More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1084 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  100 
 
 
234 aa  480  1e-135  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  97.44 
 
 
234 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  96.15 
 
 
234 aa  464  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  83.83 
 
 
235 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  66.52 
 
 
246 aa  322  3e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  67.4 
 
 
252 aa  322  3e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  56.58 
 
 
319 aa  263  1e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  56.62 
 
 
225 aa  263  2e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  57.53 
 
 
225 aa  260  1e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  56.62 
 
 
286 aa  258  4e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  55.91 
 
 
232 aa  256  2e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  51.6 
 
 
252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  53.21 
 
 
248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  53.39 
 
 
234 aa  253  3e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  53.39 
 
 
234 aa  253  3e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  54.34 
 
 
230 aa  251  9.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  54.11 
 
 
236 aa  250  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  50.88 
 
 
240 aa  247  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  52.73 
 
 
246 aa  247  1e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  51.14 
 
 
252 aa  246  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  50.44 
 
 
253 aa  246  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  50.44 
 
 
253 aa  246  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  52.27 
 
 
244 aa  246  3e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  54.79 
 
 
240 aa  244  6.999999999999999e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  52.47 
 
 
230 aa  243  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  49.57 
 
 
235 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  50.45 
 
 
231 aa  242  5e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3270  ABC transporter-like protein  50.68 
 
 
248 aa  241  7e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.180128 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  51.38 
 
 
226 aa  241  7.999999999999999e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2850  hypothetical protein  50.45 
 
 
229 aa  241  9e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  52.73 
 
 
239 aa  241  9e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  48.68 
 
 
228 aa  241  9e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  49.54 
 
 
242 aa  240  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2990  hypothetical protein  50.45 
 
 
229 aa  240  1e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  52.27 
 
 
232 aa  240  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  50.66 
 
 
640 aa  240  2e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  50 
 
 
237 aa  239  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  51.6 
 
 
259 aa  238  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  50.91 
 
 
242 aa  238  5.999999999999999e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  51.32 
 
 
229 aa  238  5.999999999999999e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  54.59 
 
 
228 aa  238  6.999999999999999e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  50.43 
 
 
266 aa  238  8e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  51.36 
 
 
225 aa  237  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  52.51 
 
 
241 aa  237  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  49.32 
 
 
228 aa  236  2e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  49.56 
 
 
642 aa  236  2e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04311  ABC transporter ATP-binding protein  49.1 
 
 
232 aa  236  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  51.36 
 
 
229 aa  236  3e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  53.42 
 
 
255 aa  236  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  49.32 
 
 
715 aa  236  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04961  ABC transporter ATP-binding protein  51.35 
 
 
228 aa  236  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  49.54 
 
 
248 aa  234  6e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  49.54 
 
 
248 aa  234  6e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  52.27 
 
 
240 aa  234  8e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  50.43 
 
 
241 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0211  ABC transporter related  51.36 
 
 
256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04581  ABC transporter ATP-binding protein  49.78 
 
 
228 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50.46 
 
 
258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  50 
 
 
233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  50.45 
 
 
228 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  49.55 
 
 
254 aa  233  2.0000000000000002e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04891  ABC transporter ATP-binding protein  49.78 
 
 
228 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  50.45 
 
 
230 aa  233  3e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  52.78 
 
 
222 aa  233  3e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  50 
 
 
260 aa  232  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  51.14 
 
 
241 aa  232  3e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  50.23 
 
 
230 aa  233  3e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0433  ATPase  50 
 
 
228 aa  232  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.526748  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  48 
 
 
253 aa  232  4.0000000000000004e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  47.95 
 
 
239 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  49.78 
 
 
228 aa  231  5e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  48.43 
 
 
224 aa  231  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  53.18 
 
 
228 aa  230  1e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  48.68 
 
 
228 aa  230  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  50 
 
 
653 aa  230  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  50.45 
 
 
228 aa  231  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4296  ABC transporter related  51.82 
 
 
242 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0438871  normal  0.557698 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3482  ABC transporter related protein  52.29 
 
 
237 aa  230  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.782021  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  50.22 
 
 
241 aa  230  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1635  ABC transporter related  49.1 
 
 
229 aa  230  2e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3234  ABC transporter related  50.22 
 
 
227 aa  230  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0162255  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  49.55 
 
 
247 aa  228  4e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4286  ABC transporter-related protein  49.55 
 
 
241 aa  228  5e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  49.09 
 
 
228 aa  228  6e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0366  ABC-type transport system, ATPase component PhnL  48.87 
 
 
245 aa  228  6e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  50.22 
 
 
656 aa  228  7e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4308  ABC transporter related  49.09 
 
 
241 aa  228  8e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  50 
 
 
291 aa  228  8e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  49.53 
 
 
236 aa  228  8e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4155  ABC transporter, ATPase subunit  49.09 
 
 
241 aa  228  8e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  49.09 
 
 
233 aa  228  9e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  48.64 
 
 
648 aa  227  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  48.64 
 
 
648 aa  227  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  49.33 
 
 
236 aa  226  2e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3037  ABC transporter-related protein  49.14 
 
 
241 aa  227  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000724399  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0194  hypothetical protein  51.36 
 
 
226 aa  226  2e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000219285  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  47.62 
 
 
241 aa  226  3e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  46.7 
 
 
237 aa  226  3e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  49.12 
 
 
228 aa  226  3e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  48.9 
 
 
241 aa  226  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>