More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2653 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2653  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 214 aa  443  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.670995  normal  0.0652814 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  59.62 
 
 		 229 aa  267  8.999999999999999e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2200  ABC transporter-related protein  58.88 
 
 		 229 aa  266  1e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1427  ABC transporter related  57.28 
 
 		 241 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0799296  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1653  ABC transporter related  54.07 
 
 		 228 aa  246  2e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.200996  normal  0.926793 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0758  ABC transporter related  56.46 
 
 		 237 aa  245  4e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0209945  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0986  ABC transporter, ATPase subunit  54.03 
 
 		 232 aa  244  6.999999999999999e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  48.11 
 
 		 226 aa  222  4e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3195  putative ABC transporter, ATP-binding protein  49.28 
 
 		 227 aa  221  4.9999999999999996e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  49.05 
 
 		 235 aa  219  3e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  47.17 
 
 		 222 aa  218  5e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1431  ABC transporter related  49.02 
 
 		 227 aa  217  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  45.54 
 
 		 228 aa  216  1e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  49.28 
 
 		 246 aa  215  4e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  46.26 
 
 		 230 aa  215  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001466  ABC transporter ATP-binding protein  50.5 
 
 		 238 aa  214  5e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  48.53 
 
 		 237 aa  214  5.9999999999999996e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  46.26 
 
 		 240 aa  213  9.999999999999999e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  46.7 
 
 		 230 aa  214  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  46.95 
 
 		 242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  45.54 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  46.01 
 
 		 241 aa  212  3.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  47.17 
 
 		 237 aa  212  3.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  48.11 
 
 		 244 aa  212  3.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  46.23 
 
 		 236 aa  211  4.9999999999999996e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  47.39 
 
 		 227 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  47.85 
 
 		 235 aa  211  7e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  46.01 
 
 		 230 aa  210  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  46.48 
 
 		 239 aa  210  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  47.85 
 
 		 225 aa  211  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  45.33 
 
 		 241 aa  210  1e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  50.49 
 
 		 233 aa  210  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  49.3 
 
 		 230 aa  210  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  47.89 
 
 		 228 aa  209  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  52.15 
 
 		 233 aa  209  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  46.23 
 
 		 240 aa  209  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  46.7 
 
 		 248 aa  209  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  47.66 
 
 		 228 aa  209  3e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  45.79 
 
 		 715 aa  209  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  44.86 
 
 		 241 aa  209  3e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2658  ABC transporter-related protein  48.28 
 
 		 227 aa  208  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  46.6 
 
 		 231 aa  208  4e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  46.48 
 
 		 238 aa  208  5e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.01 
 
 		 227 aa  208  5e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  46.48 
 
 		 225 aa  208  5e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  46.89 
 
 		 246 aa  208  5e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  47.37 
 
 		 234 aa  208  6e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  45.28 
 
 		 229 aa  208  6e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  44.39 
 
 		 225 aa  207  9e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  45.28 
 
 		 238 aa  207  9e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  48.11 
 
 		 657 aa  206  2e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  48.36 
 
 		 258 aa  206  2e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  52.15 
 
 		 233 aa  206  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  46.73 
 
 		 266 aa  206  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  46.89 
 
 		 642 aa  206  2e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0254  ABC transporter related  44.39 
 
 		 241 aa  206  2e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  46.41 
 
 		 234 aa  206  3e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  46.92 
 
 		 237 aa  206  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  48.08 
 
 		 225 aa  205  3e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  46.7 
 
 		 234 aa  205  3e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  48.08 
 
 		 225 aa  205  3e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2439  ABC transporter related  49.76 
 
 		 280 aa  206  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  46.7 
 
 		 234 aa  205  3e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  44.08 
 
 		 230 aa  206  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3644  ABC transporter related  50.24 
 
 		 221 aa  206  3e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  46.92 
 
 		 221 aa  205  4e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3761  ABC transporter related protein  47.17 
 
 		 265 aa  205  5e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  46.41 
 
 		 234 aa  205  5e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  44.81 
 
 		 228 aa  204  7e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  48.11 
 
 		 230 aa  204  9e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  48.58 
 
 		 255 aa  204  9e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  46.53 
 
 		 256 aa  204  9e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  43.87 
 
 		 228 aa  204  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  48.04 
 
 		 236 aa  204  1e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  46.23 
 
 		 242 aa  204  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2042  ABC transporter-related protein  45.79 
 
 		 236 aa  203  1e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  45.5 
 
 		 244 aa  204  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  50.49 
 
 		 238 aa  203  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  42.25 
 
 		 286 aa  203  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  44.34 
 
 		 238 aa  202  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  43.87 
 
 		 236 aa  202  4e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  49.76 
 
 		 253 aa  202  4e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  47.17 
 
 		 238 aa  202  4e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  45.24 
 
 		 228 aa  202  4e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3374  ABC efflux transporter, ATPase subunit  52.5 
 
 		 211 aa  201  8e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1563  ABC transporter related  42.38 
 
 		 249 aa  201  9e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  46.45 
 
 		 252 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  45.97 
 
 		 656 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  46.19 
 
 		 642 aa  200  9.999999999999999e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8342  ABC transporter related  47.89 
 
 		 234 aa  200  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  46.7 
 
 		 232 aa  199  1.9999999999999998e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1252  ABC transporter related  47.64 
 
 		 234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.252759 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  49.52 
 
 		 248 aa  199  1.9999999999999998e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  45.28 
 
 		 227 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  46.23 
 
 		 288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0329  putative ABC transport system, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 226 aa  199  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  44.5 
 
 		 220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  42.45 
 
 		 241 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  47.87 
 
 		 222 aa  199  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3186  ABC transporter related  45.97 
 
 		 252 aa  199  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>