More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1199 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
221 aa  449  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  63.64 
 
 
237 aa  297  7e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  52.97 
 
 
229 aa  246  2e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  51.14 
 
 
226 aa  241  7e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  51.14 
 
 
230 aa  240  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  51.14 
 
 
260 aa  240  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  50.45 
 
 
230 aa  240  1e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 
228 aa  239  2e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  52.51 
 
 
225 aa  239  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  50.45 
 
 
237 aa  239  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  49.77 
 
 
240 aa  237  8e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  49.32 
 
 
253 aa  235  4e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  49.77 
 
 
238 aa  235  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  49.32 
 
 
253 aa  235  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  50.91 
 
 
241 aa  234  6e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  50.91 
 
 
242 aa  234  7e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  51.14 
 
 
240 aa  233  1.0000000000000001e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  49.09 
 
 
246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  48.85 
 
 
653 aa  231  4.0000000000000004e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01531  hypothetical protein  47.27 
 
 
235 aa  231  7.000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003991  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  47.27 
 
 
235 aa  231  7.000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3219  ABC transporter, ATP-binding protein  52.27 
 
 
248 aa  231  9e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.568851  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  50.92 
 
 
643 aa  231  9e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  47.95 
 
 
236 aa  231  9e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  51.15 
 
 
229 aa  229  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  49.1 
 
 
234 aa  228  4e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  49.77 
 
 
293 aa  228  6e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  49.54 
 
 
230 aa  228  6e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  51.61 
 
 
224 aa  228  6e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  51.61 
 
 
224 aa  228  6e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  50.45 
 
 
255 aa  228  6e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  50.47 
 
 
235 aa  228  7e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  51.61 
 
 
224 aa  228  7e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  51.61 
 
 
224 aa  228  8e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  47.27 
 
 
244 aa  227  9e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  50.23 
 
 
224 aa  227  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  46.58 
 
 
239 aa  227  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  48.18 
 
 
230 aa  226  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  50.23 
 
 
225 aa  226  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  51.15 
 
 
224 aa  226  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  51.15 
 
 
224 aa  226  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  45.45 
 
 
226 aa  226  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  51.15 
 
 
224 aa  226  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  50.23 
 
 
225 aa  226  3e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  51.15 
 
 
224 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2150  ABC transporter related  48.64 
 
 
242 aa  224  7e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548805  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1810  putative ATP-binding component of ABC transporter  45.66 
 
 
228 aa  224  7e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.512088  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  49.09 
 
 
234 aa  224  7e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  48.87 
 
 
229 aa  224  7e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  49.31 
 
 
248 aa  224  8e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  50.23 
 
 
224 aa  224  9e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  49.31 
 
 
231 aa  223  1e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  48.18 
 
 
239 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0366  ABC-type transport system, ATPase component PhnL  50 
 
 
245 aa  224  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  50.24 
 
 
236 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  48.39 
 
 
251 aa  223  2e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  49.31 
 
 
234 aa  223  2e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  49.31 
 
 
234 aa  223  2e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  50.69 
 
 
226 aa  222  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3214  ABC transporter related  46.58 
 
 
233 aa  222  3e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.418962  normal  0.11192 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  48.39 
 
 
242 aa  222  4e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  49.31 
 
 
266 aa  222  4e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  47 
 
 
249 aa  221  4.9999999999999996e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  48.39 
 
 
661 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  49.77 
 
 
224 aa  221  6e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  47.27 
 
 
241 aa  221  8e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  50.23 
 
 
226 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  50.69 
 
 
226 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  47.49 
 
 
230 aa  220  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  48.18 
 
 
231 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  50.69 
 
 
226 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  50.23 
 
 
226 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  50.23 
 
 
226 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  50.23 
 
 
226 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  50.23 
 
 
226 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  50.23 
 
 
226 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  48.18 
 
 
229 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0211  ABC transporter related  48.85 
 
 
256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  50.23 
 
 
226 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  50.69 
 
 
226 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  48.18 
 
 
644 aa  219  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  50.92 
 
 
228 aa  219  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  44.91 
 
 
288 aa  219  3e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  48.4 
 
 
241 aa  219  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  46.82 
 
 
244 aa  219  3e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  46.79 
 
 
228 aa  219  3e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  47.93 
 
 
652 aa  219  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2919  ABC transporter related  46.76 
 
 
256 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.388484 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  50.23 
 
 
222 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  50.23 
 
 
226 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  45.66 
 
 
235 aa  218  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  47.71 
 
 
248 aa  218  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5857  ABC transporter related  48.85 
 
 
230 aa  218  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105187  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  47.93 
 
 
238 aa  218  5e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  47.71 
 
 
248 aa  218  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  48.86 
 
 
652 aa  218  6e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0941  ATP binding protein of ABC transporter  50.25 
 
 
218 aa  218  7.999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000194458  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  47.49 
 
 
241 aa  217  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  49.77 
 
 
642 aa  217  1e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  46.08 
 
 
649 aa  216  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>