More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0060 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0060  ABC transporter related  100 
 
 		 232 aa  474  1e-133  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1025  ABC transporter related  81.9 
 
 		 223 aa  380  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490239  normal  0.768066 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1252  ABC transporter related  66.22 
 
 		 234 aa  300  9e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.252759 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  62.27 
 
 		 224 aa  299  3e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0270  ABC transporter related  59.73 
 
 		 228 aa  285  5e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  61.99 
 
 		 228 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  60.45 
 
 		 222 aa  280  1e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1821  ABC transporter-related protein  59.82 
 
 		 223 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.373636  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0756  ABC transporter related  54.75 
 
 		 226 aa  266  1e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.688421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1647  ABC transporter related  54.3 
 
 		 226 aa  266  2e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.204823  hitchhiker  0.000330012 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  56.88 
 
 		 227 aa  260  1e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0194  hypothetical protein  56.16 
 
 		 226 aa  259  2e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000219285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  51.14 
 
 		 225 aa  241  5e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  52.04 
 
 		 228 aa  240  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  50.23 
 
 		 246 aa  226  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3128  ABC transporter related  48.87 
 
 		 248 aa  224  9e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  51.32 
 
 		 240 aa  223  2e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  48.71 
 
 		 241 aa  219  3e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  46.85 
 
 		 230 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  47.98 
 
 		 248 aa  218  5e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  51.39 
 
 		 222 aa  217  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0229  ABC transporter related  46.58 
 
 		 264 aa  215  5e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.772392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2042  ABC transporter-related protein  49.33 
 
 		 236 aa  214  8e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1024  ABC transporter related  48.6 
 
 		 234 aa  214  8e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.306992 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  48.65 
 
 		 235 aa  214  9.999999999999999e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  49.54 
 
 		 225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  47.95 
 
 		 266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  47.22 
 
 		 236 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  46.92 
 
 		 239 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  47.53 
 
 		 249 aa  211  7e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  46.9 
 
 		 232 aa  211  7.999999999999999e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  46.85 
 
 		 230 aa  211  7.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  50.69 
 
 		 237 aa  211  9e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  48.62 
 
 		 229 aa  211  9e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  45.54 
 
 		 653 aa  210  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  47.19 
 
 		 252 aa  210  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  45.95 
 
 		 228 aa  210  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  46.67 
 
 		 236 aa  210  1e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  47.96 
 
 		 241 aa  210  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  46.64 
 
 		 227 aa  209  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  47.47 
 
 		 231 aa  209  3e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  47.69 
 
 		 230 aa  209  3e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  47.06 
 
 		 240 aa  209  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  46.76 
 
 		 225 aa  209  4e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  47.44 
 
 		 242 aa  208  6e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  47.22 
 
 		 232 aa  208  7e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  48.2 
 
 		 248 aa  207  8e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4048  ABC transporter-related protein  49.32 
 
 		 237 aa  207  8e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  46.23 
 
 		 244 aa  207  8e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4081  ABC transporter related  49.32 
 
 		 237 aa  207  8e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  44.34 
 
 		 242 aa  207  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  44.59 
 
 		 653 aa  207  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4296  ABC transporter related  48.2 
 
 		 242 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0438871  normal  0.557698 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  47.3 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  45.7 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3939  ABC transporter, ATPase subunit  48.87 
 
 		 236 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.920707  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  48.6 
 
 		 228 aa  206  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  45.91 
 
 		 229 aa  206  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  45.5 
 
 		 232 aa  206  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  46.61 
 
 		 236 aa  206  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  47.77 
 
 		 236 aa  205  4e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4286  ABC transporter-related protein  46.61 
 
 		 241 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  50.69 
 
 		 241 aa  206  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  45.5 
 
 		 226 aa  205  4e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  46.52 
 
 		 247 aa  205  5e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4308  ABC transporter related  46.61 
 
 		 241 aa  205  5e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4155  ABC transporter, ATPase subunit  46.61 
 
 		 241 aa  205  5e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  47.49 
 
 		 234 aa  205  5e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  45.87 
 
 		 642 aa  205  5e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  46.36 
 
 		 239 aa  205  6e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3081  ABC transporter, ATP-binding protein  48.87 
 
 		 223 aa  204  7e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.501337  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  43.84 
 
 		 234 aa  204  7e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2811  ABC transporter, ATP-binding protein  49.54 
 
 		 223 aa  204  8e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0179867  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3083  ABC transporter, ATP-binding protein  48.87 
 
 		 223 aa  204  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.760416  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2771  ABC transporter, ATP-binding protein  49.54 
 
 		 223 aa  204  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2196  ABC transporter related  48.86 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.439888  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  45.29 
 
 		 260 aa  204  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3064  ABC transporter, ATP-binding protein  47.79 
 
 		 227 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  46.88 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  47.93 
 
 		 288 aa  203  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1757  ABC transporter ATP-binding protein  43.69 
 
 		 235 aa  202  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.245254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  46.88 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  48.4 
 
 		 288 aa  202  4e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0329  putative ABC transport system, ATP-binding protein  47.03 
 
 		 226 aa  202  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  47.71 
 
 		 236 aa  202  5e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  46.61 
 
 		 244 aa  202  5e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  44.75 
 
 		 235 aa  202  5e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2199  ABC transporter, ATP-binding protein  49.08 
 
 		 221 aa  202  5e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517578  hitchhiker  0.0000000011345 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1516  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.17 
 
 		 230 aa  201  6e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00103839  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  44.8 
 
 		 642 aa  201  6e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  47.09 
 
 		 234 aa  201  6e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  47.09 
 
 		 234 aa  201  6e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2837  ABC transporter ATP-binding protein  49.08 
 
 		 223 aa  201  7e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000357321  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3052  ABC transporter ATP-binding protein  49.08 
 
 		 223 aa  201  7e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  47.69 
 
 		 408 aa  201  7e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  46.4 
 
 		 291 aa  201  8e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  42.92 
 
 		 252 aa  201  8e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0308  ABC transporter ATP-binding protein  44.39 
 
 		 237 aa  201  8e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0332817 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0205  ABC transporter related  45.5 
 
 		 233 aa  201  8e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1893  ABC transporter related  46.22 
 
 		 238 aa  201  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.472097  normal  0.325237 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>