More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0270 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0270  ABC transporter related  100 
 
 		 228 aa  466  1.0000000000000001e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1252  ABC transporter related  64.32 
 
 		 234 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.252759 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  62.95 
 
 		 228 aa  295  3e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1821  ABC transporter-related protein  62.1 
 
 		 223 aa  286  1e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.373636  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0194  hypothetical protein  61.16 
 
 		 226 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000219285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0060  ABC transporter related  59.73 
 
 		 232 aa  285  4e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1025  ABC transporter related  58.45 
 
 		 223 aa  283  2.0000000000000002e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490239  normal  0.768066 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  60.54 
 
 		 224 aa  280  1e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  61.82 
 
 		 222 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1647  ABC transporter related  57.59 
 
 		 226 aa  270  1e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.204823  hitchhiker  0.000330012 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  58.45 
 
 		 227 aa  267  1e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0756  ABC transporter related  56.95 
 
 		 226 aa  264  8.999999999999999e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.688421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  52.91 
 
 		 225 aa  239  4e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  52.51 
 
 		 228 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  51.33 
 
 		 230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  49.55 
 
 		 225 aa  225  4e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  51.82 
 
 		 241 aa  221  4.9999999999999996e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  50 
 
 		 266 aa  221  7e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  49.55 
 
 		 225 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  51.38 
 
 		 222 aa  219  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  49.55 
 
 		 248 aa  218  3.9999999999999997e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  48.2 
 
 		 239 aa  218  5e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  51.58 
 
 		 236 aa  218  6e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  47.49 
 
 		 246 aa  218  7e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0229  ABC transporter related  46.22 
 
 		 264 aa  217  1e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.772392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  50 
 
 		 230 aa  217  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  49.11 
 
 		 653 aa  217  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  48.42 
 
 		 226 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  47.98 
 
 		 260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  49.11 
 
 		 230 aa  215  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  49.11 
 
 		 228 aa  215  5e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  49.32 
 
 		 228 aa  214  5.9999999999999996e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06281  ABC transporter ATP-binding protein  46.26 
 
 		 246 aa  215  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0807317 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  50 
 
 		 237 aa  214  7e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  50.67 
 
 		 240 aa  214  7e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 252 aa  214  7e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  47.93 
 
 		 242 aa  214  7e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2042  ABC transporter-related protein  51.8 
 
 		 236 aa  214  9.999999999999999e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  47.98 
 
 		 235 aa  213  9.999999999999999e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  48.42 
 
 		 226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  48.42 
 
 		 226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  48.42 
 
 		 226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  48.42 
 
 		 226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  49.12 
 
 		 246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  48.42 
 
 		 226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  48.67 
 
 		 247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  48.42 
 
 		 226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  47.96 
 
 		 226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3186  ABC transporter related  51.1 
 
 		 252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  48.42 
 
 		 226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  47.32 
 
 		 248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  47.96 
 
 		 226 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  48.23 
 
 		 238 aa  212  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  48.67 
 
 		 253 aa  212  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1024  ABC transporter related  46.54 
 
 		 234 aa  212  3.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.306992 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  49.57 
 
 		 238 aa  212  3.9999999999999995e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  47.58 
 
 		 233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  45.74 
 
 		 230 aa  212  4.9999999999999996e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  48.67 
 
 		 253 aa  211  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  47.73 
 
 		 234 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  48.64 
 
 		 230 aa  211  5.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  48.65 
 
 		 226 aa  211  7e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  50.44 
 
 		 232 aa  211  9e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  50.23 
 
 		 240 aa  211  9e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  47.06 
 
 		 228 aa  211  9e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  49.55 
 
 		 229 aa  210  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  47.83 
 
 		 233 aa  211  1e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  49.3 
 
 		 241 aa  210  1e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3128  ABC transporter related  45.91 
 
 		 248 aa  209  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  47.73 
 
 		 235 aa  209  2e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  47.96 
 
 		 242 aa  210  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  47.51 
 
 		 226 aa  209  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  47.73 
 
 		 234 aa  209  3e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  47.51 
 
 		 236 aa  209  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  45.54 
 
 		 240 aa  209  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  48.23 
 
 		 236 aa  208  5e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  45.78 
 
 		 252 aa  208  6e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  47.51 
 
 		 228 aa  207  7e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  47.79 
 
 		 227 aa  207  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  47.14 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  47.96 
 
 		 226 aa  207  1e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1707  ABC transporter related  50.67 
 
 		 238 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  47.06 
 
 		 653 aa  207  1e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  48.65 
 
 		 229 aa  207  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  49.1 
 
 		 286 aa  207  1e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  48.42 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1635  ABC transporter related  48.67 
 
 		 229 aa  206  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1998  ABC transporter related  47.75 
 
 		 240 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  48.18 
 
 		 244 aa  206  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2044  ABC transporter related  47.75 
 
 		 240 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2115  ABC transporter related  47.3 
 
 		 647 aa  206  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  47.09 
 
 		 241 aa  206  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  48.43 
 
 		 225 aa  206  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  47.01 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1893  ABC transporter related  50.22 
 
 		 238 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.472097  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  48.65 
 
 		 241 aa  206  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  47.53 
 
 		 252 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  46.7 
 
 		 644 aa  206  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3501  ABC transporter related  47.49 
 
 		 241 aa  206  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1516  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.12 
 
 		 230 aa  205  4e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00103839  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>