More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1821 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1821  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 223 aa  454  1e-127  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.373636  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  65.02 
 
 		 227 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1647  ABC transporter related  65.45 
 
 		 226 aa  305  5.0000000000000004e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.204823  hitchhiker  0.000330012 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0194  hypothetical protein  63.96 
 
 		 226 aa  304  6e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000219285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0756  ABC transporter related  63.35 
 
 		 226 aa  298  4e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.688421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0270  ABC transporter related  62.1 
 
 		 228 aa  286  1e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1025  ABC transporter related  60 
 
 		 223 aa  283  1.0000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490239  normal  0.768066 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1252  ABC transporter related  62.16 
 
 		 234 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.252759 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  62.16 
 
 		 222 aa  281  6.000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  61.99 
 
 		 228 aa  280  2e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  57.73 
 
 		 224 aa  277  1e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0060  ABC transporter related  59.82 
 
 		 232 aa  273  2.0000000000000002e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  53.6 
 
 		 225 aa  252  3e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  54.79 
 
 		 222 aa  234  6e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  53.67 
 
 		 228 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  52.68 
 
 		 241 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  50.68 
 
 		 225 aa  232  3e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  50.67 
 
 		 230 aa  232  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  51.83 
 
 		 228 aa  230  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  50 
 
 		 653 aa  229  3e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  52.05 
 
 		 241 aa  229  3e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  52.05 
 
 		 225 aa  229  3e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  51.13 
 
 		 230 aa  228  4e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  50.23 
 
 		 230 aa  229  4e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  51.58 
 
 		 236 aa  228  6e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  50.91 
 
 		 240 aa  227  9e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  53.18 
 
 		 224 aa  227  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  49.33 
 
 		 235 aa  227  1e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  50.91 
 
 		 248 aa  226  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  51.14 
 
 		 246 aa  226  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  51.61 
 
 		 240 aa  226  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  51.57 
 
 		 234 aa  226  3e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  51.57 
 
 		 234 aa  226  3e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  51.8 
 
 		 244 aa  225  4e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  52.97 
 
 		 291 aa  225  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  47.96 
 
 		 226 aa  225  5.0000000000000005e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  52.51 
 
 		 230 aa  224  9e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  50.46 
 
 		 228 aa  224  9e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 228 aa  223  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  50.23 
 
 		 238 aa  223  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  52.05 
 
 		 228 aa  223  2e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  52.27 
 
 		 224 aa  222  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  52.27 
 
 		 224 aa  222  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  52.27 
 
 		 224 aa  222  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  52.05 
 
 		 224 aa  222  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3128  ABC transporter related  48.88 
 
 		 248 aa  222  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  49.78 
 
 		 248 aa  222  4e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  52.27 
 
 		 224 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  51.82 
 
 		 224 aa  221  7e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  51.82 
 
 		 224 aa  221  7e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  51.82 
 
 		 224 aa  221  7e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3482  ABC transporter related protein  51.82 
 
 		 237 aa  221  8e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.782021  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  51.82 
 
 		 224 aa  221  9e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0199  ABC transporter related  52.91 
 
 		 291 aa  221  9e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.500002  normal  0.26855 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  50.22 
 
 		 266 aa  221  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  50.68 
 
 		 226 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  51.14 
 
 		 226 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  50.68 
 
 		 226 aa  219  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  50.68 
 
 		 226 aa  219  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  50.68 
 
 		 226 aa  219  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  50.68 
 
 		 226 aa  219  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  50.68 
 
 		 226 aa  219  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  51.14 
 
 		 226 aa  219  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  50.68 
 
 		 226 aa  219  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  51.14 
 
 		 226 aa  219  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  48.86 
 
 		 288 aa  219  3.9999999999999997e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  50.68 
 
 		 226 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  50.23 
 
 		 226 aa  218  5e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  49.56 
 
 		 253 aa  218  5e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  48.88 
 
 		 241 aa  218  5e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  49.56 
 
 		 253 aa  218  6e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  51.36 
 
 		 224 aa  218  7e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  50.45 
 
 		 236 aa  218  7.999999999999999e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  49.11 
 
 		 252 aa  217  8.999999999999998e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  48.85 
 
 		 260 aa  217  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  51.58 
 
 		 255 aa  217  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  49.32 
 
 		 253 aa  217  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  52.29 
 
 		 230 aa  217  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  49.33 
 
 		 232 aa  216  2e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  51.79 
 
 		 236 aa  216  2e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  52.07 
 
 		 241 aa  216  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  46.82 
 
 		 232 aa  216  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.98 
 
 		 234 aa  216  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  50.22 
 
 		 242 aa  216  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1024  ABC transporter related  49.09 
 
 		 234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.306992 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  49.31 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  49.54 
 
 		 658 aa  215  4e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  46.82 
 
 		 239 aa  215  4e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  47.49 
 
 		 657 aa  215  4e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  46.88 
 
 		 237 aa  215  4e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  49.09 
 
 		 233 aa  215  5e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  46.58 
 
 		 234 aa  215  5e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  48.85 
 
 		 228 aa  215  5e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  50.89 
 
 		 247 aa  214  5.9999999999999996e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  48.87 
 
 		 244 aa  214  8e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  47.49 
 
 		 656 aa  214  9e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  46.58 
 
 		 234 aa  214  9e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0254  ABC transporter related  46.61 
 
 		 241 aa  214  9e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  47.95 
 
 		 657 aa  214  9e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  46.61 
 
 		 241 aa  213  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>