More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1874 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  100 
 
 		 258 aa  519  1e-146  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  80.32 
 
 		 274 aa  404  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  75.61 
 
 		 277 aa  371  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  73.97 
 
 		 271 aa  369  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  73.19 
 
 		 268 aa  353  1e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  67.22 
 
 		 247 aa  326  3e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  66.67 
 
 		 258 aa  325  6e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  68.24 
 
 		 256 aa  325  6e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  67.77 
 
 		 250 aa  324  8.000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  65.98 
 
 		 258 aa  321  6e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  66.81 
 
 		 280 aa  320  1.9999999999999998e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  64.83 
 
 		 263 aa  315  4e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  64.58 
 
 		 252 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  63.4 
 
 		 264 aa  308  5.9999999999999995e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  62.4 
 
 		 455 aa  307  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  63.37 
 
 		 258 aa  307  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  62.66 
 
 		 253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  59.06 
 
 		 264 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  64.94 
 
 		 255 aa  303  1.0000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  63.45 
 
 		 262 aa  301  5.000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  63.95 
 
 		 255 aa  301  8.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  60.42 
 
 		 291 aa  299  4e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  61.16 
 
 		 255 aa  296  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  61.64 
 
 		 279 aa  296  2e-79  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  59.41 
 
 		 255 aa  296  2e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  60.83 
 
 		 266 aa  296  3e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  67.25 
 
 		 257 aa  295  4e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  61.25 
 
 		 256 aa  295  4e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  62.39 
 
 		 253 aa  295  5e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  59.92 
 
 		 277 aa  293  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  59.32 
 
 		 259 aa  292  3e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  62.56 
 
 		 445 aa  289  3e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  62.34 
 
 		 245 aa  285  5e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  64.52 
 
 		 250 aa  281  7.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  61.67 
 
 		 244 aa  279  3e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  60.8 
 
 		 258 aa  277  1e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  58.58 
 
 		 247 aa  273  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  56.72 
 
 		 288 aa  271  7e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  59.13 
 
 		 293 aa  270  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  57.08 
 
 		 261 aa  269  2.9999999999999997e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  60.34 
 
 		 312 aa  266  2e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  57.63 
 
 		 302 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  58.54 
 
 		 255 aa  264  1e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  54.77 
 
 		 245 aa  260  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  57.2 
 
 		 279 aa  259  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  56.76 
 
 		 279 aa  257  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  55.83 
 
 		 277 aa  255  6e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  53.91 
 
 		 252 aa  249  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  54 
 
 		 257 aa  249  5e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  53.1 
 
 		 243 aa  245  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  52.85 
 
 		 266 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  52.99 
 
 		 256 aa  244  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  52.74 
 
 		 269 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  53.59 
 
 		 244 aa  239  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  54.39 
 
 		 255 aa  238  5.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  54.94 
 
 		 249 aa  238  8e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  47.71 
 
 		 253 aa  236  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  52.61 
 
 		 255 aa  235  6e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  49.08 
 
 		 228 aa  234  8e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  46.9 
 
 		 240 aa  231  6e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  54.31 
 
 		 241 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  55.5 
 
 		 243 aa  230  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  48.4 
 
 		 230 aa  229  2e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  52.38 
 
 		 248 aa  230  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  48.67 
 
 		 240 aa  228  5e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  52.86 
 
 		 239 aa  226  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  52.38 
 
 		 272 aa  226  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  48.85 
 
 		 225 aa  225  5.0000000000000005e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  49.16 
 
 		 271 aa  224  7e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  51.53 
 
 		 233 aa  221  7e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  48.15 
 
 		 225 aa  221  9e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  47.51 
 
 		 230 aa  219  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  46.4 
 
 		 226 aa  219  3e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  49.78 
 
 		 240 aa  219  3e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  47.19 
 
 		 246 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  47.79 
 
 		 229 aa  219  5e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  45.91 
 
 		 227 aa  219  5e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  51.54 
 
 		 233 aa  218  6e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  44.96 
 
 		 241 aa  216  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  55.91 
 
 		 249 aa  216  4e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  48.4 
 
 		 228 aa  215  7e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  48.2 
 
 		 237 aa  215  7e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  45.97 
 
 		 248 aa  214  8e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  46.67 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  47.27 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  54.5 
 
 		 224 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  50 
 
 		 238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  49.77 
 
 		 229 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0908  ABC transporter related  46.58 
 
 		 235 aa  213  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  50.21 
 
 		 653 aa  212  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  44.44 
 
 		 248 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  47.95 
 
 		 228 aa  211  7e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  49.32 
 
 		 225 aa  211  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2247  ABC transporter related protein  48.97 
 
 		 247 aa  210  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.687068  normal  0.0553292 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  51.29 
 
 		 269 aa  211  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0459464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  45.74 
 
 		 238 aa  210  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  46.58 
 
 		 228 aa  209  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  48.62 
 
 		 225 aa  209  3e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  47.93 
 
 		 239 aa  209  5e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  48.15 
 
 		 224 aa  209  5e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>