More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0641 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 279 aa  572  1.0000000000000001e-162  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  73.66 
 
 		 263 aa  375  1e-103  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  65.94 
 
 		 250 aa  318  6e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  61.21 
 
 		 258 aa  310  2e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  64.22 
 
 		 274 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  62.39 
 
 		 271 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  61.28 
 
 		 256 aa  302  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  60.26 
 
 		 247 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  61 
 
 		 259 aa  301  1e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  63.06 
 
 		 255 aa  299  3e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  63.39 
 
 		 277 aa  299  4e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  61.64 
 
 		 258 aa  296  2e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  59.73 
 
 		 445 aa  296  3e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  61.71 
 
 		 255 aa  295  4e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  61.8 
 
 		 258 aa  294  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  58.19 
 
 		 280 aa  292  4e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  59.23 
 
 		 277 aa  291  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  64.06 
 
 		 257 aa  291  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  58.12 
 
 		 262 aa  290  2e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  58.82 
 
 		 268 aa  289  4e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  58.37 
 
 		 253 aa  288  8e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  56.52 
 
 		 264 aa  286  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  59.38 
 
 		 256 aa  285  7e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  58.9 
 
 		 264 aa  285  8e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  60.27 
 
 		 253 aa  284  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  58.15 
 
 		 258 aa  283  2.0000000000000002e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  55.34 
 
 		 255 aa  282  4.0000000000000003e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  55.79 
 
 		 291 aa  281  7.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  55.65 
 
 		 455 aa  281  7.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  62.26 
 
 		 244 aa  281  9e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  52.79 
 
 		 255 aa  279  3e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  59.73 
 
 		 250 aa  276  3e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  58.15 
 
 		 252 aa  276  4e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  53.56 
 
 		 288 aa  275  5e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  57.14 
 
 		 266 aa  275  6e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  55.71 
 
 		 261 aa  273  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  59.55 
 
 		 245 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  55.51 
 
 		 312 aa  264  1e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  57.85 
 
 		 302 aa  262  4.999999999999999e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  54.39 
 
 		 279 aa  261  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  56.39 
 
 		 247 aa  259  5.0000000000000005e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  52.85 
 
 		 293 aa  257  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  53.48 
 
 		 266 aa  257  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  52.32 
 
 		 269 aa  256  3e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  52.44 
 
 		 258 aa  254  8e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  52.4 
 
 		 252 aa  254  9e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  51.43 
 
 		 255 aa  249  4e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  52.63 
 
 		 243 aa  247  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  52.49 
 
 		 243 aa  247  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  50.21 
 
 		 249 aa  246  4e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  52.09 
 
 		 228 aa  245  6e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  50 
 
 		 255 aa  241  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  50.43 
 
 		 245 aa  240  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  53.88 
 
 		 257 aa  239  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  52.34 
 
 		 241 aa  238  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  50 
 
 		 271 aa  236  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  50.64 
 
 		 277 aa  234  9e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  48.7 
 
 		 256 aa  231  8.000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  55.61 
 
 		 224 aa  228  6e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  50.85 
 
 		 279 aa  228  7e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  51.65 
 
 		 249 aa  227  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  46.05 
 
 		 230 aa  225  5.0000000000000005e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  49.78 
 
 		 272 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2247  ABC transporter related protein  51.05 
 
 		 247 aa  223  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.687068  normal  0.0553292 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  49.3 
 
 		 227 aa  223  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  45.41 
 
 		 253 aa  222  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  47.37 
 
 		 225 aa  217  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  47.91 
 
 		 226 aa  217  2e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  46.35 
 
 		 241 aa  215  8e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  46.73 
 
 		 229 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  47.19 
 
 		 266 aa  214  9.999999999999999e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  44.3 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1451  ABC transporter related  48.68 
 
 		 254 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.388057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  48.1 
 
 		 269 aa  211  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0459464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  45.62 
 
 		 226 aa  209  3e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2457  ABC transporter related protein  51.15 
 
 		 247 aa  209  3e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0887865  hitchhiker  0.00000290657 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  46.9 
 
 		 240 aa  209  4e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  48.42 
 
 		 248 aa  208  7e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2042  ABC transporter-related protein  49.32 
 
 		 236 aa  207  1e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  45.79 
 
 		 239 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  50 
 
 		 235 aa  208  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  47.69 
 
 		 228 aa  207  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  47.62 
 
 		 225 aa  206  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  43.62 
 
 		 260 aa  206  4e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  48.89 
 
 		 239 aa  205  8e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  45.12 
 
 		 227 aa  204  9e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  50.25 
 
 		 658 aa  204  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  49.31 
 
 		 227 aa  204  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0211  ABC transporter related  46.58 
 
 		 256 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2702  ABC transporter related  46.33 
 
 		 251 aa  204  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2646  ABC transporter related  46.33 
 
 		 251 aa  204  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8875  ABC transporter-related protein  44.54 
 
 		 243 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0534003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  44.96 
 
 		 246 aa  203  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4805  ABC transporter related protein  51.95 
 
 		 249 aa  203  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3270  ABC transporter-like protein  43.53 
 
 		 248 aa  202  4e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.180128 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3186  ABC transporter related  45.81 
 
 		 252 aa  202  7e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  44.12 
 
 		 244 aa  201  9e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  43.05 
 
 		 238 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  45.66 
 
 		 240 aa  201  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0941  ATP binding protein of ABC transporter  46.45 
 
 		 218 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000194458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>