More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2810 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  100 
 
 		 715 aa  1448    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  43.09 
 
 		 707 aa  520  1e-146  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  42.86 
 
 		 644 aa  512  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  39.36 
 
 		 658 aa  473  1e-132  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  42.4 
 
 		 653 aa  470  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  39.33 
 
 		 653 aa  472  1.0000000000000001e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  40 
 
 		 657 aa  458  1e-127  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  39.47 
 
 		 657 aa  458  1e-127  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  39.39 
 
 		 652 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  40 
 
 		 671 aa  450  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  38.52 
 
 		 661 aa  444  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  41.02 
 
 		 670 aa  444  1e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  37.99 
 
 		 657 aa  437  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  38.96 
 
 		 654 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0104  protein of unknown function DUF214  50.76 
 
 		 454 aa  433  1e-120  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  39.36 
 
 		 651 aa  435  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  35.52 
 
 		 642 aa  429  1e-119  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  39.7 
 
 		 654 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  38.56 
 
 		 663 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  39.53 
 
 		 654 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  37 
 
 		 647 aa  424  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  36.81 
 
 		 649 aa  423  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  38.6 
 
 		 663 aa  425  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  36.85 
 
 		 656 aa  423  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  37.01 
 
 		 640 aa  422  1e-116  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  36.54 
 
 		 649 aa  421  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.83 
 
 		 656 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2832  syringolide efflux protein SyfD  37.38 
 
 		 668 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237626  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  38.61 
 
 		 657 aa  413  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  37.81 
 
 		 648 aa  415  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  36.23 
 
 		 667 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  36.23 
 
 		 667 aa  412  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  35.65 
 
 		 648 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3236  hypothetical protein  40.56 
 
 		 650 aa  410  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  35.65 
 
 		 648 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  35.63 
 
 		 682 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  34.91 
 
 		 678 aa  403  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  34.54 
 
 		 652 aa  405  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  35.11 
 
 		 682 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.91 
 
 		 678 aa  403  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  34.91 
 
 		 678 aa  403  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2316  ABC transporter related  36.51 
 
 		 648 aa  403  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  36.83 
 
 		 650 aa  404  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  36.48 
 
 		 647 aa  404  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2215  hypothetical protein  36.4 
 
 		 651 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  37.12 
 
 		 666 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  36.02 
 
 		 649 aa  401  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  37.48 
 
 		 646 aa  399  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  37.29 
 
 		 657 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  37.31 
 
 		 656 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  36.49 
 
 		 645 aa  395  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  36.07 
 
 		 646 aa  395  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0097  macrolide-specific ABC-type efflux carrier MacB  35.77 
 
 		 668 aa  394  1e-108  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1684  ABC transporter related  37.62 
 
 		 656 aa  392  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  34.87 
 
 		 653 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  35.39 
 
 		 650 aa  390  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  36.83 
 
 		 648 aa  386  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  36.83 
 
 		 648 aa  387  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  36.38 
 
 		 648 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  35.76 
 
 		 681 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0305255 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  36.83 
 
 		 648 aa  386  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  36.86 
 
 		 653 aa  387  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  36.83 
 
 		 648 aa  386  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  36.97 
 
 		 648 aa  387  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  35.76 
 
 		 681 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  35.71 
 
 		 643 aa  387  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  36.83 
 
 		 648 aa  386  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  36.83 
 
 		 648 aa  386  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  36.38 
 
 		 648 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  35.1 
 
 		 642 aa  384  1e-105  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  35.93 
 
 		 648 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  36.69 
 
 		 648 aa  384  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  36.26 
 
 		 648 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  36.4 
 
 		 648 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  34.59 
 
 		 641 aa  382  1e-104  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  35.29 
 
 		 653 aa  378  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  34.1 
 
 		 696 aa  378  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2185  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  37.52 
 
 		 653 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  35.46 
 
 		 687 aa  378  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1867  ABC transporter related  35.1 
 
 		 655 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0926  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  37 
 
 		 653 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0835  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  37 
 
 		 653 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.077145  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2219  ABC transporter related  34.69 
 
 		 652 aa  376  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2453  ABC transporter related  36.82 
 
 		 676 aa  373  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  36.6 
 
 		 668 aa  373  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  36.6 
 
 		 668 aa  373  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  33.29 
 
 		 643 aa  366  1e-100  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  35.06 
 
 		 654 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  43.39 
 
 		 406 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1297  ABC transporter related  35.48 
 
 		 652 aa  358  2.9999999999999997e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  41.39 
 
 		 406 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  33.89 
 
 		 641 aa  348  2e-94  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0636  macrolide-specific efflux protein macB  33.1 
 
 		 641 aa  345  1e-93  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00901082  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1063  macrolide-specific efflux protein macB  32.55 
 
 		 641 aa  342  2e-92  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00606621  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6611  ABC transporter related  34.97 
 
 		 660 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.961968 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  42.54 
 
 		 409 aa  325  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  42.32 
 
 		 409 aa  323  5e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  42.54 
 
 		 409 aa  323  7e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  39.66 
 
 		 656 aa  322  9.999999999999999e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  38.55 
 
 		 406 aa  320  3.9999999999999996e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>