More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1984 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  100 
 
 
231 aa  466  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  77.97 
 
 
229 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  77.39 
 
 
231 aa  356  9.999999999999999e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  77.83 
 
 
231 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1457  ABC transporter related  76.21 
 
 
228 aa  352  4e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  77.09 
 
 
229 aa  350  8e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  73.42 
 
 
230 aa  334  7.999999999999999e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  70.27 
 
 
234 aa  329  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5857  ABC transporter related  70.78 
 
 
230 aa  322  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105187  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3711  ABC transporter related  68.26 
 
 
235 aa  316  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.587902 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0630  ABC transporter related  71.23 
 
 
268 aa  316  2e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0423789 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  66.52 
 
 
235 aa  309  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3402  ABC efflux pump, ATPase subunit  67.54 
 
 
232 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0029159  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0230  ABC transporter related  66.23 
 
 
232 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000298 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0222  ABC transporter related  66.23 
 
 
232 aa  299  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0303  ABC transporter related  67.11 
 
 
232 aa  298  5e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0537962  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0284  ABC transporter related  66.67 
 
 
232 aa  298  6e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257552  hitchhiker  0.00000395766 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2803  ABC transporter related  66.67 
 
 
232 aa  296  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0893633  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0206  ABC transporter related  66.67 
 
 
232 aa  292  4e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.922054  unclonable  0.000000000007713 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  62.56 
 
 
232 aa  283  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  60.36 
 
 
229 aa  276  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  59.91 
 
 
229 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  58.48 
 
 
231 aa  267  8e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1620  ABC transporter, ATPase subunit  58.93 
 
 
241 aa  267  1e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3166  ABC transporter related protein  56.58 
 
 
240 aa  265  2.9999999999999995e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.240946  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  57.73 
 
 
225 aa  260  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1757  ABC transporter ATP-binding protein  54.34 
 
 
235 aa  260  1e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.245254  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2260  ABC transporter related  53.1 
 
 
232 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0549292  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2582  ABC transporter related  52.38 
 
 
234 aa  230  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  49.78 
 
 
242 aa  225  4e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  47.73 
 
 
246 aa  225  4e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  48.86 
 
 
240 aa  224  6e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  49.33 
 
 
258 aa  221  9e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  48.21 
 
 
266 aa  220  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  50.69 
 
 
222 aa  219  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  47.35 
 
 
293 aa  218  7e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  48.23 
 
 
238 aa  215  4e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  47.79 
 
 
255 aa  215  4e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  47.49 
 
 
248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  45.33 
 
 
240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  48.36 
 
 
237 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  47.16 
 
 
242 aa  211  5.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  49.08 
 
 
253 aa  211  7e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  47.27 
 
 
221 aa  211  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  51.6 
 
 
233 aa  210  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3195  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.61 
 
 
227 aa  209  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  46.48 
 
 
229 aa  209  3e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  47.32 
 
 
237 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2973  ABC transporter related  49.08 
 
 
222 aa  209  4e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  48.06 
 
 
249 aa  207  8e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  45.58 
 
 
264 aa  207  9e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  48.36 
 
 
225 aa  207  1e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  47.49 
 
 
230 aa  207  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  46.12 
 
 
235 aa  207  1e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  48.8 
 
 
230 aa  207  1e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1431  ABC transporter related  47.96 
 
 
227 aa  207  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  45.89 
 
 
236 aa  207  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  48.36 
 
 
225 aa  207  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  47.22 
 
 
231 aa  206  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  47.2 
 
 
225 aa  206  2e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  43.38 
 
 
230 aa  206  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  45 
 
 
220 aa  206  2e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  48.4 
 
 
239 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  45.91 
 
 
251 aa  205  4e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  46.7 
 
 
230 aa  205  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  45.66 
 
 
259 aa  205  5e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  44.7 
 
 
226 aa  205  6e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  45.09 
 
 
226 aa  205  6e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  44.86 
 
 
240 aa  205  6e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  46.12 
 
 
240 aa  205  6e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  44.34 
 
 
256 aa  204  7e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  46.79 
 
 
288 aa  204  7e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  45.09 
 
 
226 aa  204  9e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  45.25 
 
 
230 aa  204  9e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  46.73 
 
 
242 aa  204  9e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  48.86 
 
 
280 aa  204  1e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  47.69 
 
 
235 aa  204  1e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  44.64 
 
 
226 aa  204  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0908  ABC transporter related  48.2 
 
 
235 aa  204  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  47.3 
 
 
232 aa  203  2e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0183  ABC transporter related  45.83 
 
 
226 aa  203  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.337585  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  45.05 
 
 
235 aa  203  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0188  ABC transporter related  45.83 
 
 
226 aa  203  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  44.64 
 
 
226 aa  202  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2658  ABC transporter-related protein  47.32 
 
 
227 aa  202  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  44.64 
 
 
226 aa  202  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  44.64 
 
 
226 aa  202  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  44.64 
 
 
226 aa  202  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  44.64 
 
 
226 aa  202  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01135  ABC transporter, ATP-binding protein  46.88 
 
 
233 aa  202  3e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  45.09 
 
 
226 aa  202  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  45.33 
 
 
252 aa  202  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  45.25 
 
 
228 aa  202  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  47.47 
 
 
239 aa  202  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  44.64 
 
 
226 aa  202  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  44.64 
 
 
226 aa  202  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  46.4 
 
 
238 aa  202  4e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2508  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.7 
 
 
225 aa  202  4e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711904  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  47.19 
 
 
238 aa  202  4e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  43.38 
 
 
225 aa  202  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>