More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1775 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1775  ABC transporter related  100 
 
 
298 aa  598  1e-170  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0302  ABC transporter related  53.27 
 
 
289 aa  244  9.999999999999999e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.353598 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  50.69 
 
 
319 aa  218  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  44.63 
 
 
247 aa  217  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  51.61 
 
 
225 aa  216  5e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  48.64 
 
 
232 aa  214  9.999999999999999e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  48.65 
 
 
231 aa  212  7e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  49.3 
 
 
222 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  47.35 
 
 
242 aa  211  9e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  49.32 
 
 
224 aa  211  9e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0390  ABC transporter related  45.53 
 
 
232 aa  211  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  48.43 
 
 
237 aa  209  4e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  48.85 
 
 
222 aa  209  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  49.31 
 
 
234 aa  207  2e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0630  ABC transporter related  48.86 
 
 
268 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0423789 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  49.31 
 
 
234 aa  207  2e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  48.03 
 
 
715 aa  206  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  49.3 
 
 
235 aa  206  4e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  48.88 
 
 
238 aa  206  4e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  46.67 
 
 
253 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  47 
 
 
231 aa  205  8e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  47.47 
 
 
221 aa  205  9e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  46.22 
 
 
253 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  45.91 
 
 
225 aa  204  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  45 
 
 
230 aa  203  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  45.91 
 
 
225 aa  204  2e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  43.64 
 
 
248 aa  204  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  48 
 
 
239 aa  204  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3219  ABC transporter, ATP-binding protein  44.17 
 
 
248 aa  203  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.568851  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1667  ABC transporter related  47.47 
 
 
233 aa  203  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  44.44 
 
 
253 aa  203  3e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  47.47 
 
 
238 aa  203  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  48.4 
 
 
225 aa  203  3e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0252  ABC transporter related  45.98 
 
 
244 aa  203  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1582  ABC transporter related  46.88 
 
 
254 aa  202  4e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000305308 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  47.27 
 
 
230 aa  202  4e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  44.64 
 
 
251 aa  202  6e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  47.56 
 
 
232 aa  202  6e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1641  ABC transporter related  44.68 
 
 
254 aa  202  6e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  45.33 
 
 
230 aa  202  6e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  42.5 
 
 
248 aa  202  7e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  46.58 
 
 
231 aa  201  8e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1701  ATPase  47.56 
 
 
240 aa  201  9e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.620814 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  45.45 
 
 
234 aa  201  9e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  47.47 
 
 
229 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  48.21 
 
 
237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  46.49 
 
 
241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2919  ABC transporter related  42.17 
 
 
256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.388484 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  46.36 
 
 
225 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  46.67 
 
 
228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  42.8 
 
 
249 aa  199  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2406  ABC transporter related  48.42 
 
 
247 aa  200  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  48.42 
 
 
228 aa  199  3e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0894  ABC transporter related  46.88 
 
 
224 aa  199  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.552759  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0205  ABC transporter related  47.09 
 
 
233 aa  200  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  44.74 
 
 
228 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  42.21 
 
 
255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  45.26 
 
 
234 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  47.47 
 
 
246 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  48 
 
 
225 aa  199  5e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  46.82 
 
 
234 aa  199  6e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  46.54 
 
 
229 aa  199  6e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  47 
 
 
229 aa  199  6e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  48.39 
 
 
224 aa  198  7e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  42.86 
 
 
643 aa  199  7e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  45.21 
 
 
224 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1145  ABC transporter related  46.22 
 
 
236 aa  198  7.999999999999999e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  45.21 
 
 
224 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0747  ABC transporter related  46.58 
 
 
221 aa  198  9e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  45.21 
 
 
224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  44.59 
 
 
228 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  45.66 
 
 
252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  45.21 
 
 
224 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  45.37 
 
 
241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0772  ABC transporter related  47 
 
 
238 aa  198  1.0000000000000001e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3128  ABC transporter related  43.75 
 
 
248 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  44.74 
 
 
250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  43.85 
 
 
260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  44.75 
 
 
224 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  46.46 
 
 
227 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1024  ABC transporter related  47.49 
 
 
234 aa  197  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.306992 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2109  ABC transporter related protein  49.07 
 
 
226 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  44.75 
 
 
224 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  44.75 
 
 
224 aa  196  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  44.75 
 
 
224 aa  196  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  46.43 
 
 
225 aa  196  3e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1448  ABC transporter related  44.76 
 
 
254 aa  196  3e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  42.56 
 
 
241 aa  196  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  47.09 
 
 
248 aa  196  3e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  44.8 
 
 
231 aa  196  3e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  46.12 
 
 
233 aa  196  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  43.58 
 
 
228 aa  196  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  44.02 
 
 
236 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  44.19 
 
 
236 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  45.95 
 
 
236 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0678  ABC transporter, ATP-binding protein  49.11 
 
 
225 aa  196  6e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.586556  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  44 
 
 
227 aa  195  6e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  45.95 
 
 
235 aa  196  6e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  46.54 
 
 
242 aa  195  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  48.04 
 
 
236 aa  195  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>