More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1914 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  100 
 
 		 272 aa  542  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  59.92 
 
 		 266 aa  280  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  61.6 
 
 		 252 aa  279  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  60.25 
 
 		 243 aa  274  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  57.32 
 
 		 264 aa  270  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  59.91 
 
 		 255 aa  265  5e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  56.49 
 
 		 245 aa  257  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  55.93 
 
 		 455 aa  256  4e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  56.54 
 
 		 269 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  58.61 
 
 		 277 aa  253  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  57.74 
 
 		 266 aa  250  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  55.93 
 
 		 279 aa  249  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  58.26 
 
 		 258 aa  248  9e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  53.17 
 
 		 277 aa  247  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  54.66 
 
 		 271 aa  248  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  56.72 
 
 		 243 aa  246  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  59.75 
 
 		 249 aa  247  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  55.51 
 
 		 262 aa  246  3e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  56.41 
 
 		 247 aa  246  4e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  57.71 
 
 		 253 aa  245  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  59.91 
 
 		 256 aa  245  6e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  54.47 
 
 		 252 aa  244  8e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  54.01 
 
 		 256 aa  244  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  55.65 
 
 		 445 aa  243  3e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  51.05 
 
 		 258 aa  239  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  53.19 
 
 		 253 aa  239  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  58.15 
 
 		 250 aa  239  5e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  54.55 
 
 		 255 aa  238  6.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  57.92 
 
 		 241 aa  238  9e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  57.51 
 
 		 312 aa  237  1e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  54.78 
 
 		 255 aa  238  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  53.33 
 
 		 259 aa  238  1e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50.4 
 
 		 274 aa  238  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  53.65 
 
 		 247 aa  236  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  55.17 
 
 		 255 aa  237  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  55.56 
 
 		 280 aa  236  3e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  52.23 
 
 		 268 aa  235  5.0000000000000005e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  52.85 
 
 		 277 aa  235  7e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  54.2 
 
 		 258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  55.66 
 
 		 256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  61.17 
 
 		 224 aa  234  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  54.26 
 
 		 264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  54.78 
 
 		 255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  51.9 
 
 		 263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  53.39 
 
 		 244 aa  233  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  58.11 
 
 		 257 aa  233  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  52.54 
 
 		 253 aa  232  4.0000000000000004e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  50.66 
 
 		 258 aa  231  9e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  53.51 
 
 		 250 aa  231  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  56.28 
 
 		 258 aa  230  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  56.8 
 
 		 244 aa  230  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  51.46 
 
 		 271 aa  230  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  50.78 
 
 		 291 aa  229  4e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  55.32 
 
 		 257 aa  228  6e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  49.13 
 
 		 279 aa  227  1e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  52.4 
 
 		 261 aa  227  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  51.93 
 
 		 288 aa  225  5.0000000000000005e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  51.04 
 
 		 293 aa  223  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  57.59 
 
 		 248 aa  220  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  54.27 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  56.65 
 
 		 239 aa  218  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2247  ABC transporter related protein  56.03 
 
 		 247 aa  216  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.687068  normal  0.0553292 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  49.36 
 
 		 279 aa  216  4e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2703  ABC transporter related  46.28 
 
 		 255 aa  216  5e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4805  ABC transporter related protein  59 
 
 		 249 aa  215  7e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  48.54 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  53.48 
 
 		 302 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  52.3 
 
 		 269 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0459464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  53.74 
 
 		 245 aa  212  5.999999999999999e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  48.05 
 
 		 240 aa  210  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  56.05 
 
 		 249 aa  209  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2781  ABC transporter related  45.02 
 
 		 252 aa  209  4e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2724  ABC transporter related  45.02 
 
 		 252 aa  209  4e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  50.98 
 
 		 240 aa  209  5e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  51.21 
 
 		 251 aa  208  8e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  46.22 
 
 		 235 aa  207  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  49.76 
 
 		 241 aa  206  4e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  43.5 
 
 		 228 aa  204  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1518  ABC transporter-related protein  50 
 
 		 228 aa  204  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  50.23 
 
 		 288 aa  203  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  46.33 
 
 		 221 aa  203  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  48.62 
 
 		 231 aa  202  4e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  47.11 
 
 		 231 aa  202  7e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2324  ABC transporter related  45.33 
 
 		 256 aa  201  8e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  51.44 
 
 		 252 aa  201  8e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  45.29 
 
 		 225 aa  201  8e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  45.21 
 
 		 246 aa  201  8e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4690  ABC transporter, nucleotide binding/ATPase protein  53 
 
 		 243 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0429336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1004  ABC transporter-related protein  49.55 
 
 		 230 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  47.6 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  50.88 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4354  ABC transporter related  49.55 
 
 		 230 aa  199  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0955  ABC transporter related protein  51.14 
 
 		 240 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0487401  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  49.05 
 
 		 231 aa  199  3.9999999999999996e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4731  ABC transporter ATP-binding protein  44.05 
 
 		 250 aa  199  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4571  ABC transporter, ATP-binding protein  44.05 
 
 		 250 aa  199  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00946862  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5091  ABC transporter ATP-binding protein  44.05 
 
 		 250 aa  199  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  48.68 
 
 		 277 aa  199  5e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4952  ABC transporter, ATP-binding protein  44.05 
 
 		 250 aa  199  5e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  47.19 
 
 		 228 aa  199  5e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>