More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0287 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  100 
 
 
240 aa  484  1e-136  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3170  ABC transporter related protein  58.05 
 
 
217 aa  255  5e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0178954  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0941  ATP binding protein of ABC transporter  58.13 
 
 
218 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000194458  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  53.42 
 
 
238 aa  251  7e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  52.25 
 
 
293 aa  251  8.000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  48.12 
 
 
239 aa  249  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  48.64 
 
 
251 aa  249  4e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  52.23 
 
 
241 aa  246  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 
228 aa  235  5.0000000000000005e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  49.55 
 
 
226 aa  234  9e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  50.92 
 
 
237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  51.14 
 
 
221 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  47.41 
 
 
260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  50.68 
 
 
225 aa  233  3e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  50.92 
 
 
226 aa  233  3e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  48.4 
 
 
233 aa  232  4.0000000000000004e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  46.9 
 
 
258 aa  231  5e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  49.32 
 
 
221 aa  231  6e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  48.2 
 
 
236 aa  229  3e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  47.03 
 
 
252 aa  229  3e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  48.86 
 
 
232 aa  228  7e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  48.4 
 
 
239 aa  227  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  49.77 
 
 
229 aa  226  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  49.32 
 
 
229 aa  226  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  47.75 
 
 
240 aa  226  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  49.32 
 
 
228 aa  226  3e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  47.03 
 
 
234 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  46.96 
 
 
255 aa  226  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  46.15 
 
 
248 aa  225  4e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  47.95 
 
 
231 aa  225  5.0000000000000005e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  48.86 
 
 
231 aa  224  6e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.78 
 
 
280 aa  224  8e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  48.4 
 
 
222 aa  224  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  44.75 
 
 
225 aa  224  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  45.22 
 
 
277 aa  224  1e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  46.82 
 
 
247 aa  224  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.16 
 
 
264 aa  224  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  48.2 
 
 
233 aa  223  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  45.91 
 
 
233 aa  223  2e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  45 
 
 
247 aa  223  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  47.77 
 
 
253 aa  223  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  47.95 
 
 
228 aa  223  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  47.56 
 
 
228 aa  223  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  49.32 
 
 
230 aa  223  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  48.18 
 
 
230 aa  223  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  49.55 
 
 
256 aa  222  3e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  44 
 
 
249 aa  222  3e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  44.59 
 
 
236 aa  222  4.9999999999999996e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  44.93 
 
 
262 aa  221  6e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  48.4 
 
 
229 aa  221  6e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  45.25 
 
 
228 aa  221  7e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  42.26 
 
 
288 aa  221  8e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  47.95 
 
 
222 aa  221  8e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  45.96 
 
 
257 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  45.62 
 
 
235 aa  221  9.999999999999999e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  49.77 
 
 
230 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  45.05 
 
 
249 aa  220  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  45.61 
 
 
258 aa  219  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  46.15 
 
 
225 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  47.03 
 
 
231 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  45.91 
 
 
256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  45.98 
 
 
715 aa  219  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  45.41 
 
 
266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6611  ABC transporter related  46.33 
 
 
660 aa  219  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.961968 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  44.14 
 
 
227 aa  219  3e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5234  ABC transporter ATP-binding protein  47.37 
 
 
237 aa  219  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  46.82 
 
 
246 aa  219  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  47.49 
 
 
234 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  46.12 
 
 
253 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3128  ABC transporter related  45.95 
 
 
248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  46.82 
 
 
235 aa  219  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  46.82 
 
 
244 aa  219  3.9999999999999997e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  45.26 
 
 
312 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  44.44 
 
 
242 aa  218  5e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1004  ABC transporter-related protein  45.21 
 
 
230 aa  218  5e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  47.32 
 
 
230 aa  218  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.64 
 
 
234 aa  218  5e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  46.12 
 
 
253 aa  218  6e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  47.96 
 
 
230 aa  218  6e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  46.46 
 
 
707 aa  218  6e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  46.26 
 
 
455 aa  218  7e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0252  ABC transporter related  41.59 
 
 
244 aa  218  7e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1635  ABC transporter related  44.34 
 
 
229 aa  218  7.999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  47.03 
 
 
643 aa  217  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  42.99 
 
 
247 aa  217  1e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  50.23 
 
 
225 aa  218  1e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  50.23 
 
 
225 aa  218  1e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  47.03 
 
 
240 aa  217  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1457  ABC transporter related  47.95 
 
 
228 aa  217  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  45.78 
 
 
238 aa  217  1e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5857  ABC transporter related  46.67 
 
 
230 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105187  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  48.4 
 
 
252 aa  216  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4456  ABC transporter related protein  45.45 
 
 
239 aa  216  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  47.51 
 
 
238 aa  216  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3214  ABC transporter related  43.75 
 
 
233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.418962  normal  0.11192 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  44.49 
 
 
266 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  44.07 
 
 
239 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  46.26 
 
 
228 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0630  ABC transporter related  45.5 
 
 
268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0423789 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  43.04 
 
 
255 aa  215  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283122 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>