More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0681 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
222 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  67.27 
 
 
241 aa  316  2e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  67.13 
 
 
240 aa  313  9.999999999999999e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  58.18 
 
 
226 aa  264  8.999999999999999e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  57.87 
 
 
246 aa  263  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  57.4 
 
 
225 aa  252  4.0000000000000004e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  56.05 
 
 
244 aa  251  6e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  53.67 
 
 
230 aa  249  2e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  53.15 
 
 
242 aa  249  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  53.15 
 
 
229 aa  249  3e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  55.56 
 
 
225 aa  247  1e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  54.5 
 
 
230 aa  246  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  55.05 
 
 
230 aa  246  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  50.91 
 
 
230 aa  245  3e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  51.8 
 
 
234 aa  246  3e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  51.8 
 
 
234 aa  246  3e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  54.09 
 
 
236 aa  245  4.9999999999999997e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  54.26 
 
 
248 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  52.78 
 
 
226 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  53.54 
 
 
242 aa  241  5e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  51.14 
 
 
240 aa  241  5e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  53.15 
 
 
228 aa  241  7e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  51.34 
 
 
238 aa  241  7.999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  53.67 
 
 
253 aa  241  9e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  51.83 
 
 
226 aa  240  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  55.05 
 
 
255 aa  240  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  51.85 
 
 
240 aa  240  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  52.75 
 
 
226 aa  240  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  54.79 
 
 
266 aa  239  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  55.3 
 
 
239 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  51.8 
 
 
241 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  51.57 
 
 
237 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
228 aa  238  5e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  52.29 
 
 
226 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  51.8 
 
 
231 aa  238  5.999999999999999e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  52.78 
 
 
235 aa  238  6.999999999999999e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  52.31 
 
 
226 aa  237  8e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  52.31 
 
 
226 aa  237  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  52.31 
 
 
226 aa  237  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  52.31 
 
 
226 aa  237  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  52.31 
 
 
226 aa  237  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  52.31 
 
 
226 aa  237  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  52.02 
 
 
249 aa  237  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  51.82 
 
 
253 aa  237  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  52.29 
 
 
226 aa  237  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  52.31 
 
 
226 aa  237  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0269  ABC-type transport system, ATP-binding component  51.36 
 
 
227 aa  236  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  52.47 
 
 
228 aa  236  2e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  52.25 
 
 
715 aa  236  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  52.07 
 
 
238 aa  236  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  54.91 
 
 
244 aa  236  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  55 
 
 
236 aa  236  3e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  52.75 
 
 
252 aa  235  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  50.23 
 
 
225 aa  236  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  53.7 
 
 
234 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  51.58 
 
 
237 aa  235  5.0000000000000005e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  51.36 
 
 
253 aa  234  6e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1821  ABC transporter-related protein  54.79 
 
 
223 aa  234  6e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.373636  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  50.9 
 
 
228 aa  234  9e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3128  ABC transporter related  50.45 
 
 
248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  53.39 
 
 
234 aa  233  1.0000000000000001e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  50.45 
 
 
228 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  52.78 
 
 
234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  52.07 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0747  ABC transporter related  50.23 
 
 
221 aa  232  3e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  52.31 
 
 
234 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  52.29 
 
 
235 aa  231  5e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  52.94 
 
 
224 aa  231  5e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  53.85 
 
 
228 aa  231  5e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  56.82 
 
 
250 aa  231  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  52.94 
 
 
224 aa  231  5e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  52.27 
 
 
236 aa  231  6e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  51.13 
 
 
291 aa  231  6e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  48.43 
 
 
657 aa  231  7.000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  52.49 
 
 
230 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  50.43 
 
 
260 aa  230  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  51.83 
 
 
648 aa  230  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  51.83 
 
 
648 aa  230  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1024  ABC transporter related  51.61 
 
 
234 aa  231  1e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.306992 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  52.49 
 
 
224 aa  229  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  53 
 
 
246 aa  229  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  51.82 
 
 
225 aa  230  2e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2439  ABC transporter related  54.84 
 
 
280 aa  230  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110449  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  52.04 
 
 
224 aa  229  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  51.13 
 
 
288 aa  229  3e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  52.31 
 
 
230 aa  229  3e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  52.02 
 
 
227 aa  229  3e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  52.04 
 
 
224 aa  229  3e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  50.46 
 
 
241 aa  229  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  48.2 
 
 
244 aa  228  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  52.04 
 
 
224 aa  228  5e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  52.04 
 
 
224 aa  228  5e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  52.04 
 
 
224 aa  228  5e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  52.49 
 
 
224 aa  228  7e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  48.61 
 
 
225 aa  227  9e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0194  hypothetical protein  54.38 
 
 
226 aa  227  9e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000219285  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  50 
 
 
232 aa  227  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  52.49 
 
 
224 aa  227  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  51.85 
 
 
228 aa  227  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  50 
 
 
239 aa  227  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>