More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8290 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  100 
 
 		 253 aa  499  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  64.45 
 
 		 264 aa  341  8e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  70 
 
 		 261 aa  337  9e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  68.05 
 
 		 277 aa  336  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  68.38 
 
 		 455 aa  333  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  66.4 
 
 		 255 aa  332  4e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  66.24 
 
 		 266 aa  330  1e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  67.84 
 
 		 445 aa  322  4e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  64.17 
 
 		 256 aa  321  5e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  64.49 
 
 		 262 aa  320  9.999999999999999e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  64.83 
 
 		 253 aa  318  5e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  66.25 
 
 		 250 aa  318  6e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  66.38 
 
 		 277 aa  314  9.999999999999999e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  63.98 
 
 		 256 aa  313  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  60.64 
 
 		 291 aa  311  4.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  66.52 
 
 		 247 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  64.47 
 
 		 255 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  64.91 
 
 		 255 aa  306  3e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  65.69 
 
 		 258 aa  305  4.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  67.33 
 
 		 258 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  61.25 
 
 		 258 aa  302  4.0000000000000003e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  62.88 
 
 		 271 aa  300  1e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  60.33 
 
 		 258 aa  298  4e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  63.45 
 
 		 258 aa  298  4e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  64.63 
 
 		 259 aa  298  7e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  66.81 
 
 		 257 aa  293  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  63.72 
 
 		 268 aa  292  4e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  66.22 
 
 		 264 aa  291  5e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  63.14 
 
 		 274 aa  291  8e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  61.14 
 
 		 263 aa  290  2e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 		 279 aa  289  4e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  63.11 
 
 		 280 aa  287  1e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  65.92 
 
 		 288 aa  287  1e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  64.16 
 
 		 244 aa  285  4e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  64.96 
 
 		 312 aa  285  7e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  57.87 
 
 		 255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  63.56 
 
 		 252 aa  282  3.0000000000000004e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  59.35 
 
 		 247 aa  282  4.0000000000000003e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  65.11 
 
 		 257 aa  282  4.0000000000000003e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  61.57 
 
 		 250 aa  281  5.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  60.26 
 
 		 266 aa  280  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  64.1 
 
 		 302 aa  280  2e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  64.29 
 
 		 255 aa  278  6e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  59.67 
 
 		 252 aa  272  4.0000000000000004e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  59.48 
 
 		 243 aa  270  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  59.46 
 
 		 293 aa  268  5.9999999999999995e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  57.2 
 
 		 245 aa  264  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  59.13 
 
 		 256 aa  263  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  57.33 
 
 		 269 aa  261  6e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  53.33 
 
 		 253 aa  259  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  58.95 
 
 		 243 aa  259  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  58.67 
 
 		 271 aa  258  7e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  59.83 
 
 		 241 aa  255  4e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  57.08 
 
 		 279 aa  254  9e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  58.8 
 
 		 249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  58.18 
 
 		 245 aa  251  7e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  60.44 
 
 		 277 aa  248  6e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  58.51 
 
 		 255 aa  248  9e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  57.83 
 
 		 248 aa  246  3e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2247  ABC transporter related protein  57.32 
 
 		 247 aa  246  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.687068  normal  0.0553292 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  52.94 
 
 		 255 aa  244  9.999999999999999e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  53.48 
 
 		 244 aa  241  7e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  57.47 
 
 		 272 aa  241  7.999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  53.36 
 
 		 279 aa  234  9e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  52.15 
 
 		 225 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  47.37 
 
 		 228 aa  228  9e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4805  ABC transporter related protein  58.95 
 
 		 249 aa  228  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  55.42 
 
 		 249 aa  226  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  47.77 
 
 		 240 aa  224  1e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  49.52 
 
 		 225 aa  224  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  53.24 
 
 		 239 aa  224  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  54.85 
 
 		 269 aa  222  4e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0459464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  45.45 
 
 		 230 aa  222  4e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  58.5 
 
 		 224 aa  222  4.9999999999999996e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  47.23 
 
 		 241 aa  221  7e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  44.74 
 
 		 227 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  48.89 
 
 		 252 aa  218  6e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  46.67 
 
 		 229 aa  216  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2457  ABC transporter related protein  55.91 
 
 		 247 aa  211  9e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0887865  hitchhiker  0.00000290657 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  48.36 
 
 		 240 aa  208  6e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  42.41 
 
 		 227 aa  208  7e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  49.3 
 
 		 231 aa  207  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  43.5 
 
 		 248 aa  206  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  47.56 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  42.38 
 
 		 226 aa  207  2e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  47.47 
 
 		 251 aa  205  6e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  47.06 
 
 		 231 aa  205  6e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  46.05 
 
 		 235 aa  205  7e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  46.95 
 
 		 225 aa  204  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  48.37 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  44.2 
 
 		 249 aa  202  4e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  46.4 
 
 		 229 aa  202  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  46.48 
 
 		 228 aa  202  6e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  45.95 
 
 		 229 aa  202  6e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2318  ABC transporter related  51.18 
 
 		 565 aa  202  6e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  44.39 
 
 		 230 aa  201  7e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1628  ABC transporter related protein  49.1 
 
 		 250 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  47.64 
 
 		 266 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  45.16 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  47.11 
 
 		 233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>