.52 
 
 		 236 aa  239  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  55.16 
 
 		 248 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  55.25 
 
 		 252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  52.49 
 
 		 259 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  55.36 
 
 		 644 aa  239  2.9999999999999997e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  55.36 
 
 		 238 aa  239  4e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  53.42 
 
 		 252 aa  238  5e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  52.89 
 
 		 260 aa  237  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3234  ABC transporter related  57.99 
 
 		 227 aa  237  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0162255  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  52.97 
 
 		 237 aa  236  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0211  ABC transporter related  56.95 
 
 		 256 aa  236  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  53.33 
 
 		 228 aa  236  2e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  52.7 
 
 		 236 aa  236  2e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  52.23 
 
 		 227 aa  236  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04961  ABC transporter ATP-binding protein  53.24 
 
 		 228 aa  236  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1767  ATPase  53.12 
 
 		 248 aa  236  3e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.132988  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  50.66 
 
 		 228 aa  235  3e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1635  ABC transporter related  51.32 
 
 		 229 aa  235  4e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  52.3 
 
 		 249 aa  235  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  50.66 
 
 		 233 aa  235  5.0000000000000005e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  53.6 
 
 		 240 aa  234  6e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06281  ABC transporter ATP-binding protein  50.67 
 
 		 246 aa  234  6e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0807317 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4849  ABC transporter related  51.74 
 
 		 239 aa  234  9e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3128  ABC transporter related  51.77 
 
 		 248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>