More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3705 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  100 
 
 		 293 aa  598  1e-170  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  56.84 
 
 		 251 aa  282  5.000000000000001e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0941  ATP binding protein of ABC transporter  60.45 
 
 		 218 aa  276  4e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000194458  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3170  ABC transporter related protein  62.75 
 
 		 217 aa  271  9e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0178954  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  58.04 
 
 		 238 aa  269  4e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  52.25 
 
 		 240 aa  251  1e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  47.11 
 
 		 235 aa  230  2e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  45.11 
 
 		 241 aa  229  4e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 221 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  48.87 
 
 		 237 aa  226  4e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  48.66 
 
 		 231 aa  225  8e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  46.4 
 
 		 249 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  44.16 
 
 		 259 aa  221  9.999999999999999e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  46.88 
 
 		 234 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  46.88 
 
 		 234 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  44.44 
 
 		 230 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  44.1 
 
 		 248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  47.27 
 
 		 235 aa  218  7e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  47.77 
 
 		 228 aa  218  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  45.29 
 
 		 277 aa  218  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  47.35 
 
 		 231 aa  218  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  47.27 
 
 		 231 aa  216  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  45.7 
 
 		 244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  43.04 
 
 		 238 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  46.36 
 
 		 225 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  46.3 
 
 		 235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  42.98 
 
 		 253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  47.03 
 
 		 225 aa  216  4e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  45.33 
 
 		 228 aa  216  5e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  47.49 
 
 		 246 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  40.39 
 
 		 264 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  45.7 
 
 		 231 aa  215  8e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  46.15 
 
 		 246 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  43.78 
 
 		 234 aa  214  9.999999999999999e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  45.53 
 
 		 236 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  45.45 
 
 		 226 aa  213  2.9999999999999995e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  45.58 
 
 		 264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  42.48 
 
 		 239 aa  213  3.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  43.78 
 
 		 260 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  43.44 
 
 		 253 aa  212  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  43.36 
 
 		 233 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  46.12 
 
 		 266 aa  211  7.999999999999999e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  43.44 
 
 		 253 aa  211  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  44.75 
 
 		 230 aa  211  7.999999999999999e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  44.39 
 
 		 238 aa  211  9e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3214  ABC transporter related  41.48 
 
 		 233 aa  211  1e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.418962  normal  0.11192 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  44.54 
 
 		 228 aa  211  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  47.73 
 
 		 234 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  43.52 
 
 		 230 aa  210  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  40.64 
 
 		 247 aa  210  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3166  ABC transporter related protein  45.37 
 
 		 240 aa  210  2e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.240946  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2038  ABC transporter related  43.58 
 
 		 233 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.376795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  42.92 
 
 		 225 aa  211  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1635  ABC transporter related  42.15 
 
 		 229 aa  210  2e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  48.44 
 
 		 232 aa  210  3e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  42.73 
 
 		 228 aa  209  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  41.26 
 
 		 247 aa  209  4e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  44.89 
 
 		 255 aa  209  5e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  45.74 
 
 		 222 aa  208  7e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  44.24 
 
 		 220 aa  208  7e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  44.75 
 
 		 226 aa  208  7e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0366  ABC-type transport system, ATPase component PhnL  44.2 
 
 		 245 aa  208  8e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  41.44 
 
 		 236 aa  208  9e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  43.88 
 
 		 240 aa  207  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  45.25 
 
 		 241 aa  208  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  44.1 
 
 		 277 aa  207  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  42.32 
 
 		 286 aa  207  1e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  41.1 
 
 		 234 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  43.81 
 
 		 236 aa  207  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  44.93 
 
 		 229 aa  208  1e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  42.29 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  42.36 
 
 		 233 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  42.22 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  40.6 
 
 		 274 aa  207  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  44.8 
 
 		 224 aa  207  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  41.3 
 
 		 288 aa  207  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0183  ABC transporter related  42.48 
 
 		 226 aa  206  3e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.337585  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0188  ABC transporter related  42.48 
 
 		 226 aa  206  3e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3128  ABC transporter related  44.25 
 
 		 248 aa  206  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  46.82 
 
 		 234 aa  206  3e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  45.66 
 
 		 232 aa  206  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  43.44 
 
 		 258 aa  206  4e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  44.59 
 
 		 230 aa  206  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6611  ABC transporter related  42.6 
 
 		 660 aa  206  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.961968 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  41.7 
 
 		 228 aa  206  4e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  46.82 
 
 		 234 aa  206  4e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1479  ABC transporter related  41.95 
 
 		 240 aa  206  4e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003991  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  44.5 
 
 		 235 aa  206  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  45.66 
 
 		 239 aa  206  5e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  43.1 
 
 		 236 aa  206  5e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1457  ABC transporter related  47.2 
 
 		 228 aa  206  5e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  42.17 
 
 		 241 aa  206  5e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  43.78 
 
 		 220 aa  206  5e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2150  ABC transporter related  43.36 
 
 		 242 aa  205  7e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  44.39 
 
 		 242 aa  205  8e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  41.89 
 
 		 228 aa  205  8e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  45 
 
 		 229 aa  205  8e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  45.29 
 
 		 235 aa  205  9e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  45.91 
 
 		 241 aa  205  9e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  41.09 
 
 		 885 aa  204  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>