More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2697 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  100 
 
 		 279 aa  559  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  66.4 
 
 		 269 aa  337  9e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  63.6 
 
 		 252 aa  304  9.000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  64.02 
 
 		 243 aa  303  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  62.08 
 
 		 247 aa  295  6e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  61.32 
 
 		 256 aa  290  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  59.75 
 
 		 455 aa  288  5.0000000000000004e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  60.74 
 
 		 266 aa  288  7e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  62.55 
 
 		 245 aa  285  8e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  61 
 
 		 249 aa  280  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  58.52 
 
 		 264 aa  276  3e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  62.28 
 
 		 256 aa  275  4e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  59.58 
 
 		 244 aa  275  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  59.23 
 
 		 280 aa  275  5e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  60 
 
 		 255 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  55.69 
 
 		 252 aa  272  6e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  57.85 
 
 		 258 aa  270  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  59.57 
 
 		 255 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  57.46 
 
 		 291 aa  269  4e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  57.85 
 
 		 277 aa  267  1e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  59.21 
 
 		 255 aa  266  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  52.12 
 
 		 262 aa  267  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  56.1 
 
 		 253 aa  266  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  59.47 
 
 		 445 aa  266  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  58.75 
 
 		 250 aa  266  2.9999999999999995e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  62.83 
 
 		 257 aa  265  4e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  55.04 
 
 		 259 aa  265  7e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  59.03 
 
 		 244 aa  265  8.999999999999999e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  62.87 
 
 		 277 aa  264  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  59.23 
 
 		 268 aa  264  1e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  57.56 
 
 		 274 aa  262  4e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  57.02 
 
 		 263 aa  262  4e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  57.61 
 
 		 243 aa  261  6.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  55.6 
 
 		 253 aa  261  8.999999999999999e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  54.39 
 
 		 279 aa  261  1e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  57.2 
 
 		 258 aa  259  3e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  53.54 
 
 		 277 aa  257  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  55.65 
 
 		 256 aa  258  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  57.59 
 
 		 271 aa  258  1e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  57.38 
 
 		 258 aa  256  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  56.33 
 
 		 258 aa  255  6e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  56.12 
 
 		 247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  58.72 
 
 		 250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  54.73 
 
 		 264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  58.22 
 
 		 253 aa  253  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  55.51 
 
 		 255 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  55.92 
 
 		 271 aa  251  8.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  52.1 
 
 		 266 aa  251  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  61.18 
 
 		 241 aa  250  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  57.45 
 
 		 258 aa  250  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  53.42 
 
 		 288 aa  248  7e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4805  ABC transporter related protein  62.76 
 
 		 249 aa  247  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  56.33 
 
 		 245 aa  245  6e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  57.46 
 
 		 255 aa  245  8e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  61.19 
 
 		 224 aa  244  9e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  56.39 
 
 		 272 aa  244  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  54.77 
 
 		 312 aa  243  3e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  57.53 
 
 		 248 aa  234  8e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  52.19 
 
 		 261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  49.1 
 
 		 228 aa  232  5e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  51.25 
 
 		 293 aa  232  5e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  52.74 
 
 		 255 aa  231  9e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  53.19 
 
 		 302 aa  231  1e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  57.08 
 
 		 249 aa  227  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  47.75 
 
 		 230 aa  225  6e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  49.81 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  54.01 
 
 		 269 aa  222  4e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0459464  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  50.83 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2247  ABC transporter related protein  54.81 
 
 		 247 aa  220  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.687068  normal  0.0553292 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  48.4 
 
 		 227 aa  219  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  44.59 
 
 		 226 aa  218  1e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  50.62 
 
 		 279 aa  215  5.9999999999999996e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  48.86 
 
 		 229 aa  215  8e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  44.75 
 
 		 227 aa  211  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2457  ABC transporter related protein  52.59 
 
 		 247 aa  210  3e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0887865  hitchhiker  0.00000290657 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2703  ABC transporter related  45.29 
 
 		 255 aa  210  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  50.21 
 
 		 239 aa  209  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  47.95 
 
 		 225 aa  208  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  46.75 
 
 		 236 aa  206  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  47.51 
 
 		 229 aa  207  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  49.54 
 
 		 228 aa  207  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  45.25 
 
 		 225 aa  206  4e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  48.62 
 
 		 228 aa  205  5e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1518  ABC transporter-related protein  49.78 
 
 		 228 aa  205  8e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2827  ABC transporter related  47.16 
 
 		 243 aa  204  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1657  ABC transporter related  50.67 
 
 		 258 aa  203  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  49.06 
 
 		 233 aa  204  2e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  44 
 
 		 240 aa  202  3e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  46.29 
 
 		 252 aa  202  4e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  43.98 
 
 		 247 aa  202  7e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6488  ABC transporter related protein  50.45 
 
 		 246 aa  201  8e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  44.25 
 
 		 238 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  45.73 
 
 		 237 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3270  ABC transporter-like protein  44.73 
 
 		 248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.180128 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  39.09 
 
 		 248 aa  200  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  45.58 
 
 		 240 aa  199  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  45.92 
 
 		 266 aa  200  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1694  peptide ABC transporter ATPase  44.39 
 
 		 248 aa  199  3.9999999999999996e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000011753  unclonable  4.03836e-28 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3418  ABC transporter-related protein  44.54 
 
 		 266 aa  199  5e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0483067  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  47.58 
 
 		 230 aa  199  5e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>