More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7899 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  100 
 
 		 277 aa  564  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  72.47 
 
 		 264 aa  363  2e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  72.2 
 
 		 266 aa  355  5e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  67.9 
 
 		 455 aa  336  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  65.2 
 
 		 262 aa  333  1e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  70.09 
 
 		 445 aa  332  5e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  68.24 
 
 		 253 aa  327  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  66.38 
 
 		 277 aa  323  2e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  65.42 
 
 		 256 aa  320  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  63.93 
 
 		 255 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  65.55 
 
 		 255 aa  319  3e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  65.97 
 
 		 255 aa  318  7.999999999999999e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  62.16 
 
 		 291 aa  315  7e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  63.67 
 
 		 247 aa  313  9.999999999999999e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  61.73 
 
 		 253 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  61.98 
 
 		 250 aa  313  2.9999999999999996e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  61.67 
 
 		 259 aa  309  4e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  63.64 
 
 		 256 aa  308  5e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  58.82 
 
 		 258 aa  306  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  63.68 
 
 		 261 aa  306  3e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  64.2 
 
 		 258 aa  304  8.000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  59 
 
 		 258 aa  304  1.0000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  58.8 
 
 		 274 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  62.71 
 
 		 263 aa  301  6.000000000000001e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  59.67 
 
 		 271 aa  300  1e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  65.8 
 
 		 244 aa  300  3e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  62.99 
 
 		 258 aa  297  1e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  63.36 
 
 		 264 aa  296  2e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  63.27 
 
 		 312 aa  296  3e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  65.37 
 
 		 257 aa  296  3e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  62.18 
 
 		 252 aa  295  6e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  59.92 
 
 		 258 aa  293  2e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  60.17 
 
 		 280 aa  290  1e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  59.23 
 
 		 279 aa  291  1e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  62.11 
 
 		 268 aa  290  2e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  60.08 
 
 		 288 aa  287  1e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  60.67 
 
 		 255 aa  285  4e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  60.08 
 
 		 247 aa  281  8.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  61.67 
 
 		 255 aa  280  1e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  57.32 
 
 		 243 aa  280  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  58.66 
 
 		 257 aa  278  6e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  62.39 
 
 		 302 aa  276  2e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  58.02 
 
 		 252 aa  275  4e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  60.34 
 
 		 293 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  59.36 
 
 		 250 aa  267  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  58.22 
 
 		 245 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  53.28 
 
 		 266 aa  265  5e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  55.17 
 
 		 269 aa  259  3e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  53.91 
 
 		 256 aa  258  5.0000000000000005e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  53.54 
 
 		 279 aa  257  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  53.62 
 
 		 243 aa  257  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  56.97 
 
 		 249 aa  256  3e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  51.85 
 
 		 245 aa  254  8e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  51.01 
 
 		 271 aa  253  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  52.26 
 
 		 253 aa  252  5.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  53.72 
 
 		 255 aa  247  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  52.67 
 
 		 241 aa  241  7.999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  54.74 
 
 		 272 aa  239  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  51.49 
 
 		 279 aa  239  4e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  46.19 
 
 		 228 aa  236  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  50.47 
 
 		 225 aa  233  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  52.92 
 
 		 277 aa  232  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  53.54 
 
 		 248 aa  230  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2247  ABC transporter related protein  51.49 
 
 		 247 aa  229  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.687068  normal  0.0553292 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  49.77 
 
 		 225 aa  226  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  54.33 
 
 		 224 aa  226  3e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  52.21 
 
 		 249 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  49.58 
 
 		 244 aa  225  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  47.54 
 
 		 255 aa  224  1e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  45.91 
 
 		 230 aa  223  3e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  48.77 
 
 		 269 aa  223  4e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0459464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  47.09 
 
 		 227 aa  222  4.9999999999999996e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  49.36 
 
 		 240 aa  222  6e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  52.25 
 
 		 239 aa  221  7e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  45.74 
 
 		 226 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  45.3 
 
 		 240 aa  215  5.9999999999999996e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  50.23 
 
 		 228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  46.15 
 
 		 229 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  45.78 
 
 		 230 aa  211  9e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4805  ABC transporter related protein  53.88 
 
 		 249 aa  211  9e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  48.02 
 
 		 227 aa  210  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  43.5 
 
 		 227 aa  207  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2588  ABC transporter related  46.61 
 
 		 247 aa  206  3e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0206492  hitchhiker  0.00398644 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  46.19 
 
 		 252 aa  205  5e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5040  ABC transporter, ATP-binding protein  46.05 
 
 		 246 aa  205  6e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0841  ABC transporter, ATP-binding protein  43.23 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.598404  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  49.28 
 
 		 248 aa  203  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  45.5 
 
 		 235 aa  203  3e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.3 
 
 		 227 aa  202  4e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4777  ABC transporter related  43.68 
 
 		 262 aa  202  5e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2318  ABC transporter related  47.73 
 
 		 565 aa  201  7e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  46.64 
 
 		 266 aa  202  7e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2457  ABC transporter related protein  48.91 
 
 		 247 aa  201  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0887865  hitchhiker  0.00000290657 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  44.67 
 
 		 246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  47.27 
 
 		 227 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  47.35 
 
 		 644 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  43.7 
 
 		 246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  43.7 
 
 		 237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  43.48 
 
 		 225 aa  199  3e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2319  ABC transporter related  46.22 
 
 		 245 aa  199  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>