More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0987 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  100 
 
 		 229 aa  460  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  96.51 
 
 		 229 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  80.62 
 
 		 231 aa  374  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1457  ABC transporter related  78.85 
 
 		 228 aa  370  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  78.85 
 
 		 231 aa  366  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  77.97 
 
 		 231 aa  357  9.999999999999999e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  72.6 
 
 		 230 aa  325  3e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  68.58 
 
 		 234 aa  323  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5857  ABC transporter related  69.09 
 
 		 230 aa  318  6e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105187  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0630  ABC transporter related  69.2 
 
 		 268 aa  315  3e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0423789 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3711  ABC transporter related  68.61 
 
 		 235 aa  310  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.587902 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  63.91 
 
 		 235 aa  304  7e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0230  ABC transporter related  66.96 
 
 		 232 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000298 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0222  ABC transporter related  67.26 
 
 		 232 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3402  ABC efflux pump, ATPase subunit  65.93 
 
 		 232 aa  296  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0029159  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0284  ABC transporter related  65.04 
 
 		 232 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257552  hitchhiker  0.00000395766 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0206  ABC transporter related  66.37 
 
 		 232 aa  290  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.922054  unclonable  0.000000000007713 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0303  ABC transporter related  64.6 
 
 		 232 aa  289  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0537962  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2803  ABC transporter related  64.16 
 
 		 232 aa  287  8e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0893633  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  61.36 
 
 		 229 aa  280  1e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  60.35 
 
 		 232 aa  278  5e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  60 
 
 		 229 aa  270  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1757  ABC transporter ATP-binding protein  56.62 
 
 		 235 aa  269  2.9999999999999997e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.245254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1620  ABC transporter, ATPase subunit  59.01 
 
 		 241 aa  267  1e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  58.8 
 
 		 231 aa  265  2.9999999999999995e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3166  ABC transporter related protein  56.19 
 
 		 240 aa  263  1e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.240946  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2260  ABC transporter related  53.98 
 
 		 232 aa  255  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0549292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  56.02 
 
 		 225 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2582  ABC transporter related  55.75 
 
 		 234 aa  246  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  49.77 
 
 		 255 aa  227  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  50.89 
 
 		 242 aa  226  2e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  49.77 
 
 		 240 aa  226  2e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  50.44 
 
 		 277 aa  222  4e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  54.26 
 
 		 233 aa  221  4.9999999999999996e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  49.11 
 
 		 239 aa  219  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  47.79 
 
 		 258 aa  219  3.9999999999999997e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  47.47 
 
 		 228 aa  218  5e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  48.18 
 
 		 266 aa  218  6e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0908  ABC transporter related  47.09 
 
 		 235 aa  217  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  47.73 
 
 		 221 aa  216  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  46.82 
 
 		 248 aa  216  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  47.51 
 
 		 237 aa  215  4e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.75 
 
 		 274 aa  214  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  49.78 
 
 		 238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  45.21 
 
 		 230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  46.58 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.47 
 
 		 264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  46.82 
 
 		 238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3214  ABC transporter related  47.14 
 
 		 233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.418962  normal  0.11192 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  48.86 
 
 		 280 aa  212  4.9999999999999996e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  47.03 
 
 		 288 aa  211  7e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  45.62 
 
 		 226 aa  209  2e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  46.9 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  45.29 
 
 		 255 aa  209  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  49.52 
 
 		 230 aa  209  2e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  49.32 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  46.12 
 
 		 259 aa  209  3e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  45.62 
 
 		 229 aa  209  3e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  49.31 
 
 		 222 aa  209  4e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  45.5 
 
 		 240 aa  209  4e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  45 
 
 		 251 aa  208  6e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  46.54 
 
 		 262 aa  207  7e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  46.85 
 
 		 240 aa  207  7e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  45 
 
 		 246 aa  208  7e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0956  ABC transporter related  48.39 
 
 		 229 aa  207  9e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  48.84 
 
 		 247 aa  207  9e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  44.75 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4838  ABC transporter related  46.58 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1330  ABC transporter related  46.08 
 
 		 235 aa  207  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.514657  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  46.54 
 
 		 240 aa  207  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  45.29 
 
 		 258 aa  207  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  46.19 
 
 		 239 aa  207  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  45.98 
 
 		 256 aa  207  1e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  44.89 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  47.03 
 
 		 266 aa  207  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  47.89 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  45.74 
 
 		 232 aa  206  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  48.39 
 
 		 264 aa  207  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  46.12 
 
 		 237 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  46.98 
 
 		 256 aa  206  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.46 
 
 		 245 aa  206  3e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  47.47 
 
 		 248 aa  205  4e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  47.03 
 
 		 225 aa  205  5e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  47.03 
 
 		 225 aa  205  6e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  47.03 
 
 		 225 aa  205  6e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  45.74 
 
 		 252 aa  204  7e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  47.35 
 
 		 668 aa  204  8e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  47.35 
 
 		 668 aa  204  8e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  45.25 
 
 		 252 aa  204  9e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  45.54 
 
 		 312 aa  204  9e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  44.75 
 
 		 229 aa  204  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  46.12 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  46.36 
 
 		 237 aa  202  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  47.8 
 
 		 226 aa  203  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0855  ABC transporter related  45.87 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00113999  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  44.95 
 
 		 230 aa  202  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1802  ABC transporter related  44.39 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  44.75 
 
 		 293 aa  203  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0471  ABC transporter related  46.83 
 
 		 236 aa  202  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  45.16 
 
 		 223 aa  202  3e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>