More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3414 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_3414  ABC transporter related  100 
 
 		 306 aa  617  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  100 
 
 		 681 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  99.64 
 
 		 681 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0305255 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  98.3 
 
 		 687 aa  472  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0926  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  78.7 
 
 		 653 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2185  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  78.7 
 
 		 653 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0835  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  78.7 
 
 		 653 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.077145  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  78.26 
 
 		 653 aa  345  7e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  67.98 
 
 		 653 aa  330  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2215  hypothetical protein  68.42 
 
 		 651 aa  330  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2316  ABC transporter related  69.91 
 
 		 648 aa  325  5e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  66.67 
 
 		 652 aa  323  3e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1297  ABC transporter related  72.43 
 
 		 652 aa  321  9.000000000000001e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2832  syringolide efflux protein SyfD  61.45 
 
 		 668 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237626  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  66.38 
 
 		 650 aa  318  6e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  65.35 
 
 		 656 aa  317  1e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  64.91 
 
 		 656 aa  317  2e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2219  ABC transporter related  66.67 
 
 		 652 aa  316  3e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  67.11 
 
 		 653 aa  315  7e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  67.26 
 
 		 650 aa  313  1.9999999999999998e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  65.07 
 
 		 649 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  66.96 
 
 		 648 aa  312  4.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  65.94 
 
 		 678 aa  311  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  65.94 
 
 		 678 aa  311  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  65.94 
 
 		 678 aa  311  1e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  56.07 
 
 		 682 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  65.33 
 
 		 667 aa  309  4e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  65.33 
 
 		 667 aa  309  4e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  64.89 
 
 		 682 aa  309  5e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  64.32 
 
 		 648 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  66.96 
 
 		 648 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  66.96 
 
 		 648 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  66.96 
 
 		 648 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  66.96 
 
 		 648 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  66.82 
 
 		 648 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  64.32 
 
 		 648 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  66.96 
 
 		 648 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  66.96 
 
 		 648 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  66.96 
 
 		 648 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  66.96 
 
 		 648 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2453  ABC transporter related  60.14 
 
 		 676 aa  306  3e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  63.9 
 
 		 648 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  63.9 
 
 		 648 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  65.61 
 
 		 654 aa  301  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1867  ABC transporter related  64.16 
 
 		 655 aa  301  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  64.89 
 
 		 646 aa  300  2e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  65.32 
 
 		 647 aa  299  3e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  65.93 
 
 		 647 aa  298  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  58.95 
 
 		 648 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  58.95 
 
 		 648 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  62.9 
 
 		 646 aa  297  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0562  ABC transporter related  60.26 
 
 		 665 aa  293  4e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0572  macrolide ABC transporter ATPase/inner membrane protein  59.15 
 
 		 665 aa  292  5e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.412698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  62.39 
 
 		 649 aa  291  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  57.89 
 
 		 696 aa  290  2e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  61.95 
 
 		 649 aa  290  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  63.85 
 
 		 647 aa  289  3e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  63.51 
 
 		 661 aa  290  3e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  63.8 
 
 		 671 aa  289  4e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  64.16 
 
 		 663 aa  288  9e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  64.16 
 
 		 663 aa  287  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  63.06 
 
 		 653 aa  286  4e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0097  macrolide-specific ABC-type efflux carrier MacB  64.25 
 
 		 668 aa  285  9e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  63.11 
 
 		 666 aa  283  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  63.68 
 
 		 644 aa  283  3.0000000000000004e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  53.9 
 
 		 645 aa  282  5.000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  56.28 
 
 		 642 aa  282  6.000000000000001e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6202  macrolide ABC transporter ATP-binding/membrane protein  60.53 
 
 		 654 aa  282  6.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.486155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  56.44 
 
 		 642 aa  281  9e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  62.39 
 
 		 654 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  63.68 
 
 		 668 aa  276  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  63.68 
 
 		 668 aa  276  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  59.73 
 
 		 652 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  55.13 
 
 		 640 aa  274  1.0000000000000001e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  60.61 
 
 		 654 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  62.83 
 
 		 657 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2115  ABC transporter related  58.08 
 
 		 647 aa  270  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  63.27 
 
 		 657 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  62.39 
 
 		 656 aa  265  7e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1684  ABC transporter related  62.11 
 
 		 656 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  62.83 
 
 		 654 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  53.48 
 
 		 641 aa  253  2.0000000000000002e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  57.51 
 
 		 651 aa  248  8e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6611  ABC transporter related  58.8 
 
 		 660 aa  248  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.961968 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  51.35 
 
 		 225 aa  247  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  54.26 
 
 		 643 aa  247  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0636  macrolide-specific efflux protein macB  56.67 
 
 		 641 aa  247  2e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00901082  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3236  hypothetical protein  56.76 
 
 		 650 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  55.45 
 
 		 643 aa  245  8e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1063  macrolide-specific efflux protein macB  57.92 
 
 		 641 aa  245  8e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00606621  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  49.37 
 
 		 240 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  52.21 
 
 		 248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  50 
 
 		 225 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  55.71 
 
 		 641 aa  243  3e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  52.49 
 
 		 228 aa  242  6e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  48.89 
 
 		 239 aa  241  1e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  48.66 
 
 		 232 aa  241  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  50.22 
 
 		 230 aa  240  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  48.89 
 
 		 230 aa  238  6.999999999999999e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>