More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1745 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  100 
 
 		 256 aa  513  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  83.47 
 
 		 247 aa  414  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  71.43 
 
 		 250 aa  347  1e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  71.61 
 
 		 255 aa  344  7e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  73.8 
 
 		 255 aa  344  8e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  71.73 
 
 		 252 aa  342  4e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  73.04 
 
 		 255 aa  341  5e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  69.46 
 
 		 455 aa  338  4e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  76.55 
 
 		 257 aa  338  7e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  67.95 
 
 		 291 aa  332  5e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  64.2 
 
 		 262 aa  330  9e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  68.35 
 
 		 280 aa  330  9e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  68.38 
 
 		 256 aa  330  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  68.33 
 
 		 253 aa  328  4e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  65.57 
 
 		 277 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  67.36 
 
 		 264 aa  326  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  68.4 
 
 		 268 aa  325  5e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  68.24 
 
 		 258 aa  325  6e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  66.94 
 
 		 258 aa  323  2e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  70.48 
 
 		 445 aa  320  9.999999999999999e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  66.11 
 
 		 258 aa  319  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  65.97 
 
 		 271 aa  319  3e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  67.98 
 
 		 253 aa  318  3.9999999999999996e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  68.56 
 
 		 258 aa  317  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  64.17 
 
 		 259 aa  315  5e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  66.52 
 
 		 264 aa  314  8e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  65.52 
 
 		 266 aa  313  9.999999999999999e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  62.75 
 
 		 274 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  64.68 
 
 		 263 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  65.95 
 
 		 255 aa  312  3.9999999999999997e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  65.07 
 
 		 261 aa  311  9e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  60.77 
 
 		 288 aa  310  2e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  63.64 
 
 		 277 aa  308  4e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  61.28 
 
 		 279 aa  302  3.0000000000000004e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  64.38 
 
 		 250 aa  294  8e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  68.22 
 
 		 258 aa  293  2e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  61.32 
 
 		 279 aa  290  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  65.67 
 
 		 312 aa  288  5.0000000000000004e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  65.2 
 
 		 244 aa  285  5e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  60.5 
 
 		 247 aa  283  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  63.68 
 
 		 255 aa  278  7e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  57.98 
 
 		 252 aa  277  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  61.9 
 
 		 302 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  60.36 
 
 		 245 aa  270  2e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  58.12 
 
 		 293 aa  269  2.9999999999999997e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  55.6 
 
 		 243 aa  268  5e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  58.7 
 
 		 269 aa  268  5.9999999999999995e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  60.5 
 
 		 277 aa  267  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  60 
 
 		 245 aa  267  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  57.02 
 
 		 256 aa  263  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  60 
 
 		 257 aa  259  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  56.47 
 
 		 266 aa  259  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  56.25 
 
 		 255 aa  259  4e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  55.28 
 
 		 249 aa  256  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  57.98 
 
 		 241 aa  255  4e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  52.12 
 
 		 253 aa  253  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  54.24 
 
 		 244 aa  249  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  53.36 
 
 		 248 aa  241  1e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  57.44 
 
 		 249 aa  235  4e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  51.06 
 
 		 279 aa  234  8e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  55.66 
 
 		 272 aa  234  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  49.32 
 
 		 228 aa  232  5e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 240 aa  229  5e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  53.88 
 
 		 243 aa  229  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  51.05 
 
 		 239 aa  228  7e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  57.21 
 
 		 224 aa  228  9e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  47.66 
 
 		 230 aa  227  1e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4805  ABC transporter related protein  57.32 
 
 		 249 aa  227  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  51.3 
 
 		 255 aa  227  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  50.22 
 
 		 271 aa  224  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  49.76 
 
 		 225 aa  222  4e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0222  ABC transporter related  53.85 
 
 		 247 aa  220  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256244  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  45.91 
 
 		 240 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  51.11 
 
 		 233 aa  220  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  49.77 
 
 		 266 aa  219  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  49.3 
 
 		 225 aa  219  5e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  46.76 
 
 		 229 aa  216  4e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2247  ABC transporter related protein  50.83 
 
 		 247 aa  215  5e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.687068  normal  0.0553292 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  52.31 
 
 		 228 aa  215  5e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2457  ABC transporter related protein  53.39 
 
 		 247 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0887865  hitchhiker  0.00000290657 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  48.39 
 
 		 237 aa  214  8e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1083  ABC transporter related  49.78 
 
 		 240 aa  214  9e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  42.86 
 
 		 248 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  45.05 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  48.87 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  47.39 
 
 		 241 aa  212  5.999999999999999e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 221 aa  212  5.999999999999999e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  49.53 
 
 		 242 aa  211  7e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0021  ABC transporter, ATP-binding protein  44.86 
 
 		 252 aa  211  7.999999999999999e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  44.29 
 
 		 227 aa  210  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0314  ABC transporter, ATP-binding protein  45.5 
 
 		 253 aa  209  3e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.924183  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  45.74 
 
 		 230 aa  209  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  48.11 
 
 		 230 aa  209  5e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  44.19 
 
 		 226 aa  208  6e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  44.87 
 
 		 246 aa  208  6e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2318  ABC transporter related  49.54 
 
 		 565 aa  208  6e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  47.44 
 
 		 229 aa  208  7e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  52.27 
 
 		 238 aa  208  8e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0684  ABC transporter related  46.02 
 
 		 253 aa  208  8e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.511677  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0699  ABC transporter related  46.02 
 
 		 253 aa  208  8e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.184929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>