More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4838 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4838  ABC transporter related  100 
 
 		 225 aa  466  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4589  ABC transporter related protein  84.89 
 
 		 225 aa  405  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00504379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0956  ABC transporter related  81.17 
 
 		 229 aa  388  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0685  ABC transporter, ATP-binding protein  68.35 
 
 		 219 aa  314  6e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246956 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1330  ABC transporter related  63.84 
 
 		 235 aa  305  5.0000000000000004e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.514657  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  60.99 
 
 		 230 aa  292  3e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0329  putative ABC transport system, ATP-binding protein  60.99 
 
 		 226 aa  287  9e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0471  ABC transporter related  60.27 
 
 		 236 aa  286  2.9999999999999996e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3506  ABC transporter, ATP-binding protein  57.92 
 
 		 238 aa  275  4e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  58.74 
 
 		 234 aa  267  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0080  ABC transporter related  55.41 
 
 		 235 aa  262  4e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4416  ABC transporter, ATP-binding protein  55.66 
 
 		 244 aa  260  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  56.89 
 
 		 240 aa  258  4e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2600  ABC transporter related  58.45 
 
 		 227 aa  256  3e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  55.56 
 
 		 220 aa  254  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  54.09 
 
 		 220 aa  253  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0095  ABC transporter related  53.15 
 
 		 235 aa  251  8.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0308  ABC transporter ATP-binding protein  55.86 
 
 		 237 aa  251  8.000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0332817 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  52.25 
 
 		 225 aa  245  4e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2119  ABC transporter, ATP-binding protein  57.21 
 
 		 241 aa  244  9.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  52.04 
 
 		 230 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0951  ABC transporter related  52.7 
 
 		 234 aa  241  7e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0961  ABC transporter related  53.88 
 
 		 220 aa  241  7.999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000589963  normal  0.143962 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0775  ABC transporter, ATP-binding protein  55.11 
 
 		 243 aa  239  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  51.8 
 
 		 225 aa  238  8e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3501  ABC transporter related  50 
 
 		 241 aa  237  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4898  ABC transporter related  52.97 
 
 		 220 aa  233  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0131171  normal  0.141742 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  51.11 
 
 		 235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  51.35 
 
 		 233 aa  232  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  54.09 
 
 		 238 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  49.1 
 
 		 237 aa  231  6e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  50 
 
 		 653 aa  229  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0282  ABC transporter, ATP-binding protein  50.68 
 
 		 223 aa  229  2e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  49.32 
 
 		 246 aa  229  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  50.45 
 
 		 233 aa  229  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  47.98 
 
 		 230 aa  228  5e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  48.42 
 
 		 236 aa  227  1e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  50.45 
 
 		 236 aa  227  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  47.95 
 
 		 252 aa  227  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3364  ABC transporter related  51.6 
 
 		 243 aa  226  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  50 
 
 		 242 aa  226  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2864  ABC transporter related  51.14 
 
 		 230 aa  226  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  48.85 
 
 		 235 aa  225  4e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  49.55 
 
 		 226 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50.46 
 
 		 258 aa  225  5.0000000000000005e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3004  ABC transporter ATP-binding protein  48.65 
 
 		 222 aa  223  1e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000190264  hitchhiker  0.00000432285 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2576  ABC transporter related  48.65 
 
 		 222 aa  223  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3374  ABC efflux transporter, ATPase subunit  54.19 
 
 		 211 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4072  ABC transporter related  50.23 
 
 		 253 aa  223  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  50 
 
 		 244 aa  223  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  49.77 
 
 		 671 aa  222  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  47.96 
 
 		 266 aa  222  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  47.95 
 
 		 252 aa  222  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2478  ABC transporter ATP-binding protein  48.65 
 
 		 222 aa  223  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.866087  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0723  ABC transporter-related protein  50.23 
 
 		 240 aa  222  3e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0816  ABC-type transport system, ATPase component  50.67 
 
 		 235 aa  222  4e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  49.55 
 
 		 238 aa  222  4e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3722  ABC transporter related  50.23 
 
 		 263 aa  222  4e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.323053 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  47.71 
 
 		 237 aa  222  4e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  48.65 
 
 		 226 aa  221  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  47.09 
 
 		 239 aa  221  7e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  47.53 
 
 		 253 aa  221  7e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  48.2 
 
 		 228 aa  221  8e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1201  ABC transporter related protein  51.14 
 
 		 228 aa  221  8e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  48.66 
 
 		 229 aa  221  8e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  47.96 
 
 		 253 aa  221  8e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  47.09 
 
 		 232 aa  221  8e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3692  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 246 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1031  ABC transporter related  49.77 
 
 		 246 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  48.88 
 
 		 229 aa  220  9.999999999999999e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  49.1 
 
 		 226 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  47.96 
 
 		 661 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0863  ABC transporter related  49.77 
 
 		 246 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3159  ABC transporter related  49.77 
 
 		 246 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  47.96 
 
 		 253 aa  220  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1083  ABC transporter related  47.53 
 
 		 240 aa  220  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3260  ABC transporter related  49.77 
 
 		 246 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  48.61 
 
 		 244 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  48.65 
 
 		 226 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3341  ABC transporter related  49.77 
 
 		 247 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  46.85 
 
 		 238 aa  219  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1019  ABC transporter related  49.77 
 
 		 247 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0998  ABC transporter related  49.77 
 
 		 247 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  48.42 
 
 		 228 aa  219  1.9999999999999999e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0898  ABC transporter related  49.32 
 
 		 232 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  46.19 
 
 		 228 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2239  ABC transporter related  47.69 
 
 		 233 aa  219  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2991  ABC transporter related  49.32 
 
 		 246 aa  219  3e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  48.65 
 
 		 226 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0573  ABC transporter, ATP-binding protein  45.54 
 
 		 253 aa  219  3.9999999999999997e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  48.65 
 
 		 226 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  48.65 
 
 		 226 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  48.65 
 
 		 226 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  48.65 
 
 		 226 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  48.65 
 
 		 226 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  48.87 
 
 		 241 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  47.3 
 
 		 239 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  47.96 
 
 		 241 aa  218  5e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  46.15 
 
 		 230 aa  218  5e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  47.32 
 
 		 241 aa  218  6e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>