More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1514 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  100 
 
 
232 aa  471  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1620  ABC transporter, ATPase subunit  65.94 
 
 
241 aa  303  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  63.35 
 
 
229 aa  300  2e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  62.73 
 
 
229 aa  294  8e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  62.56 
 
 
231 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  58.41 
 
 
231 aa  279  2e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  61.54 
 
 
235 aa  278  4e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  60.35 
 
 
229 aa  278  5e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1757  ABC transporter ATP-binding protein  54.3 
 
 
235 aa  275  6e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.245254  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  59.47 
 
 
231 aa  274  7e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  60.35 
 
 
229 aa  274  9e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3166  ABC transporter related protein  60.26 
 
 
240 aa  274  9e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.240946  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0630  ABC transporter related  62.56 
 
 
268 aa  270  1e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0423789 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  58.59 
 
 
234 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  59.73 
 
 
230 aa  266  2e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  58.59 
 
 
231 aa  266  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1457  ABC transporter related  57.89 
 
 
228 aa  266  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2260  ABC transporter related  55.75 
 
 
232 aa  265  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0549292  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5857  ABC transporter related  58.45 
 
 
230 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105187  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3711  ABC transporter related  57.78 
 
 
235 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.587902 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0222  ABC transporter related  57.52 
 
 
232 aa  259  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0230  ABC transporter related  56.83 
 
 
232 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000298 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0284  ABC transporter related  57.52 
 
 
232 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257552  hitchhiker  0.00000395766 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3402  ABC efflux pump, ATPase subunit  57.08 
 
 
232 aa  254  6e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0029159  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0303  ABC transporter related  57.08 
 
 
232 aa  254  8e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0537962  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  54.13 
 
 
225 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2803  ABC transporter related  56.64 
 
 
232 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0893633  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0206  ABC transporter related  58.41 
 
 
232 aa  251  7e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.922054  unclonable  0.000000000007713 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2582  ABC transporter related  54.87 
 
 
234 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  50 
 
 
237 aa  226  3e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  48.65 
 
 
246 aa  223  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  47.53 
 
 
225 aa  220  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  47.49 
 
 
225 aa  219  3e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  48 
 
 
228 aa  218  5e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  46.19 
 
 
230 aa  218  7e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  46.58 
 
 
319 aa  218  7e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  49.55 
 
 
236 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  47.16 
 
 
236 aa  217  1e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  47.51 
 
 
222 aa  217  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2973  ABC transporter related  49.08 
 
 
222 aa  217  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  46.64 
 
 
226 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  48.21 
 
 
226 aa  215  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  47.09 
 
 
226 aa  215  4e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  48.21 
 
 
226 aa  215  5e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  48.21 
 
 
226 aa  215  5e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  48.21 
 
 
226 aa  215  5e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  48.21 
 
 
226 aa  215  5e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  48.21 
 
 
226 aa  215  5e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  47.09 
 
 
226 aa  215  5e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  48.17 
 
 
239 aa  215  5e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  45.5 
 
 
230 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  48.21 
 
 
226 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  48.21 
 
 
226 aa  214  7e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  49.32 
 
 
239 aa  214  9e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  46.64 
 
 
226 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1775  ABC transporter related  48.64 
 
 
298 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  45.29 
 
 
225 aa  214  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  51.15 
 
 
222 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  46.15 
 
 
222 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  49.55 
 
 
222 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  47.49 
 
 
234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  46.67 
 
 
228 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  46.54 
 
 
220 aa  213  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3993  ABC transporter related  50 
 
 
260 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0277  ABC transporter related protein  46.7 
 
 
334 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  50 
 
 
230 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  44.84 
 
 
237 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  44.84 
 
 
242 aa  212  4.9999999999999996e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  48.64 
 
 
230 aa  211  7e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  48.4 
 
 
234 aa  211  7.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  47.95 
 
 
241 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  43.95 
 
 
238 aa  210  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  47.47 
 
 
220 aa  210  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  46.58 
 
 
235 aa  210  2e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2318  ABC transporter related  50 
 
 
565 aa  209  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  45.98 
 
 
230 aa  209  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  47.49 
 
 
234 aa  210  2e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  49.55 
 
 
227 aa  209  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  44.8 
 
 
220 aa  209  3e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  44.55 
 
 
240 aa  209  3e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1431  ABC transporter related  44.89 
 
 
227 aa  209  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  44.59 
 
 
233 aa  209  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  45.66 
 
 
224 aa  209  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  45.66 
 
 
224 aa  209  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  46.43 
 
 
248 aa  209  4e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1942  ABC transporter related  48.17 
 
 
254 aa  209  4e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  45.66 
 
 
224 aa  209  4e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  45.66 
 
 
224 aa  209  4e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  46.09 
 
 
232 aa  208  5e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2375  ABC-type transport system, ATPase component  45.61 
 
 
229 aa  208  5e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797432  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  45.66 
 
 
224 aa  208  5e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  49.55 
 
 
238 aa  208  5e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  45.58 
 
 
241 aa  208  6e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  43.95 
 
 
251 aa  208  7e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0060  ABC transporter related  47.22 
 
 
232 aa  208  7e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  45.33 
 
 
248 aa  207  8e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  45.89 
 
 
240 aa  207  8e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1693  ABC transporter related  47.03 
 
 
232 aa  207  8e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1979  ABC transporter related  46.12 
 
 
240 aa  207  8e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1998  ABC transporter related  46.12 
 
 
240 aa  207  9e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>