More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2824 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  100 
 
 		 268 aa  522  1e-147  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  74.33 
 
 		 277 aa  378  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  75.2 
 
 		 271 aa  374  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  70.72 
 
 		 274 aa  366  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  72.92 
 
 		 258 aa  356  1.9999999999999998e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  71.61 
 
 		 247 aa  342  4e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  73.62 
 
 		 280 aa  337  9.999999999999999e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  71.61 
 
 		 250 aa  332  3e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  67.76 
 
 		 256 aa  329  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  70.42 
 
 		 258 aa  330  2e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  64.31 
 
 		 258 aa  327  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  66.12 
 
 		 266 aa  325  4.0000000000000003e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  62.4 
 
 		 263 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  67.49 
 
 		 258 aa  320  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  66.96 
 
 		 255 aa  316  3e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  71.02 
 
 		 257 aa  315  5e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  63.98 
 
 		 455 aa  312  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  64.54 
 
 		 252 aa  312  2.9999999999999996e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  65.65 
 
 		 255 aa  311  7.999999999999999e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  60.32 
 
 		 264 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  62.7 
 
 		 255 aa  304  9.000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  62.93 
 
 		 256 aa  303  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  64.78 
 
 		 262 aa  301  9e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  62.76 
 
 		 253 aa  301  9e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  72.43 
 
 		 250 aa  299  3e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  59.84 
 
 		 255 aa  298  8e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  64.73 
 
 		 445 aa  296  2e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  60.41 
 
 		 259 aa  295  4e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  61.28 
 
 		 277 aa  294  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  63.72 
 
 		 253 aa  291  9e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  58.61 
 
 		 279 aa  291  1e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  61.47 
 
 		 264 aa  290  2e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  63.56 
 
 		 245 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  58.37 
 
 		 288 aa  285  5e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  61.4 
 
 		 261 aa  284  1.0000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  61.3 
 
 		 244 aa  284  1.0000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  56.15 
 
 		 291 aa  282  5.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  61.48 
 
 		 302 aa  281  6.000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  62.71 
 
 		 247 aa  276  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  61.16 
 
 		 312 aa  272  4.0000000000000004e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  60.43 
 
 		 245 aa  271  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  60.57 
 
 		 255 aa  270  1e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  58.13 
 
 		 279 aa  268  5.9999999999999995e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  65.11 
 
 		 258 aa  268  8e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  62.45 
 
 		 277 aa  265  4e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  60.17 
 
 		 255 aa  261  8e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  56.49 
 
 		 293 aa  259  3e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  60.09 
 
 		 256 aa  258  8e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  59.21 
 
 		 243 aa  258  9e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  56.14 
 
 		 253 aa  251  7e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  58.08 
 
 		 252 aa  251  7e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  57.44 
 
 		 257 aa  250  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  55.42 
 
 		 266 aa  250  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  56.02 
 
 		 279 aa  246  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  56.5 
 
 		 269 aa  245  4.9999999999999997e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  59.92 
 
 		 249 aa  243  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  49.54 
 
 		 225 aa  240  1e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  55.13 
 
 		 271 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  59.33 
 
 		 243 aa  238  6.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  47.73 
 
 		 228 aa  237  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  57.85 
 
 		 249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  56.56 
 
 		 244 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  47.03 
 
 		 230 aa  234  1.0000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  57.56 
 
 		 241 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  55.07 
 
 		 272 aa  231  9e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  53.71 
 
 		 255 aa  230  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  48.62 
 
 		 225 aa  229  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2247  ABC transporter related protein  56.25 
 
 		 247 aa  223  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.687068  normal  0.0553292 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  46.9 
 
 		 230 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  46.3 
 
 		 227 aa  218  6e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  43.84 
 
 		 226 aa  218  7.999999999999999e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  50.65 
 
 		 239 aa  217  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  45.66 
 
 		 229 aa  218  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  56.68 
 
 		 248 aa  217  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  48.23 
 
 		 240 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  59.61 
 
 		 224 aa  214  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4805  ABC transporter related protein  57.02 
 
 		 249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  52.46 
 
 		 269 aa  212  3.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0459464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  47.93 
 
 		 228 aa  210  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  44.78 
 
 		 248 aa  209  5e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2457  ABC transporter related protein  55.7 
 
 		 247 aa  209  5e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0887865  hitchhiker  0.00000290657 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  48.62 
 
 		 241 aa  208  8e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  44.29 
 
 		 240 aa  207  1e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  51.97 
 
 		 244 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  47.56 
 
 		 246 aa  207  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  53.64 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  48.42 
 
 		 252 aa  207  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  51.97 
 
 		 244 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  47.75 
 
 		 222 aa  206  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  48.52 
 
 		 653 aa  206  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  46.01 
 
 		 225 aa  204  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2703  ABC transporter related  46.61 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  50.23 
 
 		 228 aa  204  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  47.09 
 
 		 228 aa  204  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  47.96 
 
 		 229 aa  203  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  41.3 
 
 		 246 aa  204  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  44.49 
 
 		 238 aa  203  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  49.14 
 
 		 233 aa  203  3e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  48.42 
 
 		 224 aa  203  3e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  45.87 
 
 		 249 aa  202  5e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>