More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0254 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0254  ABC transporter related  100 
 
 		 241 aa  487  1e-137  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  97.07 
 
 		 241 aa  470  1e-132  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  90.04 
 
 		 241 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1563  ABC transporter related  81.93 
 
 		 249 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  71.04 
 
 		 238 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  51.98 
 
 		 682 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  51.98 
 
 		 682 aa  244  9e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  51.57 
 
 		 225 aa  243  3e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  51.1 
 
 		 667 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  51.1 
 
 		 667 aa  240  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  52.27 
 
 		 656 aa  238  8e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  52.27 
 
 		 656 aa  237  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  49.78 
 
 		 226 aa  234  1.0000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  51.36 
 
 		 230 aa  233  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.06 
 
 		 647 aa  232  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  49.55 
 
 		 231 aa  231  6e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  51.56 
 
 		 319 aa  231  7.000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  49.77 
 
 		 648 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  49.77 
 
 		 648 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  49.54 
 
 		 253 aa  231  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  48.9 
 
 		 240 aa  231  8.000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  47.64 
 
 		 653 aa  230  1e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  46.28 
 
 		 246 aa  230  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  49.54 
 
 		 253 aa  230  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  50.9 
 
 		 230 aa  229  2e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  48.43 
 
 		 234 aa  229  3e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  48.72 
 
 		 266 aa  229  3e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  48.43 
 
 		 234 aa  229  3e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  49.79 
 
 		 642 aa  229  4e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  48.4 
 
 		 228 aa  228  6e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  49.11 
 
 		 650 aa  228  6e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  49.55 
 
 		 225 aa  228  6e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  49.09 
 
 		 649 aa  228  7e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  52.63 
 
 		 647 aa  228  8e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  48.62 
 
 		 235 aa  228  9e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  48.2 
 
 		 228 aa  227  1e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  50 
 
 		 646 aa  226  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  51.38 
 
 		 236 aa  226  3e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  51.39 
 
 		 220 aa  226  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 240 aa  226  3e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0194  hypothetical protein  49.33 
 
 		 226 aa  226  3e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000219285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  52.23 
 
 		 225 aa  225  4e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  48.95 
 
 		 650 aa  225  5.0000000000000005e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1647  ABC transporter related  51.57 
 
 		 226 aa  225  5.0000000000000005e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.204823  hitchhiker  0.000330012 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  46.38 
 
 		 657 aa  224  6e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  49.32 
 
 		 234 aa  225  6e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  50.45 
 
 		 657 aa  225  6e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  48.2 
 
 		 230 aa  224  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  50.45 
 
 		 656 aa  224  1e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  48.86 
 
 		 652 aa  223  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2453  ABC transporter related  49.14 
 
 		 676 aa  224  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  50 
 
 		 644 aa  224  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  47.58 
 
 		 232 aa  223  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  47.51 
 
 		 235 aa  223  2e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0756  ABC transporter related  51.12 
 
 		 226 aa  222  3e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.688421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  50.68 
 
 		 236 aa  222  4e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  49.56 
 
 		 678 aa  222  4e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  49.56 
 
 		 678 aa  222  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  49.56 
 
 		 678 aa  222  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  45.13 
 
 		 237 aa  221  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  50.45 
 
 		 286 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  47.27 
 
 		 658 aa  221  6e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  50 
 
 		 254 aa  221  7e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4589  ABC transporter related protein  48.86 
 
 		 225 aa  221  8e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00504379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2042  ABC transporter-related protein  48.64 
 
 		 236 aa  221  9e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  46.32 
 
 		 234 aa  220  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  47.27 
 
 		 643 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1297  ABC transporter related  53.5 
 
 		 652 aa  220  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  48.86 
 
 		 260 aa  220  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  47.44 
 
 		 645 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  48.25 
 
 		 653 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0097  macrolide-specific ABC-type efflux carrier MacB  49.09 
 
 		 668 aa  220  9.999999999999999e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  48.02 
 
 		 252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  47.77 
 
 		 239 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  47.06 
 
 		 234 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  46.67 
 
 		 640 aa  219  3e-56  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0471  ABC transporter related  47.49 
 
 		 236 aa  219  3e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  47.95 
 
 		 228 aa  219  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  51.5 
 
 		 236 aa  219  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  47.25 
 
 		 255 aa  219  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  47.09 
 
 		 657 aa  219  3e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  48.42 
 
 		 252 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  48.43 
 
 		 238 aa  219  5e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  47.83 
 
 		 642 aa  218  6e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  49.55 
 
 		 646 aa  218  6e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  48.17 
 
 		 229 aa  218  6e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  47.58 
 
 		 654 aa  218  7e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  48.25 
 
 		 238 aa  218  7e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  47.79 
 
 		 230 aa  218  7.999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  46.72 
 
 		 242 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  49.55 
 
 		 222 aa  218  8.999999999999998e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1083  ABC transporter related  49.31 
 
 		 240 aa  218  8.999999999999998e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  49.77 
 
 		 648 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  49.54 
 
 		 222 aa  217  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  47.98 
 
 		 248 aa  217  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1867  ABC transporter related  49.76 
 
 		 655 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  49.77 
 
 		 648 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  49.77 
 
 		 648 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2316  ABC transporter related  48.43 
 
 		 648 aa  217  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  49.32 
 
 		 661 aa  218  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>