More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0669 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  100 
 
 		 242 aa  491  9.999999999999999e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  64.25 
 
 		 225 aa  295  4e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  54.34 
 
 		 225 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  54.34 
 
 		 225 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  51.95 
 
 		 231 aa  237  1e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  52.47 
 
 		 238 aa  229  3e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  48.88 
 
 		 234 aa  226  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  50.89 
 
 		 229 aa  226  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  50.89 
 
 		 229 aa  226  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  49.78 
 
 		 231 aa  225  4e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  46.67 
 
 		 256 aa  225  6e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  51.15 
 
 		 230 aa  224  9e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5857  ABC transporter related  49.32 
 
 		 230 aa  223  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105187  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  46.9 
 
 		 227 aa  221  6e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  46.46 
 
 		 227 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3711  ABC transporter related  48.02 
 
 		 235 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.587902 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2110  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein LolD  46.02 
 
 		 227 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327519  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  48.67 
 
 		 231 aa  219  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  46.26 
 
 		 227 aa  219  5e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1457  ABC transporter related  51.15 
 
 		 228 aa  218  7e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  47.35 
 
 		 231 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  47.95 
 
 		 237 aa  217  1e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1905  ABC transporter  45.58 
 
 		 232 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.030671  hitchhiker  0.00477686 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3858  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.69 
 
 		 232 aa  217  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0630  ABC transporter related  48.17 
 
 		 268 aa  217  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0423789 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  45.98 
 
 		 229 aa  216  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  44.39 
 
 		 227 aa  216  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.39 
 
 		 227 aa  216  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1158  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  47.06 
 
 		 228 aa  216  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000091513 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7810  ABC transporter related  49.77 
 
 		 261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1563  ABC transporter related  47.53 
 
 		 249 aa  215  4e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2658  ABC transporter-related protein  48.17 
 
 		 227 aa  216  4e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14700  lipoprotein-releasing ABC transporter  44.39 
 
 		 232 aa  215  5e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.072484  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  46.82 
 
 		 233 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  46.85 
 
 		 235 aa  214  8e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.64 
 
 		 233 aa  214  8e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  46.64 
 
 		 233 aa  214  9e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.64 
 
 		 233 aa  214  9e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.64 
 
 		 233 aa  214  9e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.64 
 
 		 233 aa  214  9e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  46.64 
 
 		 233 aa  214  9e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.64 
 
 		 233 aa  214  9e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.64 
 
 		 233 aa  214  9e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  43.97 
 
 		 233 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  47.73 
 
 		 230 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  47.77 
 
 		 237 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  47.32 
 
 		 230 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1608  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44 
 
 		 237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109115  normal  0.0760989 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  46.36 
 
 		 237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  46.26 
 
 		 217 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05802  ABC transporter ATP-binding protein  46.26 
 
 		 233 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  48.42 
 
 		 225 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  44.26 
 
 		 252 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2966  ABC transporter-like protein  47.75 
 
 		 234 aa  212  4.9999999999999996e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.64 
 
 		 233 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  46.85 
 
 		 231 aa  212  4.9999999999999996e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  46.26 
 
 		 227 aa  212  4.9999999999999996e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  44.84 
 
 		 232 aa  212  4.9999999999999996e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1775  ABC transporter related  47.35 
 
 		 298 aa  211  5.999999999999999e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  48.37 
 
 		 224 aa  211  7e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4589  ABC transporter related protein  45.91 
 
 		 225 aa  211  7e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00504379  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00446  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  47.96 
 
 		 228 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3115  ABC transporter related protein  47.96 
 
 		 228 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0599  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  47.96 
 
 		 228 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.962067 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0534  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  47.96 
 
 		 228 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0430  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  47.96 
 
 		 228 aa  211  7.999999999999999e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.811195  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3121  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  47.96 
 
 		 228 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114112 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0573  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  47.96 
 
 		 228 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00451  hypothetical protein  47.96 
 
 		 228 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0544  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  47.96 
 
 		 228 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  47.03 
 
 		 223 aa  211  9e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1696  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.36 
 
 		 232 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0743106 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  45.25 
 
 		 228 aa  210  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  48.21 
 
 		 228 aa  211  1e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.74 
 
 		 233 aa  211  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  47.98 
 
 		 241 aa  210  1e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  46.85 
 
 		 235 aa  211  1e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2202  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.79 
 
 		 227 aa  211  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.15426 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  47.98 
 
 		 241 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  49.32 
 
 		 224 aa  209  2e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1672  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 232 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.50356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  47.47 
 
 		 227 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3195  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.25 
 
 		 227 aa  209  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  47.03 
 
 		 220 aa  209  3e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  46.82 
 
 		 227 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.44 
 
 		 230 aa  209  3e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1468  ABC transporter related  44.8 
 
 		 233 aa  209  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1598  ABC transporter related  47.53 
 
 		 228 aa  209  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2583  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.13 
 
 		 249 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.484423  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 232 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.390667  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  45.98 
 
 		 225 aa  209  4e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3587  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 232 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  44.69 
 
 		 246 aa  209  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19670  ABC transporter related  44.98 
 
 		 232 aa  208  5e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2200  ABC transporter, ATP-binding protein  42.31 
 
 		 240 aa  208  5e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3118  ABC transporter, ATP-binding protein  42.31 
 
 		 240 aa  208  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2638  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.31 
 
 		 249 aa  208  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  42.31 
 
 		 249 aa  208  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3166  ABC transporter related protein  46.22 
 
 		 240 aa  208  5e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.240946  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.74 
 
 		 233 aa  208  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>