More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0941 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0941  ATP binding protein of ABC transporter  100 
 
 		 218 aa  439  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000194458  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  60.45 
 
 		 293 aa  276  2e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3170  ABC transporter related protein  63.18 
 
 		 217 aa  271  5.000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0178954  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  59.13 
 
 		 251 aa  259  2e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  58.13 
 
 		 240 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  57.21 
 
 		 238 aa  240  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  55.28 
 
 		 237 aa  230  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  48.54 
 
 		 241 aa  226  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  50.25 
 
 		 221 aa  218  7e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  47.06 
 
 		 235 aa  212  2.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3983  ABC transporter related  50.5 
 
 		 233 aa  212  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  48.61 
 
 		 249 aa  211  5.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  49.5 
 
 		 248 aa  211  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5234  ABC transporter ATP-binding protein  51.74 
 
 		 237 aa  209  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  50.25 
 
 		 226 aa  208  4e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  50.24 
 
 		 277 aa  208  6e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  48.1 
 
 		 260 aa  207  7e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  51.23 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  49.26 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  51.23 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  47.12 
 
 		 262 aa  205  3e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  48.77 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  43.98 
 
 		 249 aa  204  7e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  46.86 
 
 		 286 aa  204  8e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  49.01 
 
 		 225 aa  204  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4028  ABC transporter related  47.26 
 
 		 228 aa  202  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  46 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2703  ABC transporter related  44.6 
 
 		 255 aa  202  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  48.28 
 
 		 251 aa  202  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60790  ABC transporter ATP-binding protein  49.25 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  44.98 
 
 		 255 aa  202  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  50 
 
 		 231 aa  202  4e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  49 
 
 		 225 aa  202  5e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  49 
 
 		 238 aa  201  5e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  47.5 
 
 		 233 aa  201  6e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  48.1 
 
 		 259 aa  201  7e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  47 
 
 		 225 aa  201  7e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  48.02 
 
 		 230 aa  201  8e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  48.74 
 
 		 238 aa  201  9e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3166  ABC transporter related protein  47.26 
 
 		 240 aa  201  9e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.240946  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  48.5 
 
 		 266 aa  200  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  46.45 
 
 		 279 aa  200  9.999999999999999e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  48.77 
 
 		 247 aa  201  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  47.91 
 
 		 225 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  50.5 
 
 		 291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  47.96 
 
 		 228 aa  199  1.9999999999999998e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  47 
 
 		 236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3128  ABC transporter related  48.08 
 
 		 248 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  48.51 
 
 		 225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  53.2 
 
 		 227 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  46.6 
 
 		 236 aa  199  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  46.41 
 
 		 235 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0268  ABC transporter related  51.22 
 
 		 277 aa  199  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000875319 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1913  ABC transporter related  50.75 
 
 		 228 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.598774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  48.77 
 
 		 222 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  48.74 
 
 		 248 aa  198  5e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  46.27 
 
 		 228 aa  198  6e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  44.13 
 
 		 288 aa  197  7e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  44.91 
 
 		 319 aa  197  7e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  45 
 
 		 228 aa  197  9e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  45.93 
 
 		 234 aa  197  9e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2919  ABC transporter related  44.91 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.388484 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2288  ABC transporter, ATPase subunit  50.5 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.979484  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  43.06 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  45.67 
 
 		 253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  45.19 
 
 		 455 aa  196  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  49.5 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  44.5 
 
 		 247 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  45 
 
 		 228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  47.76 
 
 		 226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  44.23 
 
 		 445 aa  196  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  49.49 
 
 		 244 aa  196  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  45.24 
 
 		 240 aa  196  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  45.67 
 
 		 277 aa  196  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2324  ABC transporter related  44.5 
 
 		 256 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  48.76 
 
 		 226 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3238  ABC transporter related  48.5 
 
 		 223 aa  195  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0758948  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5200  putative ABC transporter, ATP binding component  46.77 
 
 		 238 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0864003  normal  0.0646011 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  47.5 
 
 		 246 aa  196  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.19 
 
 		 274 aa  195  4.0000000000000005e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  47.76 
 
 		 230 aa  195  4.0000000000000005e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  51 
 
 		 239 aa  195  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3735  ABC transporter related  48.76 
 
 		 233 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  44.98 
 
 		 234 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  48.26 
 
 		 226 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  48.26 
 
 		 226 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  48.26 
 
 		 226 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  48.26 
 
 		 226 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  48.26 
 
 		 226 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  45.33 
 
 		 229 aa  195  5.000000000000001e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  48.26 
 
 		 226 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  48.26 
 
 		 226 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  51.5 
 
 		 233 aa  195  5.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  48.51 
 
 		 226 aa  195  5.000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  48.26 
 
 		 226 aa  194  6e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  48.26 
 
 		 226 aa  194  6e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  51 
 
 		 232 aa  194  6e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  47.78 
 
 		 227 aa  194  6e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  47.42 
 
 		 240 aa  194  7e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  45.81 
 
 		 288 aa  194  8.000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>