More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2536 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  100 
 
 		 230 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  54.63 
 
 		 234 aa  256  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  54.95 
 
 		 237 aa  256  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5302  ABC transporter related  56.83 
 
 		 234 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.155471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1662  ABC transporter related  56.83 
 
 		 234 aa  254  8e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.822676  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5040  ABC transporter, ATP-binding protein  51.54 
 
 		 246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001466  ABC transporter ATP-binding protein  54.95 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3195  putative ABC transporter, ATP-binding protein  52.7 
 
 		 227 aa  251  6e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2375  ABC-type transport system, ATPase component  55.95 
 
 		 229 aa  251  7e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797432  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  56.19 
 
 		 237 aa  249  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2507  ABC transporter related  55.25 
 
 		 231 aa  248  4e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1431  ABC transporter related  50.67 
 
 		 227 aa  248  5e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2904  ABC transporter-like protein  57.59 
 
 		 224 aa  248  8e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.108903 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2658  ABC transporter-related protein  52.97 
 
 		 227 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4081  ABC transporter related  55.2 
 
 		 237 aa  236  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4048  ABC transporter-related protein  55.2 
 
 		 237 aa  236  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3939  ABC transporter, ATPase subunit  55.2 
 
 		 236 aa  236  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.920707  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0855  ABC transporter related  50.45 
 
 		 228 aa  236  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00113999  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  50.67 
 
 		 224 aa  231  6e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1802  ABC transporter related  50.22 
 
 		 234 aa  231  6e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  50.67 
 
 		 234 aa  230  1e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  50.67 
 
 		 234 aa  230  1e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  48.43 
 
 		 242 aa  230  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1100  ABC transporter related  51.32 
 
 		 236 aa  229  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  49.78 
 
 		 230 aa  229  3e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  49.77 
 
 		 231 aa  228  5e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0433  ABC transporter related  52.23 
 
 		 233 aa  227  1e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19670  ABC transporter related  49.32 
 
 		 232 aa  226  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  49.55 
 
 		 244 aa  226  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  46.85 
 
 		 246 aa  225  4e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  47.51 
 
 		 235 aa  224  6e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2345  ABC transporter, ATP-binding protein  50.91 
 
 		 233 aa  225  6e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3144  ABC transporter, ATP-binding protein  50.45 
 
 		 233 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  47.09 
 
 		 242 aa  223  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  52.51 
 
 		 277 aa  223  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3285  ABC transporter related  52.04 
 
 		 249 aa  224  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1473  ABC-transporter ATP binding protein  50.45 
 
 		 233 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  47.49 
 
 		 225 aa  224  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3258  ABC transporter, ATP-binding protein  50.45 
 
 		 233 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.219344  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  50 
 
 		 244 aa  223  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0252  ABC transporter related  45.06 
 
 		 244 aa  223  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2391  ABC transporter related  48.87 
 
 		 253 aa  223  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2086  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 233 aa  222  4e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  48.21 
 
 		 228 aa  222  4e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2377  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 233 aa  222  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1113  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 233 aa  222  4e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1392  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 233 aa  222  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  44.89 
 
 		 266 aa  221  8e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2019  ABC transporter related protein  46.36 
 
 		 228 aa  221  8e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0275435  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  48.46 
 
 		 248 aa  221  9e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0367  ABC transporter related  48.92 
 
 		 244 aa  220  9.999999999999999e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  46.88 
 
 		 237 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  44.78 
 
 		 249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  48.43 
 
 		 237 aa  218  6e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  45.33 
 
 		 238 aa  218  7e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1744  ABC transporter related protein  49.33 
 
 		 246 aa  218  8.999999999999998e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  47.03 
 
 		 252 aa  217  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3219  ABC transporter, ATP-binding protein  46.05 
 
 		 248 aa  216  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.568851  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  50.68 
 
 		 252 aa  216  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6690  ABC transporter, ATPase subunit  52.09 
 
 		 234 aa  216  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.810231  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2531  ABC transporter related  51.83 
 
 		 228 aa  217  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.799962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  50.22 
 
 		 288 aa  215  5e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  44.69 
 
 		 249 aa  214  7e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0894  ABC transporter related  46.88 
 
 		 224 aa  214  8e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.552759  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  47.95 
 
 		 233 aa  214  8e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29510  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  48.66 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  47.73 
 
 		 242 aa  213  9.999999999999999e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  44.59 
 
 		 231 aa  214  9.999999999999999e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  47.27 
 
 		 237 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  46.88 
 
 		 239 aa  213  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  47.09 
 
 		 241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  45.91 
 
 		 248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  45.91 
 
 		 248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  46.43 
 
 		 232 aa  212  2.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1998  ABC transporter related  47.75 
 
 		 240 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2044  ABC transporter related  47.75 
 
 		 240 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  43.84 
 
 		 230 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  48.89 
 
 		 224 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4456  ABC transporter related protein  53.39 
 
 		 239 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  48.02 
 
 		 253 aa  212  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  49.55 
 
 		 240 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  47.3 
 
 		 225 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  47.3 
 
 		 225 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  47.11 
 
 		 715 aa  212  4.9999999999999996e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  47.03 
 
 		 224 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  47.77 
 
 		 230 aa  211  5.999999999999999e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  47.03 
 
 		 224 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  47.03 
 
 		 224 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  46.46 
 
 		 232 aa  211  7e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  48.02 
 
 		 253 aa  211  7e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  47.35 
 
 		 255 aa  211  7e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  45.29 
 
 		 236 aa  211  7e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  47.06 
 
 		 224 aa  211  9e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  48.44 
 
 		 241 aa  211  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  46.67 
 
 		 227 aa  211  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  46.93 
 
 		 238 aa  211  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  46.43 
 
 		 225 aa  210  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  47.53 
 
 		 249 aa  211  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  47.37 
 
 		 233 aa  209  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  44.2 
 
 		 239 aa  209  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>