More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0433 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0433  ABC transporter related  100 
 
 		 233 aa  471  1e-132  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  55.41 
 
 		 237 aa  248  5e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5040  ABC transporter, ATP-binding protein  53.21 
 
 		 246 aa  246  3e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001466  ABC transporter ATP-binding protein  54.05 
 
 		 238 aa  244  6.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  52.23 
 
 		 230 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3195  putative ABC transporter, ATP-binding protein  56.02 
 
 		 227 aa  240  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1431  ABC transporter related  52.68 
 
 		 227 aa  240  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2375  ABC-type transport system, ATPase component  50.88 
 
 		 229 aa  238  5.999999999999999e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797432  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0855  ABC transporter related  49.12 
 
 		 228 aa  236  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00113999  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2658  ABC transporter-related protein  54.02 
 
 		 227 aa  235  4e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  51.77 
 
 		 234 aa  233  1.0000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5302  ABC transporter related  55.36 
 
 		 234 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.155471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1662  ABC transporter related  55.36 
 
 		 234 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.822676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2507  ABC transporter related  51.79 
 
 		 231 aa  228  8e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  50.91 
 
 		 239 aa  222  4.9999999999999996e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  50.45 
 
 		 230 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3285  ABC transporter related  49.1 
 
 		 249 aa  220  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  48.23 
 
 		 225 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  50.23 
 
 		 237 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4081  ABC transporter related  50 
 
 		 237 aa  218  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4048  ABC transporter-related protein  50 
 
 		 237 aa  218  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  48.65 
 
 		 225 aa  218  5e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  48.65 
 
 		 225 aa  218  5e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  48.17 
 
 		 240 aa  218  7e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2019  ABC transporter related protein  46.33 
 
 		 228 aa  218  7.999999999999999e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0275435  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3939  ABC transporter, ATPase subunit  49.11 
 
 		 236 aa  216  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.920707  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  46.35 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29510  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2540  ABC transporter related  46.88 
 
 		 241 aa  214  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.656818  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2531  ABC transporter related  52.73 
 
 		 228 aa  214  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.799962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  50 
 
 		 224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2391  ABC transporter related  47.75 
 
 		 253 aa  212  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  47.98 
 
 		 222 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1802  ABC transporter related  46.58 
 
 		 234 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  46.15 
 
 		 286 aa  211  7.999999999999999e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2437  ABC transporter related  48.17 
 
 		 231 aa  210  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  47.3 
 
 		 291 aa  209  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  46.43 
 
 		 226 aa  210  2e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2904  ABC transporter-like protein  51.14 
 
 		 224 aa  210  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.108903 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  46.82 
 
 		 319 aa  209  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0367  ABC transporter related  49.77 
 
 		 244 aa  209  4e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  47.51 
 
 		 230 aa  208  5e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  46.67 
 
 		 230 aa  208  5e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  48.17 
 
 		 221 aa  208  6e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2345  ABC transporter, ATP-binding protein  44.49 
 
 		 233 aa  207  8e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  47.51 
 
 		 234 aa  207  8e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2653  ABC transporter, ATP-binding protein  47.17 
 
 		 214 aa  207  9e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.670995  normal  0.0652814 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  47.96 
 
 		 231 aa  207  9e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2377  ABC transporter, ATP-binding protein  44.49 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2086  ABC transporter, ATP-binding protein  44.49 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1113  ABC transporter, ATP-binding protein  44.49 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1392  ABC transporter, ATP-binding protein  44.49 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1291  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  49.1 
 
 		 235 aa  207  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.286185 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  44.84 
 
 		 252 aa  206  2e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  47.35 
 
 		 241 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0630  ABC transporter related  47.71 
 
 		 268 aa  206  3e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0423789 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  44.44 
 
 		 225 aa  206  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  46.02 
 
 		 225 aa  206  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  46.22 
 
 		 226 aa  205  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  47.51 
 
 		 231 aa  205  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  47.96 
 
 		 235 aa  206  4e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  47.51 
 
 		 231 aa  205  5e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  45.33 
 
 		 226 aa  205  6e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3144  ABC transporter, ATP-binding protein  44.05 
 
 		 233 aa  205  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1473  ABC-transporter ATP binding protein  44.05 
 
 		 233 aa  205  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3258  ABC transporter, ATP-binding protein  44.05 
 
 		 233 aa  205  6e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.219344  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  48.4 
 
 		 229 aa  205  6e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1457  ABC transporter related  48.39 
 
 		 228 aa  205  6e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  48.4 
 
 		 229 aa  205  6e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 		 226 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  44.91 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  42.34 
 
 		 240 aa  203  2e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1563  ABC transporter related  45.7 
 
 		 249 aa  202  2e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  45.5 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  46.22 
 
 		 226 aa  202  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  46.22 
 
 		 226 aa  202  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  46.22 
 
 		 226 aa  202  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  46.22 
 
 		 226 aa  202  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  46.22 
 
 		 226 aa  202  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5857  ABC transporter related  47.49 
 
 		 230 aa  202  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105187  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  46.19 
 
 		 246 aa  202  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  46.22 
 
 		 226 aa  202  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  45.78 
 
 		 226 aa  202  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  45.29 
 
 		 229 aa  202  4e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1125  ATPase  46.49 
 
 		 245 aa  202  5e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.237557 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  43.3 
 
 		 225 aa  201  6e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  47.56 
 
 		 241 aa  201  6e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3170  ABC transporter related protein  47.76 
 
 		 217 aa  201  8e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0178954  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  46.58 
 
 		 252 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  45.33 
 
 		 226 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  45.13 
 
 		 235 aa  200  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  45.7 
 
 		 241 aa  200  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  44.34 
 
 		 266 aa  199  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  42.22 
 
 		 228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  48.43 
 
 		 238 aa  199  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  45.78 
 
 		 226 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  44.2 
 
 		 228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  45.21 
 
 		 227 aa  199  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6690  ABC transporter, ATPase subunit  47 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.810231  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0254  ABC transporter related  44.8 
 
 		 241 aa  199  3e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>