More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1243 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  100 
 
 		 229 aa  457  9.999999999999999e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  58.72 
 
 		 225 aa  277  8e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  59.82 
 
 		 225 aa  270  1e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  55.45 
 
 		 227 aa  256  2e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  55.3 
 
 		 230 aa  248  4e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  51.82 
 
 		 228 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  49.1 
 
 		 263 aa  235  4e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  53.6 
 
 		 226 aa  234  7e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  49.55 
 
 		 227 aa  233  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1536  ABC transporter related  50.9 
 
 		 226 aa  232  3e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38165  normal  0.0345919 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  47.27 
 
 		 255 aa  230  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  50 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  48.64 
 
 		 221 aa  225  4e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  49.32 
 
 		 293 aa  225  4e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  48.87 
 
 		 221 aa  224  8e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  48.15 
 
 		 258 aa  224  8e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  48.86 
 
 		 253 aa  223  1e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  48.61 
 
 		 277 aa  223  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  48.4 
 
 		 247 aa  223  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  49.54 
 
 		 245 aa  223  2e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.49 
 
 		 280 aa  223  2e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  45.21 
 
 		 269 aa  222  3e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1852  ABC transporter, ATP-binding protein  46.53 
 
 		 250 aa  222  4e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000122663  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  48.64 
 
 		 237 aa  221  6e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  48.4 
 
 		 240 aa  221  6e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  46.73 
 
 		 291 aa  220  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  46.9 
 
 		 253 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  46.9 
 
 		 253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  46.58 
 
 		 228 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  46.7 
 
 		 256 aa  218  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  47.64 
 
 		 255 aa  218  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  48.67 
 
 		 246 aa  218  5e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  46.51 
 
 		 268 aa  217  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  47.22 
 
 		 258 aa  217  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  47.49 
 
 		 255 aa  217  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  48 
 
 		 248 aa  216  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  47.98 
 
 		 226 aa  216  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  49.78 
 
 		 644 aa  216  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  46.67 
 
 		 253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  48.46 
 
 		 235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  46.19 
 
 		 226 aa  216  2.9999999999999998e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  46.76 
 
 		 256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  46.9 
 
 		 252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  47.3 
 
 		 258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  47.49 
 
 		 319 aa  215  4e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  48.85 
 
 		 222 aa  215  5e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  47.03 
 
 		 250 aa  215  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  46.12 
 
 		 455 aa  215  5e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  48.86 
 
 		 279 aa  215  5.9999999999999996e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  46.05 
 
 		 244 aa  214  5.9999999999999996e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  46.61 
 
 		 234 aa  214  7e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  47.17 
 
 		 255 aa  214  7e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.75 
 
 		 274 aa  214  9e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  46.67 
 
 		 258 aa  213  9.999999999999999e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  46.73 
 
 		 279 aa  214  9.999999999999999e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  46.12 
 
 		 228 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  45.98 
 
 		 237 aa  213  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  46.15 
 
 		 277 aa  213  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  44.95 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  47.32 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2318  ABC transporter related  44.34 
 
 		 565 aa  212  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  48 
 
 		 241 aa  212  3.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  45.98 
 
 		 230 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  47.51 
 
 		 228 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  47.25 
 
 		 271 aa  212  3.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  46.36 
 
 		 228 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  45.66 
 
 		 252 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  48.42 
 
 		 222 aa  211  4.9999999999999996e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  50.22 
 
 		 642 aa  211  4.9999999999999996e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  48.4 
 
 		 286 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  47.56 
 
 		 240 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  46.7 
 
 		 234 aa  211  5.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  46.76 
 
 		 302 aa  211  7e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  45.09 
 
 		 228 aa  211  7e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  47.47 
 
 		 239 aa  211  7.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  48.43 
 
 		 230 aa  211  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  48.05 
 
 		 642 aa  210  1e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  46.46 
 
 		 232 aa  210  2e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5857  ABC transporter related  46.82 
 
 		 230 aa  209  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105187  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.67 
 
 		 234 aa  210  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  46.12 
 
 		 229 aa  209  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  46.19 
 
 		 234 aa  209  2e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  45.91 
 
 		 258 aa  209  3e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  46.43 
 
 		 225 aa  209  3e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0222  ABC transporter related  43.56 
 
 		 247 aa  209  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256244  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  44.91 
 
 		 271 aa  209  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1757  ABC transporter ATP-binding protein  43.05 
 
 		 235 aa  209  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.245254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3212  cyclic nucleotide-binding protein  43.95 
 
 		 388 aa  209  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  42.99 
 
 		 259 aa  209  3e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  47.03 
 
 		 228 aa  209  4e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  41.26 
 
 		 288 aa  208  4e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  43.58 
 
 		 266 aa  209  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 262 aa  209  4e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0437  ABC transporter related protein  45.95 
 
 		 229 aa  208  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  46.12 
 
 		 229 aa  208  5e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  42.92 
 
 		 264 aa  208  6e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2175  ABC transporter related protein  48.46 
 
 		 274 aa  208  6e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  46.85 
 
 		 238 aa  207  7e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  45.5 
 
 		 234 aa  207  8e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  48.18 
 
 		 241 aa  207  9e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>